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酵母数量性状主效基因的定位分离及克隆

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-12页
第一章 文献综述第12-38页
 1 表型变异的遗传结构第12-19页
   ·孟德尔性状第12页
   ·复杂性状第12-19页
     ·复杂性状复杂性的原因第12-13页
     ·复杂性状的遗传分析方法第13-15页
     ·复杂表型变异的分子机制第15-16页
     ·复杂性状基因鉴定的研究进展第16-18页
     ·遗传基因组学第18-19页
 2 酵母遗传耐受性第19-25页
   ·酵母模式生物的应用第19-20页
   ·酵母的乙醇耐性第20-25页
     ·酵母乙醇耐受性的生化机理第21-23页
     ·酵母乙醇耐受性的遗传学进展第23-25页
 3 研究目的和意义第25-26页
 参考文献第26-38页
第二章 酵母乙醇耐受性极端表型菌株的选择及遗传学分析第38-62页
 前言第38-39页
 1 试剂与材料第39-43页
   ·试剂第39页
   ·溶液第39-41页
   ·仪器第41-42页
   ·材料第42-43页
     ·菌株第42页
     ·质粒第42-43页
 2 实验方法第43-50页
   ·酵母乙醇耐受性的表型测定第43页
   ·细菌感受态的制备第43-44页
   ·细菌转化第44页
   ·细菌质粒的抽提第44页
   ·酵母转化第44-45页
   ·酵母DNA的抽提第45-46页
   ·四分体孢子的分离第46页
   ·HO基因剔除第46-47页
   ·酵母菌株单倍体二倍化及接合型的转变第47页
   ·酵母乙醇耐受性极端敏感型菌株的选择第47-49页
   ·半双列杂交第49-50页
 3 结果和分析第50-56页
   ·酵母菌株的乙醇耐性筛选第50-51页
   ·HO基因剔除第51-53页
   ·极端敏感型菌株的选择第53-54页
   ·半双列杂交第54-56页
 4 结论和讨论第56-62页
   ·酵母的乙醇耐受性是一个复杂的数量性状第56-57页
   ·自然选择紧密地贯穿在极端敏感型菌株的人工选择之中第57-58页
   ·极端敏感型菌株的选择具有高效的遗传进度第58-62页
第三章 酵母F_2单倍体分离群体的QTL作图第62-76页
 前言第62-63页
 1 试剂和材料第63-64页
   ·试剂第63页
   ·工具软件第63页
   ·材料第63-64页
 2 实验方法第64-68页
   ·F_2分离群体的构建第64页
   ·分离群体的表型测定第64页
   ·微卫星标记的搜索及基因分型第64页
   ·荧光标记引物的基因分型第64-65页
   ·SNP标记的设计第65页
   ·DNA片段的割胶回收第65-66页
   ·PCR产物纯化第66页
   ·DNA序列测定第66-67页
   ·全基因组的 QTL扫描第67页
   ·精细定位第67-68页
 3 结果和分析第68-72页
   ·F_2单倍体分离群体的构建及表型测定第68页
   ·酵母基因组微卫星标记的设计第68-69页
   ·酵母全基因组QTL扫描第69-70页
   ·PCR-RFLP的SNP检测第70-71页
   ·精细作图第71-72页
 4 结论和讨论第72-76页
   ·选择性基因分型方法是高效的检测QTL的策略第72页
   ·QTL精细定位到3cM的区间第72-73页
   ·微卫星标记是鉴定酵母分子水平变异的常用工具第73-76页
第四章 基于RSB群体的复杂性状的高精度高解析率定位第76-92页
 前言第76-77页
 1 试剂和材料第77页
   ·试剂第77页
   ·材料第77页
 2 理论解释第77-80页
   ·RSB的理论依据第77-79页
   ·RSB与其它QTL定位方法的比较第79-80页
 3 试验方法第80-82页
   ·构建极端表型亲本的等基因的相反接合型菌株第80页
   ·RSB试验设计及实施第80页
   ·表型的测定第80-81页
   ·基因分型第81-82页
 4 结果和分析第82-87页
   ·RSB五个选择世代的试验结果第82-85页
   ·RSB5个体的全基因组扫描第85-86页
   ·IX号染色体QTL区的精细基因型第86-87页
 5 结论和讨论第87-92页
   ·RSB策略可以高解析率地定位复杂性状的基因第87页
   ·RSB对复杂性状的基因定位具有稳健性第87-88页
   ·RSB策略具有较广的适用范围第88-92页
第五章 酵母乙醇耐受性主效候选基因的定位克隆第92-114页
 前言第92-93页
 1 试剂和材料第93-94页
   ·试剂第93页
   ·溶液第93页
   ·仪器第93-94页
 2 实验方法第94-100页
   ·ASG1的编码区和上游基因调控区的序列测定第94页
   ·遗传分析第94页
   ·基因剔除第94-95页
   ·ASG1的等位基因置换第95-98页
     ·长片断的PCR扩增第96页
     ·T载体克隆第96-97页
     ·连接反应第97页
     ·基因置换质粒的构建第97页
     ·酵母转化第97-98页
   ·ASG1表达水平的检测第98-99页
     ·RNA的抽提第98-99页
     ·Affymetrix芯片的表达谱实验第99页
   ·蛋白结构域的预测第99-100页
 3 结果和分析第100-111页
   ·两极端表型亲本的DNA序列的比对第100-101页
   ·遗传分析结果第101-102页
   ·基因剔除第102-105页
   ·等位基因替换的实验分析第105-108页
     ·替换质粒的构建第105-106页
     ·转化酵母第106-108页
     ·表型测定第108页
   ·转录水平的检测第108-109页
   ·ASG1 motif的预测第109-111页
 4 结论和讨论第111-114页
   ·ASG1是控制酵母乙醇耐受性的一个主效基因第111页
   ·调节变异是导致复杂性状表型变异的重要遗传机制第111-113页
   ·基因组的不稳定性是乙醇耐受性变异的可能原因第113-114页
参考文献第114-122页
致谢第122-123页
毕业感怀第123-124页

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