| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 中文文摘 | 第6-13页 |
| 绪论 | 第13-23页 |
| 1 研究背景 | 第13-15页 |
| ·甘蔗的遗传多样性 | 第13-14页 |
| ·能源甘蔗的研究进展 | 第14页 |
| ·甘蔗与高粱基因组结构的共线性 | 第14-15页 |
| 2 纤维素生物合成研究进展 | 第15-17页 |
| ·纤维素概述 | 第15-16页 |
| ·植物纤维素合成途径研究 | 第16-17页 |
| 3 植物纤维素合酶基因超家族研究进展 | 第17-21页 |
| ·植物纤维素合酶基因的发现 | 第17页 |
| ·纤维素合酶基因结构 | 第17-18页 |
| ·纤维素合酶基因家族的功能研究 | 第18-20页 |
| ·类纤维素合酶基因家族 | 第20-21页 |
| ·类纤维素合酶基因家族的功能研究 | 第21页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第一章 甘蔗纤维素合酶基因超家族的鉴定与进化 | 第23-49页 |
| 第一节 前言 | 第23页 |
| 第二节 材料与试剂 | 第23-24页 |
| ·植物材料与BAC文库 | 第23页 |
| ·试剂和仪器 | 第23-24页 |
| ·试剂 | 第23-24页 |
| ·仪器 | 第24页 |
| 第三节 实验方法 | 第24-28页 |
| ·比较基因组学预测甘蔗纤维素合酶基因超家族 | 第24页 |
| ·BAC杂交探针引物设计 | 第24-26页 |
| ·甘蔗叶片基因组DNA的提取(CTAB法) | 第26-27页 |
| ·甘蔗叶片基因组DNA的提取 | 第26页 |
| ·甘蔗基因组DNA检测 | 第26-27页 |
| ·BAC杂交探针的PCR扩增 | 第27页 |
| ·从PCR反应液中回收DNA与测序 | 第27页 |
| ·目的基因甘蔗BAC文库的筛选和测序 | 第27页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族的注释 | 第27-28页 |
| ·纤维素合酶基因超家族系统进化树的建立 | 第28页 |
| ·利用KaKs_Calculator 2.0计算Ka/Ks | 第28页 |
| 第四节 结果与分析 | 第28-46页 |
| ·拟南芥、葡萄、水稻、玉米和高粱纤维素合酶基因超家族 | 第28-36页 |
| ·拟南芥纤维素合酶基因超家族 | 第28-30页 |
| ·葡萄纤维素合酶基因超家族 | 第30-32页 |
| ·水稻纤维素合酶基因超家族 | 第32-33页 |
| ·玉米纤维素合酶基因超家族 | 第33-35页 |
| ·高粱纤维素合酶基因超家族 | 第35-36页 |
| ·甘蔗叶片基因组DNA的提取 | 第36-37页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族BAC杂交探针的PCR扩增 | 第37-39页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族的系统发育分析 | 第39-42页 |
| ·高粱和甘蔗纤维素合酶基因超家族比较 | 第39-41页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族的进化和基因组结构分析 | 第41-42页 |
| ·纤维素合酶基因超家族的系统发育的分析 | 第42-45页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族的Ka/Ks分析 | 第45-46页 |
| 第五节 讨论 | 第46-47页 |
| 第六节 小结 | 第47-49页 |
| 第二章 甘蔗纤维素合酶基因超家族的表达分析 | 第49-59页 |
| 第一节 前言 | 第49页 |
| 第二节 材料与试剂 | 第49-50页 |
| ·植物材料 | 第49页 |
| ·试剂和仪器 | 第49-50页 |
| ·试剂 | 第49-50页 |
| ·仪器 | 第50页 |
| 第三节 实验方法 | 第50-52页 |
| ·甘蔗组织总RNA的提取 | 第50-51页 |
| ·总RNA的初提 | 第50页 |
| ·RNA样品的消化 | 第50-51页 |
| ·RNA重新抽提 | 第51页 |
| ·RNA样品检测 | 第51页 |
| ·甘蔗RNA文库 | 第51-52页 |
| ·甘蔗RNA-seq定量分析 | 第52页 |
| 第四节 结果与分析 | 第52-56页 |
| ·甘蔗总RNA提取及质量检测 | 第52-53页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因超家族的共表达分析 | 第53-56页 |
| 第五节 讨论 | 第56-57页 |
| 第六节 小结 | 第57-59页 |
| 第三章 拟南芥纤维素合酶基因家族突变体的鉴定 | 第59-79页 |
| 第一节 前言 | 第59页 |
| 第二节 材料与试剂 | 第59-60页 |
| ·植物材料 | 第59-60页 |
| ·试剂和仪器 | 第60页 |
| ·试剂 | 第60页 |
| ·仪器 | 第60页 |
| 第三节 实验方法 | 第60-65页 |
| ·拟南芥T-DNA突变体的查找 | 第60-61页 |
| ·拟南芥T-DNA插入突变体鉴定策略 | 第61页 |
| ·引物设计与合成 | 第61-62页 |
| ·拟南芥突变体基因组DNA的提取 | 第62-63页 |
| ·拟南芥突变体石蜡切片 | 第63-65页 |
| ·材料固定 | 第63页 |
| ·洗涤 | 第63页 |
| ·脱水和脱乙醇 | 第63页 |
| ·埋蜡 | 第63-64页 |
| ·包埋 | 第64页 |
| ·切片 | 第64页 |
| ·染色 | 第64-65页 |
| 第四节 结果与分析 | 第65-77页 |
| ·拟南芥CesA基因家族的T-DNA突变体 | 第65页 |
| ·拟南芥CesA基因家族纯合突变体的筛选 | 第65-70页 |
| ·拟南芥SALK_084627纯合突变体的筛选 | 第65-67页 |
| ·拟南芥CS478543纯合突变体的筛选 | 第67-68页 |
| ·拟南芥CS435107纯合突变体的筛选 | 第68-70页 |
| ·拟南芥CesA基因家族纯合突变体的表型观察 | 第70-76页 |
| ·拟南芥SALK_084627纯合突变体的表型观察 | 第70-72页 |
| ·拟南芥CS478543纯合突变体的表型观察 | 第72-74页 |
| ·拟南芥CS435107纯合突变体的表型观察 | 第74-76页 |
| ·拟南芥CesA基因家族纯合突变体的石蜡切片 | 第76-77页 |
| 第五节 讨论 | 第77-78页 |
| 第六节 小结 | 第78-79页 |
| 第四章 甘蔗纤维素合酶基因家族的遗传转化 | 第79-89页 |
| 第一节 前言 | 第79页 |
| 第二节 材料与试剂 | 第79-80页 |
| ·植物材料 | 第79页 |
| ·试剂和仪器 | 第79-80页 |
| ·试剂 | 第79页 |
| ·仪器 | 第79-80页 |
| 第三节 实验方法 | 第80-83页 |
| ·甘蔗CesA基因家族的cDNA克隆和启动子引物设计 | 第80-81页 |
| ·Gateway技术 | 第81-82页 |
| ·BP反应 | 第81页 |
| ·转化大肠杆菌DH5a感受态细胞 | 第81页 |
| ·LR反应 | 第81-82页 |
| ·转化大肠杆菌DH5a感受态细胞 | 第82页 |
| ·质粒提取 | 第82页 |
| ·转化根癌农杆菌 | 第82页 |
| ·农杆菌蘸花转化拟南芥法 | 第82-83页 |
| 第四节 结果与分析 | 第83-87页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因载体构建 | 第83-84页 |
| ·甘蔗纤维素合酶基因的cDNA克隆和启动子克隆 | 第84-85页 |
| ·BP反应和转化大肠杆菌DH5a感受态细胞 | 第85-86页 |
| ·LR反应和转化大肠杆菌DH5a感受态细胞 | 第86页 |
| ·转化根癌农杆菌 | 第86-87页 |
| 第五节 讨论 | 第87-88页 |
| 第六节 小结 | 第88-89页 |
| 第五章 结论 | 第89-91页 |
| 附录1 名词缩写表 | 第91-93页 |
| 附录2 常用试剂、溶液配方 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-105页 |
| 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第105-107页 |
| 致谢 | 第107-109页 |
| 个人简历 | 第109-111页 |
