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质膜型Ca~(2+)-ATPase基因的分离与表达研究

摘要第1-6页
Abstract第6-16页
第一章 文献综述及前言第16-40页
 1 β-氨基丁酸诱导植物抗病作用的研究进展第16-23页
   ·BABA诱导植物的抗病作用第16-18页
     ·BABA的广谱诱抗活性第16-17页
     ·BABA对植物线虫的诱抗活性第17-18页
     ·BABA与其他化合物的互作增效作用第18页
   ·BABA的使用方法及在植株体内的吸收、运转和代谢第18-20页
     ·BABA处理时间、方式及有效使用浓度第18-19页
     ·植物组织对BABA的吸收第19页
     ·BABA的运转第19-20页
     ·BABA的新陈代谢第20页
   ·BABA诱导植物抗病的生理、生化作用机制第20-22页
     ·生理屏障的产生第20页
     ·过敏反应和活性氧物质的生成第20-21页
     ·病程相关蛋白的积累第21页
     ·植物保卫素的产生第21-22页
     ·抗病信号传导途径第22页
   ·BABA结构与功能的关系第22-23页
 2 未知基因的鉴定方法第23-32页
   ·mRNA差异显示技术第23-24页
   ·代表性序列差异分析第24-25页
   ·抑制性差减杂交第25-26页
   ·基因表达系列分析第26-27页
   ·基因鉴定集成法第27-28页
   ·cDNA微阵列和基因芯片第28页
   ·cDNA-AFLP技术及其研究进展第28-32页
     ·cDNA-AFLP技术的基本原理第29页
     ·cDNA-AFLP的主要过程第29-31页
     ·cDNA-AFLP技术的特点评价第31-32页
     ·cDNA-AFLP技术的应用现状第32页
 3 植物细胞Ca~(2+)-ATPase及其在逆境信号转导中的作用第32-38页
   ·Ca~(2+)-ATPase在Ca~(2+)信号转导中的作用第32-33页
     ·Ca~(2+)信号转导的分子途径第32-33页
     ·Ca~(2+)-ATPase在Ca~(2+)信号转导中的作用第33页
   ·Ca~(2+)-ATPase的理化特性第33-35页
     ·Ca~(2+)-ATPase的类型第33页
     ·Ca~(2+)-ATPase的亚细胞定位第33-34页
     ·Ca~(2+)-ATPase的结构第34页
     ·Ca~(2+)-ATPase的分子量第34页
     ·Ca~(2+)-ATPase的生化特性第34-35页
   ·Ca~(2+)-ATPase的激活与抑制第35页
   ·Ca~(2+)-ATPase的逆境应答第35-36页
   ·Ca~(2+)-ATPase基因的克隆第36-37页
   ·存在问题与展望第37-38页
 4 本研究的目的意义与技术路线第38-40页
   ·目的意义第38-39页
   ·技术路线第39-40页
第二章 应用cDNA—AFLP技术分离番茄应答BABA诱导的植物抗病相关基因第40-60页
 1 试验材料第40-41页
   ·植物材料第40页
   ·主要生化试剂第40-41页
 2 方法第41-47页
   ·β-氨基丁酸诱导处理第41页
     ·育苗第41页
     ·BABA使用浓度的确定第41页
     ·取样第41页
   ·RNA提取第41-42页
   ·cDNA的合成第42-43页
     ·无RNase的DNase处理第42页
     ·cDNA的合成第42-43页
   ·cDNA-AFLP第43-46页
     ·模板制备第44页
     ·扩增反应第44-46页
   ·差异表达片段回收、克隆与测序第46-47页
     ·差异表达片段的回收第46页
     ·回收片段的连接转化第46-47页
     ·阳性(白斑)菌落PCR扩增鉴定与摇菌培养第47页
     ·阳性克隆的序列测定第47页
   ·生物信息学分析第47页
 3 结果与分析第47-55页
   ·植物的培育第47-48页
   ·BABA使用浓度的确定第48页
   ·RNA的提取第48页
   ·双链cDNA的合成、酶切连接和预扩增结果第48-49页
   ·cDNA-AFLP转录图谱第49-51页
   ·受BABA诱导转录上调基因片段BIF的分析第51-54页
     ·BIF的序列测定第51-52页
     ·BIF序列同源性分析第52-53页
     ·BIF序列的表达模式第53-54页
   ·受BABA诱导转录下调基因片段的分析第54-55页
 4 讨论第55-59页
   ·cDNA-AFLP技术的利用第55页
   ·序列BIF17与BABA诱导抗病性第55-56页
   ·对BABA诱导植物根部抗病分子机理的探讨第56-59页
 5 小结第59页
 6 图版第59-60页
第三章 步进PCR结合RACE方法克隆PM型Ca~(2+)—ATPase基因全长cDNA第60-83页
 1 试验材料第61页
   ·植物材料第61页
   ·主要生化试剂第61页
 2 方法第61-66页
   ·靶标基因片段BIF17的序列分析第61页
   ·RNA提取第61页
   ·步进PCR同源克隆Ca~(2+)-ATPase基因第61-63页
     ·第一链cDNA的合成第61-62页
     ·PCR扩增第62-63页
   ·RACE获得全长cDNA第63-66页
     ·引物设计:第63页
     ·3′-RACE第63-64页
     ·5′-RACE第64-66页
     ·目的片段回收、克隆与测序第66页
 3 结果与分析第66-80页
   ·靶标基因片段BIF17的序列分析第66-69页
     ·序列组成第66页
     ·序列分析第66-68页
     ·Ca~(2+)-ATPase基因分子系统发育分析第68页
     ·靶标基因BIF17同源基因亚族序列分析第68-69页
   ·步进PCR克隆Ca~(2+)-ATPase基因第69-73页
     ·第一步同源克隆第69-71页
     ·第二步同源克隆第71-73页
   ·RACE法获得cDNA全长序列3’、5’末端第73-76页
     ·3’RACE第73-74页
     ·5’RACE第74-76页
   ·序列拼接第76-78页
   ·全长序列的验证第78-80页
     ·同源基因的搜索比对第78-79页
     ·全长序列开放式阅读框(ORF)分析第79页
     ·试验验证第79-80页
 4 讨论第80-82页
   ·Ca~(2+)-ATPase在植物逆境信号转导中的重要作用第80-81页
   ·对新基因克隆策略的思考第81-82页
   ·Ca~(2+)-ATPase的保守性第82页
 5 小结第82-83页
第四章 Ca~(2+)-ATPase基因表达研究及功能预测第83-103页
 第一节 Ca~(2+)-ATPase基因受BABA诱导表达的时空规律第83-90页
  1 试验材料第83页
   ·植物材料第83页
   ·主要生化试剂第83页
  2 方法第83-85页
   ·不同RNA提取试剂对番茄成熟组织提取效果研究第83-84页
     ·RNA提取方法第83页
     ·RNA质量检测第83-84页
     ·反转录成cDNA第84页
     ·PCR进行半定量内参检测第84页
   ·Northern blotting第84-85页
     ·育苗以及取样第84页
     ·RNA提取第84页
     ·甲醛凝胶电泳第84页
     ·转膜第84页
     ·分子杂交第84-85页
     ·洗膜第85页
     ·分子成像第85页
  3 结果与分析第85-89页
   ·RNA提取方法研究第85-88页
     ·RNA样品的凝胶电泳分析第86页
     ·RNA样品的紫外扫描分析第86-87页
     ·RNA样品的产量比较第87页
     ·RT-PCR半定量内参检测第87-88页
   ·Northern blotting第88-89页
  4 讨论第89-90页
   ·RNA提取第89页
   ·Northern杂交第89-90页
 第二节 Ca~(2+)-ATPase基因的功能预测第90-102页
  1 方法第90页
  2 结果与分析第90-102页
   ·蛋白的理化性质分析第90-92页
     ·ProtParam第90-92页
     ·ProtScale第92页
   ·Interpro搜索对序列进行整体评价第92-93页
   ·Ca~(2+)-ATPase蛋白二、三级结构预测第93-98页
     ·Motif预测第93-94页
     ·结构域分析第94-97页
     ·Ca~(2+)-ATPase蛋白跨膜结构预测第97-98页
   ·Ca~(2+)-ATPase蛋白三维模型预测第98-99页
   ·基因代谢途径分析第99-100页
   ·分子系统发育分析第100-102页
  3 讨论第102页
 本章小结第102-103页
第五章 番茄应答BABA诱导全长cDNA文库的构建第103-113页
 1 试验材料第104页
   ·植物材料第104页
   ·主要生化试剂第104页
 2 方法第104-109页
   ·育苗以及取样方法第104页
   ·RNA的大量提取法第104页
   ·mRNA分离与提纯第104-105页
   ·cDNA文库构建第105-109页
     ·cDNA第一链合成第105页
     ·引物延伸法合成cDNA第二链第105-106页
     ·蛋白酶消化第106页
     ·SfI酶切第106页
     ·用CHROMA SPINTM-400进行cDNA大小片段分级第106-107页
     ·ds cDNA与pDNR-LIB载体的连接第107-108页
     ·重组质粒转化进E.coli第108页
     ·测定质粒文库的滴度第108页
     ·文库的扩增第108-109页
 3 结果与分析第109-110页
   ·总RNA提取与mRNA纯化第109页
   ·单链和双链cDNA的合成第109-110页
   ·双链cDNA的分级第110页
   ·cDNA与载体的连接转化第110页
   ·cDNA文库滴度测定与文库扩增第110页
 4 讨论第110-111页
   ·cDNA文库的质量及其可能影响因素第110-111页
 5 小结第111-112页
 6 图版第112-113页
第六章 Ca~(2+)-ATPase基因在低温锻炼柑橘中的表达分析第113-117页
 1 试验材料第113页
   ·植物材料第113页
   ·主要生化试剂第113页
 2 方法第113-115页
   ·材料处理第113页
   ·采样第113页
   ·总RNA提取第113-114页
   ·单链cDNA的合成第114页
   ·半定量内参引物扩增第114页
   ·PCR扩增第114-115页
 3 结果与分析第115页
 4 讨论第115-116页
 5 小结第116-117页
结论第117-118页
论文创新点第118-119页
下一步工作设想第119-120页
参考文献第120-128页
附录第128-139页
致谢第139-140页

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