| 致谢 | 第1-13页 |
| 摘要 | 第13-15页 |
| Abstract | 第15-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-40页 |
| 1 洋葱伯克氏菌在环境中的重要性 | 第18-24页 |
| ·环境中的有益细菌 | 第18-22页 |
| ·农业环境中的植物病害生防菌 | 第18-19页 |
| ·自然环境中的有毒物质降解菌 | 第19-21页 |
| ·农业生态环境中的植物促生菌 | 第21-22页 |
| ·环境中的有害细菌 | 第22-23页 |
| ·农业环境中的植物病原菌 | 第22页 |
| ·医院环境中的人体条件致病菌 | 第22-23页 |
| ·自然环境中的冰核细菌 | 第23页 |
| ·对环境中Bcc菌的风险分析 | 第23-24页 |
| 2 Bcc在环境中的多样性分析 | 第24-34页 |
| ·Bcc的分类 | 第24-25页 |
| ·鉴定方法的研究进展 | 第25-31页 |
| ·传统鉴定方法 | 第25-27页 |
| ·分子生物学鉴定方法 | 第27-31页 |
| ·Bcc在环境中的分布 | 第31-34页 |
| ·Bcc在医院环境的分布 | 第31页 |
| ·Bcc在CF病人体内的分布 | 第31-32页 |
| ·Bcc在自然环境中的分布 | 第32-33页 |
| ·自然环境是引起医院环境致病菌的"储藏库"问题 | 第33-34页 |
| 3 Bcc菌的致病性研究 | 第34-35页 |
| ·毒力因子及毒力基因 | 第34页 |
| ·致病模型 | 第34-35页 |
| 4 Bcc作为人体条件致病菌的防治 | 第35-38页 |
| ·临床管理措施 | 第35页 |
| ·Bcc对抗生素的抗性 | 第35-37页 |
| ·壳聚糖抗微生物活性的研究进展 | 第37-38页 |
| ·壳聚糖及其特性 | 第37页 |
| ·壳聚糖的抗微生物活性 | 第37-38页 |
| 5 本研究的目的意义 | 第38-40页 |
| 第二章 西湖水及其他环境中洋葱伯克氏菌群的分离和鉴定 | 第40-58页 |
| 1 材料和方法 | 第41-48页 |
| ·供试菌株与主要培养基 | 第41页 |
| ·样本的采集和处理 | 第41-42页 |
| ·西湖水样的采集 | 第41-42页 |
| ·免培养方法检测西湖水中Bcc的种群多样性 | 第42页 |
| ·细菌的分离 | 第42-44页 |
| ·西湖水中的Bcc菌分离和纯化 | 第42页 |
| ·医院来源Bcc菌的活化和纯培养 | 第42-43页 |
| ·杏果腐烂病原细菌的分离 | 第43-44页 |
| ·Bcc菌的表型鉴定 | 第44-46页 |
| ·革兰氏染色 | 第44-45页 |
| ·好氧性和厌氧性观察 | 第45页 |
| ·氧化酶反应 | 第45页 |
| ·麦康凯平板上菌落观察 | 第45页 |
| ·接触酶反应 | 第45页 |
| ·果腐杏病原细菌的BIOLOG测定 | 第45-46页 |
| ·果腐杏病原菌的脂肪酸(FAMEs)测定 | 第46页 |
| ·Bcc菌的分子鉴定 | 第46-48页 |
| ·果腐杏病原菌的16S rRNA序列鉴定 | 第46-47页 |
| ·recA基因扩增 | 第47-48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-54页 |
| ·用非培养方法对西湖水中Bcc菌的检测 | 第48页 |
| ·细菌的分离 | 第48-50页 |
| ·Bcc菌的表型鉴定 | 第50页 |
| ·表型初步鉴定 | 第50页 |
| ·杏果腐病原的BIOLOG和脂肪酸鉴定 | 第50页 |
| ·Bcc菌的分子鉴定 | 第50-54页 |
| ·杏果腐病原细菌的16S rRNA序列分析 | 第50-53页 |
| ·Bcc菌群的recA基因扩增 | 第53-54页 |
| ·西湖水中Bcc菌在12个月中的变化动态 | 第54页 |
| 3 讨论 | 第54-58页 |
| ·利用非培养方法检测西湖水中Bcc种群的优缺点 | 第54-55页 |
| ·利用选择性培养基从西湖水中分离Bcc菌的可行性 | 第55-56页 |
| ·Bcc菌群的鉴定及与疑似菌株的区分 | 第56页 |
| ·Bcc菌的存在与水温的关系 | 第56-57页 |
| ·Bcc菌作为杏果的腐烂病原细菌 | 第57-58页 |
| 第三章 洋葱伯克氏菌群的种间分析 | 第58-85页 |
| 1 材料和方法 | 第59-65页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第59页 |
| ·Bcc菌DNA模板的制备和recA基因的扩增 | 第59页 |
| ·限制性酶切长度多态性(RFLP)分析 | 第59页 |
| ·Bcc基因型特异性引物PCR鉴定 | 第59-60页 |
| ·Bcc菌recA基因的克隆 | 第60-63页 |
| ·Bcc菌株recA基因的PCR扩增 | 第60页 |
| ·PCR扩增产物的回收和纯化 | 第60-61页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第61页 |
| ·PCR产物的连接 | 第61页 |
| ·连接产物的转化 | 第61-62页 |
| ·重组质粒的筛选 | 第62-63页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第63页 |
| ·Bcc菌recA基因的序列分析和聚类分析 | 第63-64页 |
| ·多位点序列分型(MLST)分析 | 第64-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-82页 |
| ·Bcc菌recA基因的RFLP分析 | 第65-67页 |
| ·Bcc基因型特异性引物PCR扩增 | 第67-70页 |
| ·Bcc菌recA基因的克隆 | 第70页 |
| ·Bcc菌recA基因序列分析 | 第70-72页 |
| ·Bcc菌的多位点序列分型(MLST)鉴定 | 第72-81页 |
| ·西湖水及其他环境中的Bcc菌的种群分析 | 第81-82页 |
| 3 讨论 | 第82-85页 |
| ·西湖水及其他环境中Bcc种群的多样性 | 第82-83页 |
| ·各种鉴定技术对Bcc的种群研究 | 第83-85页 |
| 第四章 洋葱伯克氏菌群的致病性分析 | 第85-104页 |
| 1 材料和方法 | 第86-89页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第86页 |
| ·Bcc菌的活化和培养 | 第86-87页 |
| ·Bcc菌在洋葱鳞茎上的致病性研究 | 第87页 |
| ·Bcc菌产蛋白酶活性的研究 | 第87-88页 |
| ·BHI脱脂牛奶培养基的制备 | 第87页 |
| ·蛋白酶活性测定 | 第87-88页 |
| ·Bcc菌在苜蓿模型上的毒力研究 | 第88页 |
| ·Bcc菌悬液的准备 | 第88页 |
| ·苜蓿种子的预处理 | 第88页 |
| ·苜蓿幼苗接种 | 第88页 |
| ·Bcc菌毒力基因的检测 | 第88-89页 |
| ·BCESM基因的PCR检测 | 第88-89页 |
| ·cblA基因的PCR检测 | 第89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-101页 |
| ·Bcc菌株对洋葱的致病性 | 第89-97页 |
| ·B.cepacia的菌株对洋葱的致病性 | 第89-91页 |
| ·B.multivorans的菌株对洋葱的致病性 | 第91页 |
| ·B.cenocepacia的菌株对洋葱的致病性 | 第91-93页 |
| ·B.stabilis的菌株对洋葱的致病性 | 第93-94页 |
| ·B.vietnamiensis的菌株对洋葱的致病性 | 第94-95页 |
| ·B.semilanis的菌株对洋葱的致病性 | 第95-96页 |
| ·B.contaminans的菌株对洋葱的致病性 | 第96页 |
| ·不同种的Bcc菌对洋葱的致病差异 | 第96-97页 |
| ·Bcc菌产蛋白酶活性的研究 | 第97-99页 |
| ·洋葱伯克氏菌对苜蓿幼苗的毒力表现 | 第99-100页 |
| ·毒力基因BCESM和cblA基因的PCR检测 | 第100-101页 |
| 3 讨论 | 第101-104页 |
| ·Bcc菌对洋葱的致病性 | 第101页 |
| ·Bcc的产蛋白酶活性 | 第101-102页 |
| ·Bcc菌对苜蓿的致病性 | 第102-103页 |
| ·毒力基因在Bcc菌中的存在 | 第103-104页 |
| 第五章 抗生素和壳聚糖对洋葱伯克氏菌群的敏感性测定 | 第104-116页 |
| 1 材料和方法 | 第105-107页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第105页 |
| ·Bcc菌的活化和培养 | 第105页 |
| ·抗生素和壳聚糖母液的配置 | 第105页 |
| ·细菌悬浮液的制备 | 第105-106页 |
| ·活菌计数方法 | 第106页 |
| ·抗生素和壳聚糖对Bcc菌的抑菌实验 | 第106-107页 |
| 2 结果与分析 | 第107-114页 |
| ·抗生素对Bcc的抑制效果 | 第107-109页 |
| ·壳聚糖对Bcc的抑制效果 | 第109-111页 |
| ·抗生素和壳聚糖抑菌效果的比较 | 第111-114页 |
| 3 讨论 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-135页 |
| 附录 | 第135-138页 |
| 附录-1 博士期间发表论文与专利情况 | 第135-136页 |
| 附录-2 培养基和试剂配方 | 第136-137页 |
| 附录-3 对Burkholderia sp.菌株R456的鉴定 | 第137-138页 |
