| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 缩略词表 | 第20-21页 |
| 1 绪论 | 第21-54页 |
| 1.1 刺参与刺参养殖业现状 | 第21-28页 |
| 1.1.1 刺参的生物学特征及其营养价值 | 第21-22页 |
| 1.1.2 刺参经济产业的发展与瓶颈分析 | 第22-24页 |
| 1.1.3 弧菌病与刺参腐皮综合征 | 第24-26页 |
| 1.1.4 刺参非特异性免疫 | 第26-28页 |
| 1.2 噬菌体简介 | 第28-41页 |
| 1.2.1 噬菌体重要里程碑式事件 | 第28-29页 |
| 1.2.2 噬菌体分类与生物学特性 | 第29-37页 |
| 1.2.3 弧菌噬菌体基因组研究 | 第37-41页 |
| 1.3 噬菌体防控主要水产养殖类致病菌 | 第41-52页 |
| 1.3.1 水产养殖业抗生素替代的必要性分析 | 第41-42页 |
| 1.3.2 噬菌体防控水产养殖类致病菌 | 第42-48页 |
| 1.3.3 噬菌体在水产养殖业中应用前景 | 第48-49页 |
| 1.3.4 噬菌体保藏 | 第49-52页 |
| 1.4 论文研究目的及内容 | 第52-54页 |
| 2 致病弧菌及其噬菌体的分离纯化与理化性质 | 第54-85页 |
| 2.1 引言 | 第54页 |
| 2.2 实验材料和设备 | 第54-57页 |
| 2.2.1 实验动物 | 第54-55页 |
| 2.2.2 实验条件 | 第55页 |
| 2.2.3 主要试剂 | 第55-56页 |
| 2.2.4 主要仪器设备 | 第56页 |
| 2.2.5 引物合成 | 第56-57页 |
| 2.2.6 溶液配制 | 第57页 |
| 2.3 实验方法 | 第57-65页 |
| 2.3.1 病原菌的分离纯化 | 第57-58页 |
| 2.3.2 病原菌生理生化指标测定 | 第58页 |
| 2.3.3 病原菌形态学鉴定 | 第58页 |
| 2.3.4 病原菌分子生物学鉴定 | 第58-60页 |
| 2.3.5 病原菌的药敏分析 | 第60-61页 |
| 2.3.6 病原菌致病能力检测 | 第61-62页 |
| 2.3.7 宿主菌的非溶源性检测 | 第62页 |
| 2.3.8 裂解性噬菌体筛选分离纯化 | 第62-63页 |
| 2.3.9 噬菌体的扩增与浓缩 | 第63-64页 |
| 2.3.10 噬菌体效价测定 | 第64页 |
| 2.3.11 噬菌体形态学观察 | 第64页 |
| 2.3.12 噬菌体氯仿敏感性测试 | 第64页 |
| 2.3.13 噬菌体宿主谱测定 | 第64页 |
| 2.3.14 噬菌体吸附速率测定 | 第64-65页 |
| 2.3.15 噬菌体一步生长曲线测定 | 第65页 |
| 2.3.16 噬菌体的体外抑菌效率测定 | 第65页 |
| 2.4 实验结果 | 第65-80页 |
| 2.4.1 患病刺参的症状与病原菌菌落形态 | 第65-67页 |
| 2.4.2 两株病原菌的透射电镜观察 | 第67页 |
| 2.4.3 两株病原菌的生理生化指标 | 第67-69页 |
| 2.4.4 两株病原菌的亲缘关系确定 | 第69-70页 |
| 2.4.5 两株病原菌的药物敏感性 | 第70-71页 |
| 2.4.6 两株病原菌的半数致死量与半数致死浓度(LD_(50)) | 第71-74页 |
| 2.4.7 病原菌的非溶源性确定 | 第74页 |
| 2.4.8 噬菌体的噬菌斑形态 | 第74-75页 |
| 2.4.9 噬菌体透射电镜形态 | 第75页 |
| 2.4.10 噬菌体对氯仿的敏感性 | 第75-76页 |
| 2.4.11 噬菌体的宿主谱范围 | 第76-77页 |
| 2.4.12 噬菌体的吸附速率 | 第77-78页 |
| 2.4.13 噬菌体的一步生长曲线 | 第78-79页 |
| 2.4.14 噬菌体的体外抑菌效果 | 第79-80页 |
| 2.5 讨论 | 第80-83页 |
| 2.6 本章小结 | 第83-85页 |
| 3 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3的全基因组测序与注释 | 第85-110页 |
| 3.1 引言 | 第85页 |
| 3.2 实验材料和主要仪器设备 | 第85-87页 |
| 3.2.1 实验菌株与噬菌体 | 第85-86页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第86页 |
| 3.2.3 仪器设备 | 第86页 |
| 3.2.4 溶液配制 | 第86-87页 |
| 3.3 实验方法 | 第87-90页 |
| 3.3.1 vibrio phage Vc1和PVS3噬菌体颗粒的纯化与浓缩 | 第87页 |
| 3.3.2 CsCl等密度梯度离心及回收 | 第87-88页 |
| 3.3.3 两株噬菌体的全基因组DNA提取 | 第88页 |
| 3.3.4 DNA浓度与电泳纯度分析 | 第88页 |
| 3.3.5 两株噬菌体的全基因组测序 | 第88-89页 |
| 3.3.6 两株噬菌体基本生物信息学分析 | 第89-90页 |
| 3.3.7 两株噬菌体全基因组基因功能预测和蛋白图谱注释 | 第90页 |
| 3.3.8 噬菌体的主要功能基因比对与进化分析 | 第90页 |
| 3.4 实验结果 | 第90-106页 |
| 3.4.1 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3的全基因组DNA检测 | 第90-91页 |
| 3.4.2 高通量测序分析数据质检 | 第91-92页 |
| 3.4.3 高通量测序分析基因含量预测 | 第92-93页 |
| 3.4.4 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3的基因分布结果 | 第93-94页 |
| 3.4.5 噬菌体vibrio phageVc1和PVS3的开放阅读框预测 | 第94-95页 |
| 3.4.6 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3的Go数据库分析 | 第95-97页 |
| 3.4.7 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3基因组的功能基因确定 | 第97页 |
| 3.4.8 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3全基因组蛋白图谱 | 第97-103页 |
| 3.4.9 噬菌体vibrio phage Vc1和PVS3的分类地位 | 第103-104页 |
| 3.4.10 噬菌体胞壁水解酶一级与二级蛋白结构 | 第104-106页 |
| 3.5 讨论 | 第106-108页 |
| 3.6 本章小结 | 第108-110页 |
| 4 噬菌体应用剂型的制备及其防控效果评价 | 第110-133页 |
| 4.1 引言 | 第110页 |
| 4.2 实验材料和设备 | 第110-113页 |
| 4.2.1 实验动物 | 第110-111页 |
| 4.2.2 实验用细菌菌株和噬菌体 | 第111页 |
| 4.2.3 主要试剂 | 第111页 |
| 4.2.4 仪器设备 | 第111-112页 |
| 4.2.5 饲料原料 | 第112页 |
| 4.2.6 试剂配制 | 第112-113页 |
| 4.3 实验方法 | 第113-118页 |
| 4.3.1 噬菌体针剂制备 | 第113页 |
| 4.3.2 噬菌体真空冷冻干燥处理最优保护剂选择 | 第113-114页 |
| 4.3.3 噬菌体浸浴制剂的制备 | 第114页 |
| 4.3.4 攻毒用嗜环弧菌VC1和灿烂弧菌VS-ABTNL的制备 | 第114页 |
| 4.3.5 噬菌体针剂对刺参的攻毒治疗效果考察 | 第114-115页 |
| 4.3.6 饲喂噬菌体的饲料制备与基础成分分析 | 第115页 |
| 4.3.7 饲喂噬菌体添加剂对刺参的攻毒保护效果考察 | 第115-116页 |
| 4.3.8 混合噬菌体制剂对刺参的攻毒保护效果考察 | 第116-117页 |
| 4.3.9 刺参养殖水体和刺参肠道噬菌体效价测定 | 第117页 |
| 4.3.10 噬菌体注射针剂的温度与pH耐受性检测 | 第117页 |
| 4.3.11 不同噬菌体制剂的长期保藏效果考察 | 第117-118页 |
| 4.3.12 数据统计分析 | 第118页 |
| 4.4 实验结果 | 第118-128页 |
| 4.4.1 不同保护剂冻干处理对噬菌体效价的影响 | 第118-120页 |
| 4.4.2 不同保护剂处理的噬菌体冻干粉的溶解时间 | 第120-121页 |
| 4.4.3 不同噬菌体冻干处理组的含湿量测定结果 | 第121页 |
| 4.4.4 噬菌体注射治疗效果 | 第121-122页 |
| 4.4.5 新型饲料基础成分分析 | 第122-123页 |
| 4.4.6 嗜环弧菌噬菌体饲喂保护效果 | 第123页 |
| 4.4.7 灿烂弧菌噬菌体饲喂保护效果 | 第123-124页 |
| 4.4.8 浸浴混合噬菌体对刺参的保护效果 | 第124-125页 |
| 4.4.9 饲喂实验中刺参养殖水体和肠道的噬菌体效价检测 | 第125-126页 |
| 4.4.10 浸浴实验中刺参养殖水体和肠道的噬菌体效价检测 | 第126页 |
| 4.4.11 噬菌体注射针剂对温度与pH的耐受性分析 | 第126-128页 |
| 4.4.12 不同噬菌体制剂长期保藏效果比对 | 第128页 |
| 4.5 讨论 | 第128-132页 |
| 4.6 本章小结 | 第132-133页 |
| 5 施用噬菌体对刺参主要生理指标的影响 | 第133-154页 |
| 5.1 引言 | 第133页 |
| 5.2 实验材料与设备 | 第133-135页 |
| 5.2.1 实验动物及菌种、噬菌体 | 第133页 |
| 5.2.2 主要试剂 | 第133-134页 |
| 5.2.3 主要仪器设备 | 第134页 |
| 5.2.4 试剂配制 | 第134-135页 |
| 5.3 实验方法 | 第135-139页 |
| 5.3.1 高纯度噬菌体颗粒制备 | 第135页 |
| 5.3.2 刺参体腔细胞的提取与原代培养 | 第135页 |
| 5.3.3 噬菌体颗粒与刺参体腔细胞共培养 | 第135-136页 |
| 5.3.4 噬菌体对刺参吞噬活性影响的考察 | 第136页 |
| 5.3.5 噬菌体对刺参非特异免疫酶活影响的考察 | 第136页 |
| 5.3.6 饲喂噬菌体对刺参非特异免疫酶活影响的考察 | 第136-137页 |
| 5.3.7 苗期刺参体腔液样本酶活的测定 | 第137页 |
| 5.3.8 考察饲喂噬菌体对刺参生产状态影响 | 第137-138页 |
| 5.3.9 刺参肠道菌群高通量分析样品准备 | 第138页 |
| 5.3.10 生物菌群结构多样性分析 | 第138-139页 |
| 5.3.11 数据统计分析 | 第139页 |
| 5.4 结果 | 第139-149页 |
| 5.4.1 刺参体腔细胞体外培养相对活性检测 | 第139页 |
| 5.4.2 体外共培养噬菌体对刺参体腔细胞的影响 | 第139-141页 |
| 5.4.3 噬菌体共培养对刺参吞噬细胞吞噬活性的影响 | 第141页 |
| 5.4.4 注射噬菌体对刺参主要非特异免疫酶活的影响 | 第141-144页 |
| 5.4.5 饲喂噬菌体对刺参非特异免疫酶活的影响 | 第144-145页 |
| 5.4.6 饲喂噬菌体对刺参生长状态的影响 | 第145-146页 |
| 5.4.7 饲喂噬菌体对刺参肠道菌群结构的影响 | 第146-149页 |
| 5.5 讨论 | 第149-152页 |
| 5.6 本章小结 | 第152-154页 |
| 6 结论与展望 | 第154-157页 |
| 6.1 结论 | 第154-155页 |
| 6.2 创新点 | 第155页 |
| 6.3 展望 | 第155-157页 |
| 参考文献 | 第157-169页 |
| 附录A 嗜环弧菌vibrio phage Vcl ORF在线预测结果 | 第169-170页 |
| 附录B 灿烂弧菌vB_VspS_VS-ABTNL-3(PVS3)ORF在线预测结果 | 第170-171页 |
| 作者简介 | 第171页 |
| 攻读博士学位期间科研项目及科研成果 | 第171-174页 |
| 致谢 | 第174页 |
