摘要 | 第6-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
1 文献综述 | 第12-24页 |
1.1 甘蓝型油菜显性细胞核雄性不育的研究 | 第12-17页 |
1.1.1 显性细胞核雄性不育的概述 | 第12-13页 |
1.1.2 单基因控制的显性核不育 | 第13页 |
1.1.3 一对复等位基因控制的显性核不育 | 第13页 |
1.1.4 双基因控制的显性核不育 | 第13-15页 |
1.1.5 显性细胞核雄性不育机理的研究 | 第15-16页 |
1.1.6 显性细胞核雄性不育的应用现状 | 第16-17页 |
1.2 研究方法综述 | 第17-21页 |
1.2.1 转录组测序研究 | 第17-20页 |
1.2.2 基因组重测序研究 | 第20-21页 |
1.3 本研究的目的及意义 | 第21-24页 |
2 显性核不育纯合两型系D3AB花发育的细胞学分析 | 第24-30页 |
2.1 实验材料 | 第24页 |
2.2 实验方法 | 第24-25页 |
2.2.0 体视镜镜样品的制备与观察 | 第24-25页 |
2.2.1 扫描电镜样品的制备与观察 | 第25页 |
2.2.2 石蜡切片的制备与观察 | 第25页 |
2.3 结果与分析 | 第25-30页 |
2.3.1 纯合两型系D3A和D3B花发育的体视镜观察 | 第25-26页 |
2.3.2 纯合两型系D3A和D3B雄蕊扫描电镜观察 | 第26-27页 |
2.3.3 纯合两型系D3A和D3B花药石蜡切片观察 | 第27-30页 |
3 显性核不育纯合两型系D3AB花蕾发育的转录组测序分析 | 第30-42页 |
3.1 实验材料 | 第30页 |
3.2 实验方法 | 第30-34页 |
3.2.1 纯合两型系D3AB花蕾总RNA提取 | 第30页 |
3.2.2 cDNA建库测序 | 第30页 |
3.2.3 原始数据质量控制 | 第30-31页 |
3.2.4 参考基因组比对 | 第31页 |
3.2.5 基因表达量计算 | 第31-32页 |
3.2.6 差异表达基因筛选 | 第32页 |
3.2.7 GO分类注释 | 第32-33页 |
3.2.8 KEGG代谢途径富集分析 | 第33-34页 |
3.3 结果与分析 | 第34-42页 |
3.3.1 测序数据质量控制 | 第34-35页 |
3.3.2 数据比对结果统计 | 第35-36页 |
3.3.3 差异表达基因筛选 | 第36-39页 |
3.3.4 GO功能分析 | 第39-41页 |
3.3.5 KEGG代谢途径富集分析 | 第41-42页 |
4 显性核不育纯合两型系D3AB基因组重测序分析 | 第42-56页 |
4.1 实验材料 | 第42页 |
4.2 实验方法 | 第42-44页 |
4.2.1 纯合两型系D3AB叶片DNA提取 | 第42页 |
4.2.2 基因组建库测序 | 第42-43页 |
4.2.3 原始数据质量控制及比对分析 | 第43页 |
4.2.4 变异位点的检测及注释 | 第43-44页 |
4.3 结果与分析 | 第44-56页 |
4.3.1 测序数据质量控制 | 第44-45页 |
4.3.2 数据比对结果统计 | 第45页 |
4.3.3 SNP变异位点分析 | 第45-47页 |
4.3.4 InDel变异位点分析 | 第47-49页 |
4.3.5 SV变异位点分析 | 第49-51页 |
4.3.6 CNV变异位点分析 | 第51-53页 |
4.3.7 各变异位点的基因组变异分布密度 | 第53-56页 |
5 变异候选基因筛选与鉴定 | 第56-60页 |
5.1 变异候选基因筛选 | 第56-57页 |
5.2 候选基因的qRT-PCR验证分析 | 第57-60页 |
6 讨论 | 第60-66页 |
6.1 纯合两型系D3AB的细胞学分析 | 第60-61页 |
6.2 纯合两型系D3AB转录组学分析 | 第61-62页 |
6.3 纯合两型系D3AB基因组重测序分析 | 第62-64页 |
6.4 纯合两型系D3AB育性候选基因的筛选鉴定 | 第64-66页 |
7 结论 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-76页 |
致谢 | 第76-78页 |
硕士期间论文发表情况 | 第78页 |