| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-26页 |
| ·橡胶树概况 | 第9页 |
| ·国内天然橡胶供需矛盾 | 第9-10页 |
| ·橡胶树分子生物学研究进展 | 第10-15页 |
| ·构建遗传图谱方面 | 第10页 |
| ·橡胶树基因克隆 | 第10-11页 |
| ·橡胶树文库构建 | 第11-14页 |
| ·基因与蛋白功能组学 | 第14-15页 |
| ·植物基因富集技术研究进展 | 第15-21页 |
| ·基因富集的意义 | 第15页 |
| ·基因富集的方法 | 第15-21页 |
| ·甲基化过滤文库法在橡胶树中的应用 | 第21页 |
| ·生物信息学研究进展 | 第21-24页 |
| ·生物信息学简介 | 第21-22页 |
| ·生物信息学研究内容 | 第22-24页 |
| ·研究目的及意义 | 第24-26页 |
| 2 橡胶树甲基化过滤文库的构建 | 第26-37页 |
| ·技术路线 | 第26页 |
| ·实验材料 | 第26-27页 |
| ·植物材料 | 第26页 |
| ·所需主要试剂 | 第26-27页 |
| ·主要试剂的配制 | 第27页 |
| ·主要仪器设备 | 第27页 |
| ·试验方法 | 第27-32页 |
| ·高质量核DNA的制备 | 第27-28页 |
| ·DNA片段化及回收 | 第28页 |
| ·连接与转化 | 第28-30页 |
| ·文库扩增 | 第30页 |
| ·阳性克隆鉴定及插入大小的检测 | 第30-31页 |
| ·克隆的挑取与保存 | 第31页 |
| ·测序 | 第31-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-34页 |
| ·基因组总核DNA的鉴定 | 第32页 |
| ·基因组总核DNA用超声波切断处理及切胶回收 | 第32-33页 |
| ·基因组文库滴度检测及库容量计算 | 第33-34页 |
| ·插入片段大小及阳性克隆率的检测结果 | 第34页 |
| ·克隆稳定性的检测结果 | 第34页 |
| ·讨论 | 第34-36页 |
| ·核DNA分离是甲基化文库构建的关键步骤 | 第34-35页 |
| ·DNA断裂方式的选择 | 第35页 |
| ·断裂片段大小的选择 | 第35页 |
| ·菌株的选择 | 第35页 |
| ·连接转化效率的保证 | 第35页 |
| ·文库的保存方法比较 | 第35-36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 3 橡胶树基因组甲基化过滤文库大规模测序和生物信息学分析 | 第37-45页 |
| ·技术路线 | 第37-38页 |
| ·本地化生物信息学平台构建 | 第38-40页 |
| ·硬件配置与Linux操作系统的安装 | 第38页 |
| ·相关程序的获取与安装 | 第38页 |
| ·构建本地化Blast数据库 | 第38-39页 |
| ·数据处理过程及Blast分析自动化 | 第39-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-43页 |
| ·测序数据的初步处理结果 | 第40-41页 |
| ·Blast注释结果 | 第41-42页 |
| ·序列同源分析结果 | 第42-43页 |
| ·讨论 | 第43-44页 |
| ·聚类前处理 | 第43-44页 |
| ·序列拼接 | 第44页 |
| ·功能注释 | 第44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-53页 |
| 附录 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |