| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-26页 |
| 1.1 喹啉概述 | 第12-17页 |
| 1.1.1 喹啉简介 | 第12页 |
| 1.1.2 喹啉的来源及危害 | 第12-13页 |
| 1.1.3 喹啉生物降解菌的研究 | 第13-15页 |
| 1.1.4 喹啉生物降解途径的研究 | 第15-17页 |
| 1.1.5 喹啉生物降解反应器 | 第17页 |
| 1.2 反硝化和反硝化菌的研究 | 第17-22页 |
| 1.2.1 反硝化简介 | 第18页 |
| 1.2.2 反硝化细菌 | 第18-20页 |
| 1.2.3 反硝化功能基因 | 第20-21页 |
| 1.2.4 影响反硝化的因素 | 第21-22页 |
| 1.3 微生物分子生态学研究方法 | 第22-25页 |
| 1.3.1 基于微生物分离培养的方法 | 第22页 |
| 1.3.2 指纹图谱的研究方法 | 第22页 |
| 1.3.3 基于高通量测序技术的研究方法 | 第22-24页 |
| 1.3.4 宏转录组学的研究方法 | 第24-25页 |
| 1.4 本章小结 | 第25-26页 |
| 第二章 反硝化喹啉降解反应器中优势菌的探究 | 第26-48页 |
| 概述 | 第26页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-36页 |
| 2.1.1 喹啉反硝化降解反应器装置 | 第26-27页 |
| 2.1.2 培养实验材料及方法 | 第27-30页 |
| 2.1.3 喹啉降解能力测试 | 第30-32页 |
| 2.1.4 反硝化能力测试 | 第32-33页 |
| 2.1.5 DNA提取 | 第33-34页 |
| 2.1.6 16 S rRNA基因V3-V4区建库和Illumina测序 | 第34-35页 |
| 2.1.7 Illumina测序数据的质控和生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 2.2 结果 | 第36-44页 |
| 2.2.1 反硝化喹啉降解反应器的运行情况 | 第36页 |
| 2.2.2 喹啉降解情况 | 第36-38页 |
| 2.2.3 硝态氮去除情况 | 第38-39页 |
| 2.2.4 测序结果 | 第39页 |
| 2.2.5 Alpa多样性评估 | 第39-40页 |
| 2.2.6 Beta多样性评估 | 第40页 |
| 2.2.7 菌群结构变化 | 第40-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-46页 |
| 2.4 本章小结 | 第46-48页 |
| 第三章 比较转录组学对喹啉厌氧降解基因的初步探索 | 第48-67页 |
| 概述 | 第48页 |
| 3.1 材料与方法 | 第48-53页 |
| 3.1.1 基因差异表达实验 | 第48-50页 |
| 3.1.2 降解能力测试 | 第50-51页 |
| 3.1.3 RNA提取 | 第51-52页 |
| 3.1.4 去除rRNA并建库 | 第52页 |
| 3.1.5 宏转录组测序 | 第52-53页 |
| 3.1.6 数据初步分析 | 第53页 |
| 3.2 结果 | 第53-64页 |
| 3.2.1 降解实验结果 | 第53-55页 |
| 3.2.2 测序数据质量控制 | 第55-56页 |
| 3.2.3 测序数据的初步分析 | 第56-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-65页 |
| 3.4 本章小结 | 第65-67页 |
| 第四章 结束语 | 第67-68页 |
| 4.1 创新点 | 第67页 |
| 4.2 后续研究工作 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68-71页 |
| 参考文献 | 第71-82页 |
| 附录1 缩写和全称 | 第82-84页 |
| 附录2 溶液试剂配方 | 第84-86页 |
| 附录3 仪器设备 | 第86-87页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第87-89页 |