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细菌砷解毒基因的鉴定及功能研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略语表第10-12页
第一章 文献综述和研究的目的、意义与内容第12-25页
   ·引言第12-13页
   ·砷及其化合物第13页
   ·砷污染与砷中毒第13-15页
   ·微生物砷解毒机制第15-22页
     ·As(Ⅲ)氧化第15-17页
     ·细胞质As(Ⅴ)还原第17-20页
     ·呼吸性As(Ⅴ)还原第20-21页
     ·As(Ⅲ)甲基化第21页
     ·四类砷抗性机制的潜在联系第21-22页
   ·砷污染的生物修复第22-23页
   ·研究的目的、意义与内容第23-25页
第二章 不同砷污染土壤中砷抗性细菌的分离和鉴定及砷抗性基因的研究第25-43页
   ·引言第25页
   ·材料与方法第25-29页
     ·实验材料第25-26页
     ·分离和鉴定砷抗性菌及As(Ⅲ)氧化菌第26-28页
     ·简并PCR鉴定编码As(Ⅲ)氧化酶大亚基基因aoxB和As(Ⅲ)通道蛋白基因arsB/ACR3(1)/ACR3(2)第28页
     ·DNA测序和分子进化分析第28页
     ·测定砷抗性菌的As(Ⅲ)抗性水平第28-29页
     ·注册基因序列第29页
   ·结果与分析第29-38页
     ·砷抗性菌的分布和多样性第29-32页
     ·As(Ⅲ)氧化菌16S rRNA基因同源性比对第32页
     ·砷抗性菌的As(Ⅲ)抗性水平第32-33页
     ·鉴定aoxB基因和arsB/ACR3(1)/ACR3(2)基因第33-37页
     ·检测水平基因转移第37-38页
   ·讨论第38-41页
   ·本研究的结论和创新性第41-43页
第三章 As(Ⅲ)氧化菌Achromobacter sp.SY8和Pseudomonas sp.TS44砷解毒基因簇的克隆和表达研究第43-62页
   ·引言第43页
   ·材料与方法第43-48页
     ·实验材料第43-44页
     ·分析As(Ⅲ)氧化效率第44-45页
     ·分离SY8和TS44菌株的砷解毒基因簇第45-47页
     ·基因注释和生物信息学分析第47页
     ·砷解毒基因簇表达分析第47-48页
     ·注册菌株和基因序列第48页
   ·结果与分析第48-57页
     ·鉴定SY8和TS44菌株及As(Ⅲ)氧化效率分析第48-50页
     ·拼接和组装SY8和TS44菌株的砷解毒基因簇第50-52页
     ·基因注释和生物信息学分析第52-54页
     ·砷解毒基因簇在蛋白结构分析和基因表达上的证据第54-57页
   ·讨论第57-61页
   ·本研究的结论和创新性第61-62页
参考文献第62-77页
附录第77-83页
 附录1:CDM培养基配方第77页
 附录2:大肠杆菌质粒小量提取第77-78页
 附录3:细菌总DNA小量提取第78-79页
 附录4:细菌总RNA小量提取及RT-PCR第79-80页
 附录5:制备热激法感受态细胞第80-81页
 附录6:连接和热激法转化第81页
 附录7:大肠杆菌菌落PCR快速筛选第81-83页
作者简介第83-84页
发表的相关论文和申请的专利第84页
会议论文、摘要和口头报告第84-85页
致谢第85页

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