| 第一章 文献综述 | 第1-35页 |
| 1. 稻瘟病菌 | 第14-15页 |
| 2. 稻瘟病菌侵染相关发育 | 第15-19页 |
| ·分生孢子的吸附和萌发 | 第15-17页 |
| ·附着胞的形成 | 第17-18页 |
| ·侵染栓的形成和侵入 | 第18-19页 |
| 3. 稻瘟病菌的功能基因组研究 | 第19-26页 |
| ·稻瘟病菌的基因组学研究 | 第20-22页 |
| ·稻瘟病菌的表达序列标签研究 | 第22-23页 |
| ·稻瘟病菌基因表达的大规模检测 | 第23-26页 |
| ·差异消减展示研究附着胞形成 | 第23-24页 |
| ·差减抑制杂交分析附着胞成熟 | 第24页 |
| ·基因芯片研究菌丝孢子附着胞间基因差异表达 | 第24页 |
| ·基因表达系列分析研究外源cAMP影响附着胞形成 | 第24页 |
| ·大规模平行信号测序 | 第24-25页 |
| ·cDNA文库测序研究基因表达 | 第25-26页 |
| 4. 稻瘟病菌信号传递途径 | 第26-33页 |
| ·信号识别 | 第27-28页 |
| ·细胞信号传递与调控 | 第28-33页 |
| ·cAMP信号传递途径 | 第28-29页 |
| ·MAP激酶信号转导途径 | 第29-32页 |
| ·Ca~(2+)离子途径 | 第32-33页 |
| 5. 本研究的目的及内容 | 第33-35页 |
| 第二章 稻瘟病菌表达序列标签(EST)研究 | 第35-57页 |
| 1. 材料与方法 | 第35-43页 |
| ·培养基和主要试剂 | 第35-36页 |
| ·菌株和培养方法 | 第36-37页 |
| ·RNA抽提 | 第37页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第37-39页 |
| ·Poly(A+)mRNA的分离 | 第37-38页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第38页 |
| ·cDNA双链的合成和纯化 | 第38页 |
| ·PCR产物的酶切 | 第38页 |
| ·酶切 PCR产物(cDNA)的分级和纯化 | 第38-39页 |
| ·载体的酶切和纯化 | 第39页 |
| ·cDNA和载体的连接 | 第39页 |
| ·连接产物的转化 | 第39页 |
| ·cDNA文库的鉴定 | 第39页 |
| ·质粒提取 | 第39-40页 |
| ·细菌培养 | 第39-40页 |
| ·质粒抽提与纯化 | 第40页 |
| ·cDNA序列测定 | 第40-41页 |
| ·EST序列的生物信息学分析 | 第41-43页 |
| ·EST序列处理的硬件环境和软件信息 | 第41-42页 |
| ·EST序列处理的基本流程 | 第42-43页 |
| ·TUT的相似性匹配 | 第43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-53页 |
| ·稻瘟病菌不同发育时期的样品 | 第43-45页 |
| ·RNA提取和cDNA合成 | 第45页 |
| ·cDNA文库的质量鉴定 | 第45-46页 |
| ·EST序列生物信息学分析 | 第46-53页 |
| ·基本统计分析 | 第46-47页 |
| ·稻瘟病菌菌株 Y34与70-15基因表达的比较 | 第47-48页 |
| ·功能注释 | 第48-49页 |
| ·高丰度表达基因 | 第49-52页 |
| ·功能分类 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 4 小结 | 第55-57页 |
| 第三章 稻瘟病菌基因表达的cDNA阵列检测研究 | 第57-110页 |
| 1 材料与方法 | 第57-61页 |
| ·培养基和主要试剂 | 第57页 |
| ·稻瘟病菌材料 | 第57-58页 |
| ·六个发育时期的检测 | 第57-58页 |
| ·促细胞分裂原信号转导途径相关基因缺失突变体和野生型菌丝的培养 | 第58页 |
| ·cDNA阵列探针的准备 | 第58-59页 |
| ·cDNA阵列制备 | 第59-60页 |
| ·用于cDNA阵列制备的克隆 | 第59页 |
| ·cDNA克隆的 PCR扩增与质量控制 | 第59页 |
| ·PCR产物纯化和点样前处理 | 第59页 |
| ·cDNA阵列制备 | 第59-60页 |
| ·cDNA阵列杂交和数据提取 | 第60-61页 |
| ·预杂交和杂交 | 第60页 |
| ·洗膜 | 第60页 |
| ·cDNA阵列杂交数据提取和分析 | 第60-61页 |
| ·实时荧光定量 PCR分析 | 第61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-85页 |
| ·稻瘟病菌六个发育时期的基因表达研究 | 第61-72页 |
| ·杂交信号分析 | 第61-63页 |
| ·基于高表达基因的功能分类分析 | 第63-65页 |
| ·不同发育时期差异表达基因的鉴定和荧光定量 PCR验证 | 第65-66页 |
| ·不同发育时期差异表达基因的变化 | 第66-68页 |
| ·差异表达基因的功能分析 | 第68-72页 |
| ·菌丝时期促细胞分裂原信号转导途径的基因表达研究 | 第72-85页 |
| ·cDNA阵列数据分析 | 第72-74页 |
| ·突变体差异表达基因 | 第74-76页 |
| ·物质能量代谢 | 第76-77页 |
| ·信号传递和转录因子 | 第77-79页 |
| ·突变体生物表型与基因差异表达 | 第79-80页 |
| ·差异表达基因的表达谱分析 | 第80-83页 |
| ·稻瘟病菌 MAPK途径的相关基因表达模式 | 第83-85页 |
| 3 讨论 | 第85-91页 |
| ·稻瘟病菌cDNA阵列检测基因表达 | 第85-87页 |
| ·稻瘟病菌发育相关基因 | 第87-89页 |
| ·葡萄糖抑制基因 | 第89页 |
| ·稻瘟病菌 MAPK信号转导途径 | 第89-90页 |
| ·稻瘟病菌信号途径间相互作用 | 第90-91页 |
| 4 小结 | 第91-95页 |
| 5 附录 | 第95-110页 |
| 本论文所用缩写词及中文对照 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-119页 |