S-受体激酶信号传导元件THL2和MOD编码基因的克隆测序及生物信息学初探
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 芸薹属植物控制自交不亲和性的基因 | 第12-18页 |
| ·自交不亲和反应雌蕊S基因 | 第12-15页 |
| ·自交不亲和反应雄蕊S基因 | 第15-16页 |
| ·SL、SRK和SCR基因之间的物理距离 | 第16-17页 |
| ·SRK和SCR相互作用的鉴定 | 第17页 |
| ·自交不亲和反应相关基因 | 第17-18页 |
| 2 S-受体激酶介导的细胞信号转导 | 第18-20页 |
| 第2章 引言 | 第20-22页 |
| 第3章 材料与方法 | 第22-32页 |
| 1 材料 | 第22页 |
| ·植物材料 | 第22页 |
| ·质粒、菌株及培养条件 | 第22页 |
| ·工具酶和主要分子生物学试剂 | 第22页 |
| 2 方法 | 第22-32页 |
| ·甘蓝和油菜基因组DNA的提取 | 第22-23页 |
| ·甘蓝和油菜柱头中总RNA的提取 | 第23页 |
| ·基因组DNA PCR扩增 | 第23-24页 |
| ·总RNA的RT-PCR扩增 | 第24-26页 |
| ·目的片段的克隆 | 第26-29页 |
| ·PCR产物的回收 | 第26-27页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第27-28页 |
| ·目的片段与质粒载体的连接反应 | 第28页 |
| ·重组质粒的构建策略 | 第28-29页 |
| ·质粒DNA转化感受态细胞 | 第29页 |
| ·酶切鉴定 | 第29-30页 |
| ·碱裂解法小量制备质粒DNA | 第29-30页 |
| ·质粒DNA的酶切分析 | 第30页 |
| ·序列测定 | 第30-31页 |
| ·核苷酸和氨基酸序列分析 | 第31-32页 |
| ·核苷酸同源性分析 | 第31页 |
| ·蛋白质同源性分析 | 第31页 |
| ·蛋白质模体(motif)分析 | 第31页 |
| ·聚类分析 | 第31页 |
| ·蛋白质结构分析 | 第31-32页 |
| 第4章 结果与分析 | 第32-53页 |
| 1 甘蓝和油菜核酸快速提取的改良探索 | 第32-33页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第32页 |
| ·柱头总RNA的抽提 | 第32-33页 |
| 2 THL2基因的克隆与序列分析 | 第33-41页 |
| ·THL2基因的克隆 | 第33-36页 |
| ·THL2 DNA的PCR扩增与克隆 | 第33-34页 |
| ·THL2 DNA重组体的菌液PCR鉴定 | 第34-35页 |
| ·THL2 cDNA的RT-PCR扩增与克隆 | 第35-36页 |
| ·THL2基因的核苷酸序列分析 | 第36-38页 |
| ·THL2氨基酸序列分析 | 第38-39页 |
| ·THL2蛋白的系统发生树分析 | 第39-40页 |
| ·THL2蛋白质高级结构分析 | 第40-41页 |
| 3 MOD基因的克隆与序列分析 | 第41-52页 |
| ·MOD基因的克隆 | 第41-44页 |
| ·MOD DNA的PCR扩增与克隆 | 第41-42页 |
| ·MOD DNA重组体的菌液PCR鉴定 | 第42页 |
| ·MOD cDNA的RT-PCR扩增与克隆 | 第42-43页 |
| ·MOD cDNA重组体的菌液PCR鉴定 | 第43-44页 |
| ·MOD基因的核苷酸序列分析 | 第44-46页 |
| ·MOD核苷酸同源性分析 | 第44-45页 |
| ·MOD基因限制性内切酶酶切分析 | 第45-46页 |
| ·MOD氨基酸序列分析 | 第46-49页 |
| ·MOD氨基酸序列同源性分析 | 第46-48页 |
| ·MOD氨基酸活性位点分析 | 第48-49页 |
| ·MOD蛋白结构分析 | 第49-52页 |
| ·MOD模体(motif)分析 | 第49-50页 |
| ·MOD高级结构分析 | 第50-52页 |
| 4 THL2和MOD基因的表达模式分析 | 第52-53页 |
| ·THL2基因的表达模式 | 第52页 |
| ·MOD基因的表达模式 | 第52-53页 |
| 第5章 讨论 | 第53-57页 |
| 1 甘蓝和油菜中THL2基因的核苷酸序列差异分析 | 第53页 |
| 2 THL2的氨基酸结构与功能的关系分析 | 第53-54页 |
| 3 甘蓝和油菜中MOD基因的核苷酸序列差异分析 | 第54页 |
| 4 MOD的氨基酸结构与功能的关系分析 | 第54-56页 |
| 5 THL2和MOD的生物信息学特点 | 第56-57页 |
| 第6章 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 硕士期间发表论文及参与课题情况 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64-69页 |
