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冬虫夏草微生态区系中真菌及PKS、NRPS基因的多样性研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第9-19页
    1.1 冬虫夏草研究概况第9-12页
        1.1.1 分类地位第9页
        1.1.2 地理分布第9页
        1.1.3 冬虫夏草的形态研究第9-10页
        1.1.4 冬虫夏草的生活史第10页
        1.1.5 冬虫夏草的药理作用第10-11页
        1.1.6 冬虫夏草无性型的确定第11页
        1.1.7 中国被毛孢及冬虫夏草相关真菌的开发应用第11-12页
        1.1.8 冬虫夏草微生态区系中真菌多样性第12页
    1.2 微生物多样性的研究方法第12-13页
    1.3 次生代谢产物第13-17页
        1.3.1 聚酮合成酶第14-16页
        1.3.2 非核糖体多肽合成酶第16-17页
    1.4 研究的目的、内容与意义第17-18页
        1.4.1 研究的目的及意义第17页
        1.4.2 研究方案第17-18页
    1.5 技术路线第18-19页
第二章 高通量测序分析冬虫夏草真菌多样性第19-34页
    2.1 材料第19-22页
        2.1.1 样品采集第19-20页
        2.1.2 实验设计第20-21页
        2.1.3 主要仪器设备第21页
        2.1.4 试剂第21页
        2.1.5 DNA提取试剂盒第21-22页
        2.1.6 溶液配制第22页
    2.2 方法第22-25页
        2.2.1 总DNA的提取第22-23页
        2.2.2 高通量测序第23-25页
    2.3 结果与分析第25-32页
        2.3.1 测序数据统计第25-26页
        2.3.2 OTU聚类、注释及多样性分析第26-27页
        2.3.3 稀释曲线第27-28页
        2.3.4 群落结构组分分析第28-31页
        2.3.5 Heatmap热图分析第31-32页
    2.4 讨论第32-33页
    2.5 小结第33-34页
第三章 冬虫夏草周围环境可培养真菌分离及初步鉴定第34-47页
    3.1 材料第34-36页
        3.1.1 样品来源第34页
        3.1.2 主要仪器设备第34页
        3.1.3 试剂第34-35页
        3.1.4 溶液与培养基配制第35-36页
    3.2 方法第36-39页
        3.2.1 样品处理第36页
        3.2.2 真菌分离第36-37页
        3.2.3 菌株的初步分类第37页
        3.2.4 菌株保存方法第37页
        3.2.5 基因组DNA的提取第37-38页
        3.2.6 ITS序列的扩增及测序第38页
        3.2.7 序列分析第38-39页
    3.3 结果与分析第39-43页
        3.3.1 分离菌株的形态第39页
        3.3.2 PCR扩增结果第39-40页
        3.3.3 BLASTn比对结果第40-43页
        3.3.4 冬虫夏草微生态区系真菌的种类第43页
    3.4 讨论第43-45页
    3.5 小结第45-47页
第四章 冬虫夏草可培养真菌PKS和NRPS基因的多样性第47-65页
    4.1 材料第48-49页
        4.1.1 筛选菌株第48页
        4.1.2 主要仪器设备第48页
        4.1.3 试剂第48页
        4.1.4 溶液配制和培养基第48-49页
    4.2 方法第49-53页
        4.2.1 PKS基因检测第49-50页
        4.2.2 NRPS基因检测第50页
        4.2.3 PCR产物的胶回收纯化第50-51页
        4.2.4 连接第51页
        4.2.5 感受态细胞的制备第51页
        4.2.6 转化第51-52页
        4.2.7 阳性克隆的PCR鉴定第52页
        4.2.8 测序及系统发育树分析第52-53页
    4.3 结果与分析第53-63页
        4.3.1 PKS基因的扩增第53-58页
        4.3.2 NRPS基因的扩增第58-63页
    4.4 讨论第63-64页
    4.5 小结第64-65页
第五章 结论与讨论第65-68页
    5.1 结论第65-66页
    5.2 研究展望第66-68页
参考文献第68-79页
附录1 冬虫夏草微生态区系真菌的PKS基因KS结构域序列第79-88页
附录2 冬虫夏草微生态区系真菌的NRPS基因A结构域序列第88-101页
硕士研究生期间发表文章和获奖情况第101-102页
致谢第102页

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