| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 缩略词表及英汉对照 | 第15-17页 |
| 第一部分 文献综述 | 第17-39页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-39页 |
| 1 水稻直播栽培发展现状 | 第17-19页 |
| ·国内外水稻直播种植概况 | 第17-18页 |
| ·水稻直播研究现状 | 第18-19页 |
| ·水稻直播方式 | 第18页 |
| ·水稻直播的生产优势 | 第18-19页 |
| ·影响水稻直播成苗的因素 | 第19页 |
| 2 水稻幼苗耐缺氧能力的研究进展 | 第19-20页 |
| ·水稻幼苗耐缺氧能力的生理基础 | 第19-20页 |
| ·水稻幼苗耐缺氧能力的遗传研究现状 | 第20页 |
| 3 水稻种子活力的研究进展 | 第20-24页 |
| ·活力概念 | 第20-22页 |
| ·活力的生理机理 | 第22页 |
| ·种子活力的测定方法 | 第22-23页 |
| ·水稻种子活力的遗传控制 | 第23-24页 |
| 4 植物数量性状基因(QTL)定位研究进展 | 第24-35页 |
| ·QTL定位研究的基本策略 | 第24-25页 |
| ·家系作图 | 第25-28页 |
| ·关联作图 | 第28-34页 |
| ·选择牵连作用 | 第29-30页 |
| ·连锁不平衡 | 第30-34页 |
| ·家系分析和关联分析在数量性状中的应用 | 第34-35页 |
| 5 数量性状基因在水稻育种中的应用 | 第35-37页 |
| ·水稻种质资源中有利基因的发掘 | 第35页 |
| ·分子标记辅助选择改良数量性状 | 第35-36页 |
| ·水稻数量性状基因克隆 | 第36-37页 |
| 6 本研究的目的意义和技术路线 | 第37-39页 |
| 第二部分 研究报告 | 第39-99页 |
| 第二章 材料与方法 | 第39-53页 |
| 1 试验材料 | 第39-44页 |
| ·太湖流域水稻种子活力和耐缺氧能力遗传变异研究的材料 | 第39-42页 |
| ·籼粳交回交重组自交系群体种子活力和幼苗耐缺氧能力QTL分析的材料 | 第42页 |
| ·粳粳交重组自交系群体种子活力和幼苗耐缺氧能力QTL分析的材料 | 第42-43页 |
| ·太湖流域水稻品种种子活力和耐缺氧能力QTL的关联分析 | 第43-44页 |
| 2 试验方法 | 第44-49页 |
| ·田间种植 | 第44-45页 |
| ·活力的测定 | 第45-46页 |
| ·幼苗耐缺氧能力的测定 | 第46页 |
| ·直播成苗能力的测定 | 第46-47页 |
| ·水稻DNA的提取 | 第47页 |
| ·粳粳交秀水79×C堡重组自交系RIL群体标记筛选 | 第47页 |
| ·太湖流域水稻关联群体SSR标记的选取和全基因组扫描 | 第47-49页 |
| 3 数据分析 | 第49-53页 |
| ·遗传变异研究分析 | 第49页 |
| ·家系群体数据分析 | 第49-50页 |
| ·关联群体数据分析 | 第50-53页 |
| ·遗传多样性分析 | 第50页 |
| ·连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)程度的衡量 | 第50-51页 |
| ·群体结构分析 | 第51页 |
| ·关联分析确定与种子表型性状相关的SSR位点 | 第51-52页 |
| ·优异等位变异的确认 | 第52-53页 |
| 第三章 太湖流域水稻种子活力和耐缺氧能力遗传变异研究 | 第53-58页 |
| 1 297个太湖流域水稻品种子活力和耐缺氧能力遗传变异分析 | 第53-54页 |
| ·297个太湖流域水稻品种子活力的变异分析 | 第53-54页 |
| ·297个太湖流域水稻品种耐缺氧能力的变异分析 | 第54页 |
| 2 297个太湖流域水稻品种子活力和耐缺氧能力与成苗能力相关性 | 第54-56页 |
| ·种子活力指数与直播14天的苗高、成苗指数的相关分析 | 第54-55页 |
| ·缺氧条件下芽鞘长与直播14天的苗高、成苗指数的相关分析 | 第55-56页 |
| 3 高种子活力和耐缺氧能力品种的筛选 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-58页 |
| 第四章 籼粳交组合Nipponbare/Kasalath//Nipponbare BIL群体种子活力和幼苗耐缺氧能力QTL分析 | 第58-66页 |
| 1 BIL群体种子活力相关性状的QTL分析 | 第58-61页 |
| ·BIL群体及其亲本种子活力3个性状的表现 | 第58-59页 |
| ·BIL群体种子活力相关性状QTL的检测 | 第59-61页 |
| 2 籼粳交组合Nipponbare/Kasalath//Nipponbare BIL群体幼苗耐缺氧能力的QTL分析 | 第61-62页 |
| ·BIL群体及其亲本的幼苗缺氧反应指数的表现 | 第61页 |
| ·BIL群体幼苗耐缺氧能力QTL的检测 | 第61-62页 |
| 3 籼粳交组合Nipponbare/Kasalath//Nipponbare BIL群体正常发芽条件下芽鞘长度的QTL分析 | 第62-65页 |
| ·正常发芽条件下BIL群体及亲本幼苗芽鞘长度的表现 | 第62-63页 |
| ·BIL群体正常发芽条件下芽鞘长度的QTL检测 | 第63-65页 |
| 4 讨论 | 第65-66页 |
| ·与水稻耐缺氧能力的QTL紧密连锁标记的检测 | 第65页 |
| ·缺氧条件下与正常条件下芽鞘生长受到不同基因的调控 | 第65页 |
| ·在BIL群体检测出2个新的水稻幼苗活力QTL | 第65-66页 |
| 第五章 秀水79和C堡及其衍生的重组自交系(RIL)群体种子活力和幼苗耐缺氧能力的QTL分析 | 第66-74页 |
| 1 RIL群体种子活力相关性状的QTL分析 | 第66-69页 |
| ·RIL群体及其亲本种子活力3个性状的表现 | 第66-67页 |
| ·RIL群体种子活力3个性状的QTL检测 | 第67-69页 |
| 2 RIL群体耐缺氧能力的QTL分析 | 第69-70页 |
| ·RIL群体及其亲本的幼苗缺氧反应指数的表现 | 第69页 |
| ·RIL群体幼苗耐缺氧能力QTL的检测 | 第69-70页 |
| 3 正常条件下RIL群体幼苗芽鞘的QTL分析 | 第70-72页 |
| ·正常条件下RIL群体及其亲本的幼苗芽鞘长的表现 | 第70页 |
| ·RIL群体正常发芽条件下芽鞘长度的QTL检测 | 第70-72页 |
| 4 讨论 | 第72-74页 |
| ·两个不同遗传背景群体共同检测到了一个控制幼苗耐缺氧能力的QTL | 第72页 |
| ·两个不同遗传背景群体在第1染色体上都检测到了一个控制根长的QTL | 第72-73页 |
| ·在粳粳交群体中发掘出4个种子活力优异等位变异 | 第73-74页 |
| 第六章 太湖流域水稻品种种子活力和耐缺氧能力QTL的关联分析 | 第74-94页 |
| 1 太湖流域水稻自然群体遗传多样性、连锁不平衡及群体结构分析 | 第74-83页 |
| ·太湖流域水稻自然群体遗传多样性分析 | 第74-77页 |
| ·太湖流域水稻自然群体SSR位点间的连锁不平衡 | 第77-79页 |
| ·太湖流域水稻自然群体的结构分析 | 第79-83页 |
| 2 太湖流域水稻自然群体中种子活力性状QTL与SSR标记的关联分析 | 第83-87页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中与种子活力性状相关联的SSR标记 | 第83-84页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中种子活力3个性状的优异等位变异及其载体材料 | 第84-87页 |
| 3 太湖流域水稻自然群体中幼苗耐缺氧能力QTL与SSR标记的关联分析 | 第87-89页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中与幼苗耐缺氧能力相关联的SSR标记 | 第87页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中具有耐缺氧能力的优异等位变异及其载体材料 | 第87-89页 |
| 4 太湖流域水稻自然群体中正常条件下芽鞘长QTL与SSR标记的关联分析 | 第89-91页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中与正常条件下芽鞘长相关联的SSR标记 | 第89-90页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中正常条件下芽鞘长的优异等位变异及其载体材料 | 第90-91页 |
| 5 讨论 | 第91-94页 |
| ·关联群体的连锁不平衡分析 | 第91页 |
| ·群体结构对关联分析结果的影响 | 第91-92页 |
| ·关联分析结果与家系作图结果的比较 | 第92-93页 |
| ·关联分析结果在育种中的应用 | 第93-94页 |
| 第七章 全文结论和创新点 | 第94-99页 |
| 1 全文结论 | 第94-96页 |
| ·太湖流域水稻品种资源的种子活力和耐缺氧能力存在广泛的遗传变异,遗传变异主要存在于早熟晚粳生态类型中 | 第94页 |
| ·两个不同遗传背景的家系作图群体共检测到6个新的与种子活力性状相关的QTL | 第94-95页 |
| ·两个不同遗传背景的家系作图群体共检测到8个幼苗耐缺氧能力的QTL | 第95页 |
| ·太湖流域水稻自然群体中存在较高程度的LD | 第95-96页 |
| ·太湖流域水稻自然群体存在有亚群的分化 | 第96页 |
| ·利用关联分析鉴别出一批种子活力和幼苗耐缺氧能力的优异等位变异及携带优异等位变异的载体材料 | 第96页 |
| 2 创新点 | 第96-99页 |
| 参考文献 | 第99-111页 |
| 附录 | 第111-141页 |
| 在读期间发表的论文 | 第141页 |
