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甘蓝型油菜显性核不育纯合两型系D3AB的细胞学观察与组学分析

摘要第6-9页
Abstract第9-11页
1 文献综述第12-24页
    1.1 甘蓝型油菜显性细胞核雄性不育的研究第12-17页
        1.1.1 显性细胞核雄性不育的概述第12-13页
        1.1.2 单基因控制的显性核不育第13页
        1.1.3 一对复等位基因控制的显性核不育第13页
        1.1.4 双基因控制的显性核不育第13-15页
        1.1.5 显性细胞核雄性不育机理的研究第15-16页
        1.1.6 显性细胞核雄性不育的应用现状第16-17页
    1.2 研究方法综述第17-21页
        1.2.1 转录组测序研究第17-20页
        1.2.2 基因组重测序研究第20-21页
    1.3 本研究的目的及意义第21-24页
2 显性核不育纯合两型系D3AB花发育的细胞学分析第24-30页
    2.1 实验材料第24页
    2.2 实验方法第24-25页
        2.2.0 体视镜镜样品的制备与观察第24-25页
        2.2.1 扫描电镜样品的制备与观察第25页
        2.2.2 石蜡切片的制备与观察第25页
    2.3 结果与分析第25-30页
        2.3.1 纯合两型系D3A和D3B花发育的体视镜观察第25-26页
        2.3.2 纯合两型系D3A和D3B雄蕊扫描电镜观察第26-27页
        2.3.3 纯合两型系D3A和D3B花药石蜡切片观察第27-30页
3 显性核不育纯合两型系D3AB花蕾发育的转录组测序分析第30-42页
    3.1 实验材料第30页
    3.2 实验方法第30-34页
        3.2.1 纯合两型系D3AB花蕾总RNA提取第30页
        3.2.2 cDNA建库测序第30页
        3.2.3 原始数据质量控制第30-31页
        3.2.4 参考基因组比对第31页
        3.2.5 基因表达量计算第31-32页
        3.2.6 差异表达基因筛选第32页
        3.2.7 GO分类注释第32-33页
        3.2.8 KEGG代谢途径富集分析第33-34页
    3.3 结果与分析第34-42页
        3.3.1 测序数据质量控制第34-35页
        3.3.2 数据比对结果统计第35-36页
        3.3.3 差异表达基因筛选第36-39页
        3.3.4 GO功能分析第39-41页
        3.3.5 KEGG代谢途径富集分析第41-42页
4 显性核不育纯合两型系D3AB基因组重测序分析第42-56页
    4.1 实验材料第42页
    4.2 实验方法第42-44页
        4.2.1 纯合两型系D3AB叶片DNA提取第42页
        4.2.2 基因组建库测序第42-43页
        4.2.3 原始数据质量控制及比对分析第43页
        4.2.4 变异位点的检测及注释第43-44页
    4.3 结果与分析第44-56页
        4.3.1 测序数据质量控制第44-45页
        4.3.2 数据比对结果统计第45页
        4.3.3 SNP变异位点分析第45-47页
        4.3.4 InDel变异位点分析第47-49页
        4.3.5 SV变异位点分析第49-51页
        4.3.6 CNV变异位点分析第51-53页
        4.3.7 各变异位点的基因组变异分布密度第53-56页
5 变异候选基因筛选与鉴定第56-60页
    5.1 变异候选基因筛选第56-57页
    5.2 候选基因的qRT-PCR验证分析第57-60页
6 讨论第60-66页
    6.1 纯合两型系D3AB的细胞学分析第60-61页
    6.2 纯合两型系D3AB转录组学分析第61-62页
    6.3 纯合两型系D3AB基因组重测序分析第62-64页
    6.4 纯合两型系D3AB育性候选基因的筛选鉴定第64-66页
7 结论第66-68页
参考文献第68-76页
致谢第76-78页
硕士期间论文发表情况第78页

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