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猪横纹肌高表达新基因的克隆、定位、表达谱分析及SNPs与经济性状和肌纤维性状的关系研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
1 文献综述第13-23页
   ·研究问题的由来第13页
   ·猪肌肉品质的相关研究第13-16页
     ·肌纤维性状及其与肉质的关系第13-14页
     ·影响肉质的其他主要性状第14-16页
       ·pH值(pH value)第14-15页
       ·肉色(meat color)第15页
       ·嫩度(tenderness)第15页
       ·系水力(water-holding capacity,WHC)第15-16页
       ·风味(navor)第16页
   ·猪肌肉品质相关候选基因研究进展第16-19页
     ·肌纤维生长发育候选基因的研究进展第16-18页
       ·MyoD家族第16-17页
       ·肌肉生长抑素(Myostatin)第17页
       ·钙蛋白抑制蛋白(CAST)第17-18页
     ·其他相关候选基因的研究进展第18-19页
       ·氟烷基因第18页
       ·酸肉基因第18页
       ·影响肌内脂肪含量的基因第18-19页
   ·基于EST的新基因分离方法第19-20页
     ·依据第19页
     ·表达序列标签(EST)第19页
     ·基因的电子克隆第19-20页
   ·研究的四个基因的进展第20-23页
     ·MARPs(肌肉锚定重复蛋白家族)第20-21页
       ·ANKRD1(锚定重复蛋白1)第20页
       ·ANKRD2(锚定重复蛋白2)第20-21页
       ·ANKRD23(锚定重复蛋白23)第21页
     ·ASB15(Ankyrin repeat and SOCS box protein 15)第21-23页
2 研究的目的和意义第23-24页
3 材料与方法第24-37页
   ·材料第24-27页
     ·组织样品第24页
     ·DNA样品第24-25页
     ·主要试剂第25页
     ·主要试剂的配制第25-26页
     ·菌株第26页
     ·酶和试剂盒第26页
     ·主要仪器设备第26-27页
     ·主要分子生物学软件、统计软件和相关网站第27页
   ·方法第27-37页
     ·候选基因的克隆方法第27-29页
       ·EST-重叠群的构建第27页
       ·引物设计第27-28页
       ·PCR扩增条件第28页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第28-29页
     ·用RACE方法获取ANKRD2基因的全长cDNA第29-31页
     ·基因染色体定位的SCHP和IMpRH法第31-32页
       ·引物设计第31页
       ·PCR扩增分型方法第31页
       ·数据分析方法第31-32页
     ·基因组织表达谱与时期表达谱研究第32-35页
       ·总RNA的提取及检测第32-33页
       ·反转录反应(RT-PCR)第33页
       ·半定量PT-PCR进行表达谱分析第33-34页
       ·通过Real-time Q-PCR进行时期表达谱分析第34-35页
     ·基因的多态性检测方法第35页
       ·PCR反应第35页
       ·RFLP方法第35页
     ·基因多态性与性状的关联分析方法第35-36页
     ·肌纤维性状测定第36-37页
4 结果第37-58页
   ·基因的克隆与eDNA全长获取第37-40页
     ·RT-PCR扩增的结果第37页
     ·猪ANKRD2基因cDNA与氨基酸序列分析结果第37-38页
     ·猪ANKRD23基因cDNA与氨基酸序列分析结果第38-39页
     ·猪ASB15基因cDNA与氨基酸序列分析结果第39-40页
   ·基因的染色体定位结果第40-44页
     ·染色体区域定位结果第40-42页
       ·ANKRD1基因染色体区域定位结果第40-41页
       ·其它基因染色体区域定位结果第41-42页
     ·精细定位结果第42-44页
   ·基因的组织表达谱与时期表达谱结果第44-48页
     ·ANKRD1基因的组织表达谱结果第44页
     ·ANKRD2基因的组织表达谱与时期表达谱结果第44-46页
       ·半定量RT-PCR的方法进行表达谱分析第44-45页
       ·通过Real-time Q-PCR进行时期表达谱分析第45-46页
     ·ANKRD23基因的组织表达谱与时期表达谱结果第46-47页
     ·ASB15基因的组织表达谱与时期表达谱结果第47-48页
   ·猪ANKRD2基因遗传多态性检测分析结果第48-53页
     ·ANKRD2基因两个位点的多态性检测第48-49页
     ·遗传变异检测结果第49-50页
     ·基因在不同猪群中的多态性分析结果第50-53页
   ·猪ANKRD2的遗传变异与部分经济性状的关联分析结果第53-54页
   ·通城猪肌纤维形念测定结果及与其ANKRD2基因的关系研究第54-58页
     ·通城猪肌纤维形态测定结果第54-57页
     ·ANKRD2基因多态性检测分析结果第57-58页
5 讨论第58-64页
   ·关于基因的全长获取及分析第58页
   ·关于四个基因的物理定位结果第58-59页
   ·关于基因的组织及时期表达谱第59-61页
     ·通过半定量RT-PCR的方法研究基因的组织及时期表达谱第59-61页
     ·通过Real-time Q-PCR进行时期表达谱第61页
   ·关于ANKRD2基因的多态检测及性状关联分析第61-62页
     ·ANKRD2基因第五外显子的多态检测及性状关联分析第61-62页
     ·ANKRD2基因第八外显子的多态检测及性状关联分析第62页
   ·关于肌纤维形念研究第62-64页
6 小结第64-66页
   ·本研究获得的结果第64-65页
   ·本研究的创新点第65页
   ·本研究不足之处及下一步值得研究的工作第65-66页
参考文献第66-71页
附录1 缩略词表第71-72页
附录2 主要性状的中英文对照和缩写第72-73页
附录3 ANKRD2基因的mRNA序列第73-74页
附录4 ANKRD23基因的部分mRNA序列第74-76页
附录5 ASB15基因的部分mRNA序列第76-77页
在读期间发表(待发表)论文题录第77-78页
致谢第78页

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