| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第1章 绪论分子系统地理学的研究方法介绍以及其在鱼类中的应用 | 第13-25页 |
| ·分子系统地理学研究方法的介绍 | 第13-17页 |
| ·种下水平物种的五种系统地理学分布模式 | 第13-14页 |
| ·分子系统地理学理论基础和研究方法 | 第14-15页 |
| ·常用的构建分子系统发育树的方法 | 第15-17页 |
| ·鱼类系统地理学研究综述 | 第17-22页 |
| ·人工选择与家养动物驯化历史中的瓶颈作用 | 第22-25页 |
| 第2章 欧亚鲫属(Carassius)的系统地理格局 | 第25-71页 |
| ·前言 | 第25-27页 |
| ·东亚古地质气候环境变化 | 第25-26页 |
| ·鲫鱼研究 | 第26-27页 |
| ·材料和方法 | 第27-37页 |
| ·材料 | 第27-31页 |
| ·实验方法 | 第31-34页 |
| ·数据分析方法 | 第34-37页 |
| ·结果 | 第37-64页 |
| ·序列变异 | 第37-49页 |
| ·对CR区、Cytb基因和合并数据进行系统发育分析的结果 | 第49-56页 |
| ·鲫属(Carassius)各类群分歧时间的估算 | 第56-58页 |
| ·鲫属(Carassius)的群体分层情况和群体大小动态变化 | 第58-64页 |
| ·讨论 | 第64-69页 |
| ·欧亚鲫属(Carassius)地理格局 | 第64-65页 |
| ·中国大陆和日本本岛鲫属(Carassius)群体间的地理隔离事件 | 第65-66页 |
| ·中国大陆鲫属(Carassius)群体大小变化的历史动态 | 第66-67页 |
| ·东亚鲫属(Carassius)在冰期的避难所和扩散路径 | 第67-69页 |
| ·小结 | 第69-71页 |
| 第3章 鲫属(Carassius)系统发育关系的研究 | 第71-91页 |
| ·研究背景 | 第71-73页 |
| ·材料和方法 | 第73-77页 |
| ·材料 | 第73-74页 |
| ·实验方法 | 第74-76页 |
| ·数据分析方法 | 第76-77页 |
| ·结果 | 第77-87页 |
| ·序列变异 | 第77-78页 |
| ·鲫属(Carassius)系统发育关系的构建 | 第78-83页 |
| ·鲫属(Carassius)各类群分歧时间的估算 | 第83-85页 |
| ·鲫属(Carassius)各类群遗传距离的估算 | 第85-87页 |
| ·讨论 | 第87-89页 |
| ·鲫属(Carassius)各类群间系统发育关系 | 第87-88页 |
| ·中国各地方群体和鲫属(Carassius)各(亚)种间的系统发育关系 | 第88页 |
| ·鲫属(Carassius)各类群分歧顺序和时间的估算 | 第88-89页 |
| ·小结 | 第89-91页 |
| 第4章 金鱼的起源 | 第91-111页 |
| ·前言 | 第91-93页 |
| ·材料和方法 | 第93-97页 |
| ·材料 | 第93-94页 |
| ·实验方法 | 第94-95页 |
| ·数据分析方法 | 第95-97页 |
| ·结果 | 第97-107页 |
| ·序列变异 | 第97-98页 |
| ·系统发育关系的构建 | 第98-100页 |
| ·各野生鲫鱼群体和金鱼间遗传分歧 | 第100-103页 |
| ·各野生鲫鱼群体和金鱼各品系的遗传多样性 | 第103-104页 |
| ·中性检验的结果 | 第104-105页 |
| ·对中国金鱼4个品系分类形态特征的评估 | 第105-107页 |
| ·讨论 | 第107-109页 |
| ·金鱼的祖先和可能的驯化地 | 第107-108页 |
| ·金鱼的家养化历程 | 第108-109页 |
| ·三分法和驯化历史 | 第109页 |
| ·小结 | 第109-111页 |
| 第5章 总结和展望 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-125页 |
| 附录1 | 第125-131页 |
| 致谢 | 第131-133页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第133页 |
