| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 縮略词 | 第15-16页 |
| 引言 | 第16-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-36页 |
| 1 EST序列分析 | 第18-22页 |
| ·EST技术的原理 | 第18页 |
| ·EST技术的形成与发展 | 第18-19页 |
| ·EST的应用 | 第19-22页 |
| 2 基因芯片及其应用 | 第22-27页 |
| ·基因芯片原理 | 第22-23页 |
| ·芯片流程及制备方法 | 第23页 |
| ·基因芯片类型 | 第23-24页 |
| ·基因芯片应用 | 第24-27页 |
| 3 生殖隔离与物种形成 | 第27-36页 |
| ·微进化与物种形成 | 第27页 |
| ·隔离在物种形成中的作用 | 第27-30页 |
| ·生殖隔离、地理隔离在植物物种形成过程中的作用 | 第30-32页 |
| ·开展杏、梅微进化研究的意义 | 第32-36页 |
| 第二章 梅cDNA文库构建、EST序列分析及EST-SSR标记开发 | 第36-78页 |
| 第一节 梅的花与果实cDNA文库的构建与检测 | 第36-47页 |
| 摘要 | 第36页 |
| Abstract | 第36-37页 |
| 1 材料与方法 | 第37-43页 |
| ·实验材料 | 第37-38页 |
| ·试剂及耗材 | 第38页 |
| ·方法 | 第38-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-45页 |
| ·总RNA质量检测 | 第43-44页 |
| ·cDNA合成质量的鉴定 | 第44页 |
| ·cDNA文库的质量鉴定 | 第44-45页 |
| 3 讨论 | 第45-47页 |
| 第二节 梅的花与果实cDNA文库测序及EST序列分析 | 第47-59页 |
| 摘要 | 第47页 |
| Abstract | 第47-48页 |
| 1 材料与方法 | 第48-50页 |
| ·实验材料 | 第48页 |
| ·cDNA克隆的大规模EST测序 | 第48页 |
| ·EST序列处理分析 | 第48-49页 |
| ·梅EST序列与桃和杏EST数据库比对 | 第49-50页 |
| 2 结果与分析 | 第50-57页 |
| ·cDNA序列测定及EST序列获得 | 第50-52页 |
| ·梅EST序列功能注释与分类 | 第52-53页 |
| ·Unigene的COG分类 | 第53-56页 |
| ·梅EST序列与桃、杏同源性比对结果 | 第56-57页 |
| 3 讨论 | 第57-59页 |
| 第三节 梅EST-SSR标记的开发与利用 | 第59-78页 |
| 摘要 | 第59页 |
| Abstract | 第59-61页 |
| 1 材料和方法 | 第61-65页 |
| ·材料 | 第61-62页 |
| ·方法 | 第62-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-74页 |
| ·梅EST-SSRs的分布、频率和特点 | 第65-69页 |
| ·EST-SSR引物的验证 | 第69页 |
| ·梅EST-SSR标记的转换应用 | 第69-70页 |
| ·梅和杏EST-SSR的PCR产物特点 | 第70-71页 |
| ·遗传多样性分析 | 第71-74页 |
| 3 讨论 | 第74-78页 |
| 第三章 基于基因芯片分析梅与杏果实发育相关差异表达基因的研究 | 第78-106页 |
| 摘要 | 第78页 |
| Abstract | 第78-81页 |
| 1 材料与方法 | 第81-86页 |
| ·植物材料 | 第81-82页 |
| ·试剂及耗材 | 第82页 |
| ·引物合成 | 第82-83页 |
| ·方法 | 第83-86页 |
| 2 结果 | 第86-102页 |
| ·RNA质量 | 第86-87页 |
| ·差异表达基因数量及聚类分析 | 第87-90页 |
| ·果实发育过程中的差异表达基因功能注释及分类 | 第90-96页 |
| ·KEGG代谢途径分析 | 第96-98页 |
| ·qRT-PCR验证分析 | 第98-102页 |
| 3 讨论 | 第102-106页 |
| 第四章 梅、杏、桃EST同源序列特征分析及EST-SNP发掘 | 第106-120页 |
| 摘要 | 第106页 |
| Abstract | 第106-108页 |
| 1 材料与方法 | 第108-109页 |
| ·EST序列获得方法 | 第108页 |
| ·序列拼接及功能注释 | 第108页 |
| ·SNP发现与分类 | 第108-109页 |
| ·系统进化树构建 | 第109页 |
| 2 结果与分析 | 第109-117页 |
| ·GenBank数据库中梅、杏、桃的EST序列信息分析 | 第109页 |
| ·桃拼接EST序列的验证 | 第109-110页 |
| ·梅、杏、桃同源序列的长度和同源性分布 | 第110-112页 |
| ·梅、杏、桃序列功能分析 | 第112-113页 |
| ·梅、杏、桃同源序列的SNP特征分析 | 第113页 |
| ·同源序列碱基置换类型与Indel分析 | 第113-117页 |
| ·基于SNP位点的遗传差异分析 | 第117页 |
| 3 讨论 | 第117-120页 |
| 第五章 基于SNP标记果梅与花梅的遗传关系分析 | 第120-136页 |
| 摘要 | 第120页 |
| Abstract | 第120-123页 |
| 1 材料与方法 | 第123-129页 |
| ·植物材料 | 第123-125页 |
| ·化学试剂、酶制剂及试剂盒 | 第125页 |
| ·方法 | 第125-127页 |
| ·SNP鉴定的特异引物及PCR扩增 | 第127-129页 |
| ·SNP的查找 | 第129页 |
| ·数据分析 | 第129页 |
| 2 结果与分析 | 第129-134页 |
| ·DNA的提取 | 第129页 |
| ·SNP发现和频率 | 第129-130页 |
| ·SNP位点多态性 | 第130-131页 |
| ·基于SNP位点的遗传变异分析 | 第131-134页 |
| 3 讨论 | 第134-136页 |
| 第六章 梅、杏合子前生殖隔离的初步证据 | 第136-162页 |
| 摘要 | 第136页 |
| Abstract | 第136-139页 |
| 1 材料与方法 | 第139-146页 |
| ·植物材料 | 第139-143页 |
| ·试剂及耗材 | 第143页 |
| ·方法 | 第143-146页 |
| 2 结果 | 第146-159页 |
| ·梅、杏地理分布及开花物候期调查 | 第146-152页 |
| ·杏梅形成以及梅、杏种间生殖隔离的分子证据 | 第152-154页 |
| ·利用杏×梅F_2代验证杏梅的起源 | 第154-155页 |
| ·杏和梅两个特异片段的特征分析 | 第155-159页 |
| 3 讨论 | 第159-162页 |
| 全文结论 | 第162-164页 |
| 主要创新点 | 第164-166页 |
| 参考文献 | 第166-188页 |
| 附录1 本文中常用试剂及培养基的配置 | 第188-190页 |
| 附录2 感受态细胞制备 | 第190-192页 |
| 攻读博士学位期间发表论文及获奖情况 | 第192-194页 |
| 致谢 | 第194页 |
