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苹果基因组中F-box基因家族的鉴定及分析

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
1 前言第11-26页
   ·泛素酶体系统第11-13页
     ·泛素酶体系统概述第11页
     ·泛素激活酶E1第11-12页
     ·泛素结合酶E2第12页
     ·泛素连接酶E3第12-13页
     ·去泛素化酶DUB第13页
   ·F-box基因家族第13-18页
     ·F-box蛋白发现及命名第13-14页
     ·F-box蛋白结构第14页
     ·F-box蛋白功能第14-16页
       ·F-box蛋白与花器官发育第14-15页
       ·F-box蛋白与生命节律第15页
       ·F-box蛋白与植物光形态发生第15页
       ·F-box蛋白参与激素信号转导第15-16页
     ·F-box基因家族在基因组学中的研究进展第16-18页
   ·基因组学研究进展第18-20页
     ·基因组学研究方法第18-19页
     ·苹果基因组学研究进展第19-20页
   ·基因表达量研究方法第20-23页
     ·Northern杂交技术第20-21页
     ·实时荧光定量PCR技术第21页
     ·高通量技术第21-22页
     ·GEO基因表达量数据库第22-23页
   ·生物信息学研究进展第23-25页
     ·生物信息学概述第23-24页
     ·生物信息学研究内容第24页
       ·生物信息学数据库第24页
       ·生物信息学对算法的开发应用第24页
       ·生物数据分析第24页
     ·隐马尔可夫在生物信息学中的应用第24-25页
   ·本实验的目的意义第25-26页
2 材料与方法第26-36页
   ·实验材料第26-29页
     ·植物材料及处理第26页
     ·酶与各种试剂第26页
     ·实验器材第26页
     ·引物第26页
     ·软件和数据库资源第26-29页
   ·主要试剂的配制第29-30页
     ·实验相关试剂溶液的配制第29-30页
       ·CTAB法提取植物RNA提取液的配置第29页
       ·MS培养基母液的配置第29-30页
       ·50×TAE电泳缓冲液的配制第30页
     ·MS0基本培养基配制第30页
     ·生芽MS基本培养基配制第30页
   ·实验方法第30-36页
     ·苹果组培苗获得第30-31页
     ·苹果F-box基因组中F-box基因的鉴定第31页
       ·本地BLAST鉴定F-box基因第31页
       ·利用隐马尔可夫模型鉴定F-box基因第31页
     ·F-box蛋白中功能结构域的鉴定第31页
     ·Sequence logo的获得第31页
     ·染色体定位信息及倍增分析第31-32页
     ·F-box基因器官特异性表达分析第32页
     ·F-box基因在苹果成熟过程中表达分析第32-33页
     ·实时荧光定量PCR第33-36页
       ·苹果叶片总RNA的提取第33页
       ·RNA的纯度、浓度及完整性检测第33-34页
       ·RNA反转录第34页
       ·实时荧光定量PCR第34-35页
       ·引物质量检测第35-36页
3 结果与分析第36-51页
   ·苹果基因组中F-box基因家族的鉴定第36页
   ·苹果F-box基因家族中功能结构域的鉴定第36-38页
   ·苹果F-box蛋白中F-box结构域序列特征分析第38-40页
   ·苹果F-box基因家族在染色体上的定位第40-41页
   ·苹果F-box基因家族器官特异性表达分析第41-48页
     ·苹果F-box基因家族器官特异性表达分析第41-47页
     ·编码半乳糖氧化酶结构域的F-box基因器官特异性表达第47-48页
   ·苹果F-box基因参与到果实成熟及非生物胁迫抵抗过程第48-51页
4 讨论第51-54页
5 结论第54-55页
参考文献第55-64页
附录第64-73页
致谢第73-74页
攻读学位期间发表论文情况第74页

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