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超聚硒植物壶瓶碎米荠硒耐受转录组和蛋白组研究

中文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略词表第11-14页
1 前言第14-21页
    1.1 硒的生物学意义第14页
    1.2 植物硒吸收代谢过程第14-17页
        1.2.1 植物硒吸收与转运第14-15页
        1.2.2 植物硒代谢第15-17页
    1.3 超聚硒植物耐、富硒的研究概况第17-18页
    1.4 组学分析方法在植物硒耐受机制研究中的应用第18-20页
        1.4.1 转录组学方法在硒耐受机制研究中的应用第18-19页
        1.4.2 蛋白组学方法在硒耐受机制研究中的应用第19页
        1.4.3 代谢组学方法在硒耐受机制研究中的应用第19-20页
    1.5 本研究的目的和意义第20-21页
2 材料与方法第21-38页
    2.1 碎米荠属植物的来源和取样第21-23页
        2.1.1 碎米荠属植物的来源第21页
        2.1.2 植物培养第21-22页
        2.1.3 转录组测序样品取样第22页
        2.1.4 RNA Seq和蛋白组分析样品处理取样第22-23页
    2.2 菌株、载体、试剂及设备第23-24页
        2.2.1 菌株和载体第23页
        2.2.2 试剂第23页
        2.2.3 设备第23-24页
    2.3 实验方法第24-38页
        2.3.1 植物形态鉴定第24页
        2.3.2 分子系统发育分析第24-30页
        2.3.3 基因表达分析第30-33页
        2.3.4 一般生化特性和硒含量测定第33-36页
        2.3.5 硒形态分析第36-38页
3 结果与分析第38-79页
    3.1 超聚硒植物的分子鉴定第38-41页
        3.1.1 超聚硒植物ITS序列克隆与鉴定第38-39页
        3.1.2 超聚硒植物ITS序列测序与分子系统发育分析第39-41页
    3.2 壶瓶碎米荠硒积累特征第41-45页
        3.2.1 壶瓶碎米荠硒耐受能力分析第41页
        3.2.2 壶瓶碎米荠硒积累动态分析第41-42页
        3.2.3 硒对壶瓶碎米荠一般生理生化特性的影响第42-43页
        3.2.4 壶瓶碎米荠不同硒形态动态变化第43-45页
    3.3 壶瓶碎米荠转录组测序第45-52页
        3.3.1 de novo测序数据与拼接第45-46页
        3.3.2 差异表达基因功能归类第46-49页
        3.3.3 差异表达基因分析第49-52页
    3.4 硒响应基因差异表达分析第52-64页
        3.4.1 所有浓度下对硒响应的基因分析第52-56页
        3.4.2 较低浓度对硒响应的基因分析第56-57页
        3.4.3 高浓度对硒响应的基因分析第57-64页
    3.5 蛋白组学分析第64-76页
        3.5.1 蛋白质鉴定第64-66页
        3.5.2 蛋白质定量分析第66-68页
        3.5.3 蛋白质差异表达分析第68-71页
        3.5.4 差异表达蛋白KEGG分析第71-74页
        3.5.5 含硒肽段分析第74-76页
    3.6 硒响应的转录组和蛋白组关联性分析第76-79页
        3.6.1 转录组和蛋白组硒响应关联性和共表达基因分析第76-77页
        3.6.2 转录组和蛋白组硒响应代谢途径分析第77-79页
4 讨论第79-83页
    4.1 硒酸根是植物体内硒代谢的起始形态第79-80页
    4.2 液泡的贮藏功能在硒耐受机制中扮演重要角色第80页
    4.3 硒化作用是壶瓶碎米荠硒耐受的重要途径第80-81页
    4.4 转氨作用在硒脱毒过程起重要作用第81页
    4.5 含硒蛋白选择性降解是壶瓶碎米荠耐硒的重要保障机制第81-83页
5 参考文献第83-93页
附录Ⅰ 附表第93-103页
附录Ⅱ 作者简介第103-104页
致谢第104-105页

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