香蕉束顶病毒（BBTV）DNA-U3序列多态性及转录特征
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 1 前言 | 第10-19页 |
| ·香蕉束顶病毒研究进展 | 第10-15页 |
| ·香蕉束顶病的生物学特征 | 第10-11页 |
| ·香蕉束顶病的诊断和防治技术 | 第11-12页 |
| ·香蕉束顶病毒的分类地位及特征 | 第12页 |
| ·BBTV基因组结构特征 | 第12-14页 |
| ·BBTV的复制与转录 | 第14-15页 |
| ·病毒基因组重组研究进展 | 第15-16页 |
| ·重组在病毒起源与进化中的意义 | 第15页 |
| ·病毒重组研究进展 | 第15-16页 |
| ·转录组测序技术在病毒学上的应用 | 第16页 |
| ·转录组测序原理 | 第16页 |
| ·转录组测序在病毒研究方面的应用 | 第16页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第16-18页 |
| ·本研究的技术路线 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-29页 |
| ·材料 | 第19-20页 |
| ·植物材料 | 第19-20页 |
| ·菌株及质粒载体 | 第20页 |
| ·酶及试剂 | 第20页 |
| ·主要仪器设备 | 第20页 |
| ·数据分析软件 | 第20页 |
| ·方法 | 第20-29页 |
| ·引物设计 | 第20-21页 |
| ·香蕉总DNA提取 | 第21页 |
| ·DNA-U3和DNA-N全长扩增 | 第21-22页 |
| ·胶回收 | 第22页 |
| ·连接 | 第22页 |
| ·转化 | 第22页 |
| ·阳性克隆的筛选鉴定 | 第22-23页 |
| ·测序 | 第23页 |
| ·质粒提取 | 第23页 |
| ·改良的3%CTAB法提取香蕉总RNA | 第23页 |
| ·DNase Ⅰ消化总RNA中的基因组DNA | 第23-24页 |
| ·RACE引物设计 | 第24页 |
| ·RACE反转录 | 第24-25页 |
| ·第一链cDNA合成 | 第25页 |
| ·5'RACE巢式PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·5'RACE Inner反应液PCR扩增 | 第26页 |
| ·YRACE扩增 | 第26页 |
| ·转录组文库制备 | 第26-27页 |
| ·DNA-N酶切鉴别 | 第27-28页 |
| ·DNA-U3重组率测定 | 第28页 |
| ·系统进化树的构建 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-39页 |
| ·DNA-U3的序列多态性分析 | 第29-31页 |
| ·疑似感染BBTV样品的检测和测序 | 第29页 |
| ·海南分离物DNA-U3在国际上的分类地位 | 第29-31页 |
| ·DNA-U3的重组分析 | 第31-33页 |
| ·HK002 DNA-U3多态性分析 | 第31页 |
| ·HK002 DNA-U3组分内重组分析 | 第31-32页 |
| ·HK002 DNA-N酶切 | 第32-33页 |
| ·DNA-U3重组率测定 | 第33页 |
| ·BBTV侵染香蕉的转录组测序 | 第33-36页 |
| ·转录组测序样品的选择 | 第33-34页 |
| ·总RNA质量 | 第34页 |
| ·病毒转录组序列拼接 | 第34-35页 |
| ·DNA-U3转录组数据定位分析 | 第35页 |
| ·转录组测序结果验证 | 第35-36页 |
| ·DNA-U3 cDNA的5’和3’末端扩增 | 第36-39页 |
| ·RNA提取 | 第36页 |
| ·已知序列验证 | 第36-37页 |
| ·5'RACE PCR扩增 | 第37页 |
| ·测序分析 | 第37页 |
| ·DNA-U35'RACE结果 | 第37页 |
| ·3'RACE实验扩增结果 | 第37-38页 |
| ·DNA-U3转录结果 | 第38页 |
| ·5'RACE序列验证 | 第38-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| ·BBTV DNA-U3过环转录的意义 | 第39-40页 |
| ·DNA-U3单向重组的意义 | 第40-41页 |
| 5 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 附录 | 第46-49页 |
| 项目资助 | 第49-50页 |
| 攻读硕士期间发表或者待发表的文章 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
