水稻DNA序列多样性和籼粳分化
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-31页 |
| 1 籼粳起源 | 第11-13页 |
| ·单系起源说 | 第11-12页 |
| ·二系起源说 | 第12-13页 |
| 2 籼粳亚种的鉴别 | 第13-17页 |
| ·形态性状分类 | 第13-14页 |
| ·判别函数法(形态和生理性状相结合) | 第14页 |
| ·杂交亲和性的鉴定 | 第14页 |
| ·生化方法(同工酶) | 第14-15页 |
| ·分子标记 | 第15-17页 |
| 3 籼稻和粳稻的基因多样性和遗传分化 | 第17-21页 |
| ·籼粳亚种的基因多样性 | 第17-18页 |
| ·籼粳稻的遗传分化 | 第18-21页 |
| ·籼粳稻间同工酶基因位点的分化 | 第18-20页 |
| ·籼粳间DNA的分化 | 第20-21页 |
| 4 籼粳演化的机理 | 第21-23页 |
| ·杂交与分化 | 第22页 |
| ·选择与分化 | 第22页 |
| ·非随机组合与籼粳分化 | 第22-23页 |
| 5 水稻籼粳亚种间杂种优势的利用 | 第23-24页 |
| ·籼粳亚种间杂种优势利用进展 | 第23-24页 |
| ·籼粳亚种间杂种优势利用中的主要问题 | 第24页 |
| 6 SNPs在籼粳亚种研究中的进展 | 第24-29页 |
| ·籼粳间SNPs的挖掘现状 | 第25-26页 |
| ·SNPs的分布、频率与特征 | 第26-29页 |
| 7 本研究的主要内容、目的及意义 | 第29-31页 |
| 第二章 材料与方法 | 第31-42页 |
| 1 材料与种植 | 第31页 |
| 2 形态鉴定 | 第31-33页 |
| 3 基因组DNA提取 | 第33-34页 |
| 4 SSR标记及其分析 | 第34-38页 |
| ·引物的设计、合成与PCR扩增 | 第34页 |
| ·PCR产物电泳分析 | 第34-38页 |
| ·聚丙稀酰胺凝胶的制备 | 第35-36页 |
| ·PCR产物聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第36-37页 |
| ·硝酸银染色 | 第37-38页 |
| 5 SNPs标记及其分析 | 第38-39页 |
| ·引物设计及合成 | 第38页 |
| ·DNA序列测定与分析 | 第38-39页 |
| 6 统计分析 | 第39-42页 |
| ·籼粳遗传分化程度 | 第39-40页 |
| ·基因多样性 | 第40页 |
| ·聚类方法 | 第40-42页 |
| 第三章 结果与分析 | 第42-76页 |
| 1 籼稻和粳稻地方品种的DNA序列多样性 | 第42-61页 |
| ·SSR标记分析 | 第42-48页 |
| ·等位基因数目 | 第42-44页 |
| ·等位基因频率 | 第44-47页 |
| ·基因多样性 | 第47-48页 |
| ·遗传分化系数 | 第48页 |
| ·SNPs标记分析 | 第48-55页 |
| ·SNPs数目和频率 | 第48-52页 |
| ·次等位基因频率 | 第52-55页 |
| ·基因多样性 | 第55页 |
| ·遗传分化系数 | 第55页 |
| ·单倍型 | 第55-61页 |
| ·单倍型数目 | 第55-56页 |
| ·单倍型频率 | 第56-58页 |
| ·单倍型多样性 | 第58-59页 |
| ·遗传分化系数 | 第59-61页 |
| 2 籼粳的遗传分化 | 第61-69页 |
| ·遗传分化特异基因、位点及其分布 | 第61-62页 |
| ·SSR | 第61页 |
| ·SNPs | 第61页 |
| ·单倍型 | 第61-62页 |
| ·基因的籼粳分化程度 | 第62-65页 |
| ·SSR | 第62-64页 |
| ·SNPs | 第64页 |
| ·单倍型 | 第64-65页 |
| ·品种的籼粳分化程度 | 第65-69页 |
| 3 聚类分析 | 第69-76页 |
| ·基于UPGMA的SSR聚类分析 | 第69页 |
| ·SNPs聚类分析 | 第69-70页 |
| ·单倍型的聚类分析 | 第70-76页 |
| 第四章 讨论 | 第76-80页 |
| 1 籼稻和粳稻DNA序列多样性 | 第76-77页 |
| 2 籼稻和粳稻的遗传分化 | 第77页 |
| 3 SSR与SNPs比较 | 第77-78页 |
| 4 展望 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-86页 |
| 附录 | 第86-88页 |
