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组蛋白去乙酰化酶抑制剂Apicidin诱导增强人γ-珠蛋白基因表达的分子机制研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-14页
前言第14-30页
 1. 人β-珠蛋白基因簇与真核基因表达调控研究第14-22页
   ·人β-珠蛋白基因簇的结构特点第14-15页
   ·人β-珠蛋白基因簇是研究真核基因表达调控的经典模型第15-21页
     ·远距离增强元件LCR和近端启动子的协同作用机制第15-17页
     ·参与人β-珠蛋白基因簇调控的反式作用因子种类及其作用机制第17-18页
     ·表观遗传调控与人β-珠蛋白基因簇时空特异性的表达第18-21页
   ·表观遗传调控与人类遗传疾病的关系第21-22页
 2. 人β-珠蛋白基因簇相关的分子遗传病第22-28页
   ·β-地中海贫血和镰刀型贫血病及其发病机制第22-23页
   ·人γ-珠蛋白基因的激活表达是治疗这类疾病的重要策略第23-24页
   ·通过药物激活人γ-珠蛋白基因的表达是一条有效的途径第24-25页
   ·基于表观遗传调控原理的人γ-珠蛋白基因的诱导表达与激活第25-26页
   ·P38MAPK信号通路及其在HDACi激活人γ-珠蛋白基因表达中的作用第26-28页
 3. 本研究的理论问题与主要内容第28-30页
材料与方法第30-45页
 1. 实验材料第30-32页
   ·菌株与质粒第30页
   ·细胞系第30页
   ·限制性内切酶及修饰酶第30页
   ·实验用抗体第30页
   ·其它主要试剂和材料第30-31页
   ·主要仪器设备第31-32页
 2. 实验方法第32-45页
   ·基本技术路线第32页
   ·细菌操作与质粒的转化第32-33页
     ·感受态大肠杆菌DH5-α制备第32页
     ·质粒的转化和扩增第32页
     ·质粒的提取和纯化第32-33页
   ·细胞培养第33-34页
     ·细胞的生长条件第33页
     ·细胞的传代第33页
     ·细胞的复苏及冻存第33-34页
   ·Apicidin对K562和Hela细胞的不同浓度和时间的处理第34页
   ·Apicidin影响K562细胞增殖的MTT分析第34页
   ·流式细胞仪检测Apicidin对K562细胞周期的影响第34-35页
   ·半定量RT-PCR对人β-类珠蛋白基因和红系转录因子等的表达分析第35-36页
     ·细胞总RNA的提取第35页
     ·cDNA第一链的合成第35页
     ·RT-PCR检测基因转录水平上的表达第35-36页
   ·Western-Blotting分析组蛋白修饰模式和转录因子蛋白水平的变化第36-38页
     ·裂解细胞第36页
     ·蛋白质浓度测定第36页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第36-37页
       ·制备分离胶第36-37页
       ·制备浓缩(堆积)胶第37页
       ·制备样品和上样第37页
       ·电泳第37页
       ·染色第37页
     ·转膜第37-38页
     ·抗原抗体反应第38页
     ·辣根过氧化物酶化学发光法检测蛋白第38页
   ·人β-类珠蛋白基因簇染色质结构和转录调控因子募集的ChIP分析第38-42页
     ·细胞培养第38页
     ·细胞固定第38-39页
     ·细胞核的提取第39页
     ·细胞核的裂解与超声处理第39页
     ·超声结果的分析第39页
     ·免疫沉淀第39-40页
     ·DNA的分离及纯化第40页
     ·半定量PCR反应第40-42页
   ·限制性内切酶柔顺性实验第42-43页
   ·FISH技术检测经Apicidin处理的β-珠蛋白基因簇核定位模式第43-45页
实验结果第45-64页
 1. Apicidin对K562细胞增殖与分化的影响分析第45-49页
   ·Apicidin对K562细胞的增殖活性具有微弱抑制作用第45-46页
   ·Apicidin可诱导K562细胞周期阻滞和凋亡第46页
   ·Apicidin能够诱导K562细胞向红系方向分化第46-47页
   ·Apicidin使人γ-珠蛋白基因的表达明显升高第47-48页
   ·Apicidin使GATA-1表达上调而GATA-2表达下降第48-49页
 2. Apicidin明显增加K562细胞总H3、H4乙酰化和H3 K4双甲基化修饰水平第49-50页
 3. ChIP检测Apicidin对β-珠蛋白基因簇染色质组蛋白修饰状态的影响第50-54页
   ·ChIP分析条件的建立第51-52页
   ·Apicidin使人β-珠蛋白基因簇LCR区活性组蛋白修饰水平明显升高第52-53页
   ·Apicidin使人γ-和ε启动子、5'区及基因间区活性组蛋白修饰发生动态变化第53-54页
 4. Apicidin可激活P38 MAPK信号通路而瞬时抑制ERK通路第54-55页
 5. P38 MAPK通路的阻断抑制了Apicidin的诱导作用第55-56页
 6. P38 MAPK通路的阻断使Apicidin处理下β-珠蛋白基因簇组蛋白修饰水平下降第56-58页
 7. P38 MAPK通路的阻断抑制了Apicidin促使的GATA-1表达上调第58-59页
 8. 人β-珠蛋白基因启动子和LCR区RNA Pol Ⅱ和转录因子的结合分析第59-62页
   ·Apicidin使Pol Ⅱ的募集水平明显升高,且不受P38 MAPK通路的调节第59-60页
   ·Apicidin处理和P38 MAPK信号通路阻断前后转录因子的结合分析第60-62页
 9. Apicidin可明显促使人β-簇从CT区的环出第62-64页
讨论第64-82页
 1. Apicidin可诱导增强人γ-珠蛋白基因的表达并具备潜在的临床应用前景第64-65页
 2. Apicidin与P38 MAPK通路协同作用提高β-簇染色质活性状态以激活人γ-珠蛋白基因的表达第65-73页
   ·LCR、ε与γ基因间区组蛋白乙酰化水平的提高显著加强了染色质成环作用第66-69页
   ·基因间转录与pol Ⅱ的募集是Apicidin增强人γ-珠蛋白基因表达的潜在分子机制第69-71页
   ·P38 MAPK信号通路的阻断可能破坏了组蛋白共价修饰问的协调作用第71-72页
   ·组蛋白乙酰化转移酶可能介导了P38 MAPK通路参与增强人γ-珠蛋白基因的表达第72-73页
 3. GATA-1、SP1、NF-E2/P45可能参与Apicidin、P38 MAPK通路协同增强人γ-珠蛋白基因的表达第73-79页
   ·GATA-1第73-76页
   ·NF-E2第76-78页
   ·SP1第78-79页
 4. Apicidin影响β-珠蛋白基因簇核定位及其潜在的分子基础第79-81页
 5. 本研究不足之处和今后的工作设想第81-82页
小结第82-84页
参考文献第84-93页
文献综述第93-105页
英文名词及缩写第105-108页
致谢第108-109页
个人简历第109-111页

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