摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-10页 |
主要英文缩略词 | 第10-12页 |
目录 | 第12-14页 |
前言 | 第14-20页 |
第一章 用氧化应激反应和氧化还原调控相关蛋白筛选人肝脏cDNA文库 | 第20-52页 |
一、材料和方法 | 第24-36页 |
1. 材料 | 第24-27页 |
2. 方法 | 第27-36页 |
二、结果 | 第36-49页 |
1. 文库鉴定及其扩增 | 第36-37页 |
2. 诱饵载体的构建 | 第37-38页 |
3. 诱饵自激活检测 | 第38-40页 |
4. Y2H筛库 | 第40-47页 |
5. 相互作用的初步分析 | 第47-49页 |
三、讨论 | 第49-52页 |
第二章 相互作用数据的评价 | 第52-83页 |
一、材料和方法 | 第54-55页 |
1. 酵母回转验证 | 第54页 |
2. 生物信息学分析方法 | 第54-55页 |
二、结果 | 第55-66页 |
1. 酵母回转验证 | 第55-57页 |
2. 生物信息分析结果 | 第57-62页 |
·已知相互作用的判定 | 第57-58页 |
·与表达谱及基因敲除表型数据的整合 | 第58-59页 |
·GO注释 | 第59-61页 |
·相互作用结构域 | 第61-62页 |
·模式生物同源性比较 | 第62页 |
3. 相互作用数据的整体评价 | 第62-66页 |
三、讨论 | 第66-83页 |
一、技术策略与方法 | 第69页 |
1. LCI数据的产生 | 第69页 |
2. 网络的构建 | 第69页 |
3. 相互作用数据的挖掘 | 第69页 |
二、相互作用网络的构建 | 第69-75页 |
1. LCI相互作用网络 | 第69-70页 |
2. Y2H相互作用网络 | 第70-73页 |
3. 整合 LCI和 Y2H相互作用的网络 | 第73-75页 |
三、相互作用数据的挖掘 | 第75-83页 |
1. 潜在的信号通路间的交联——Keap1-p65的相互作用 | 第75-77页 |
2. 揭示重要蛋白的作用机制——Keap1-Nrf1的相互作用 | 第77-78页 |
3. 揭示新蛋白的重要功能——Trx2-THAP1、Trx2-GASP2和Keap1-TSC22D4的相互作用 | 第78-80页 |
4. 揭示已知相互作用的其它重要功能——PRDX2-JAB1的相互作用 | 第80-81页 |
5. 发现重要蛋白复合物——PRDXs复合物 | 第81-83页 |
结论 | 第83-85页 |
存在问题和展望 | 第85-86页 |
参考文献 | 第86-102页 |
附录1: 诱饵基因引物和酵母菌落 PCR鉴定引物 | 第102-105页 |
附录2: 已知相互作用 LCI | 第105-106页 |
附录3: 基因敲除表型 | 第106-109页 |
在读期间发表或投稿的论文 | 第109-110页 |
致谢 | 第110页 |