| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 矮秆基因的研究和利用现状 | 第11-13页 |
| 1.1.1 矮秆基因对赤霉素的敏感性 | 第11-12页 |
| 1.1.2 矮秆基因对赤霉病的抗性 | 第12-13页 |
| 1.2 作物诱变育种的研究进展 | 第13页 |
| 1.3 BSA类基因定位研究进展 | 第13-17页 |
| 1.3.1 基于标记基因型和性状表现型的BSA | 第14页 |
| 1.3.2 突变基因快速定位法MutMap | 第14-16页 |
| 1.3.3 数量性状基因快速定位法QTL-Seq | 第16-17页 |
| 1.4 小麦胚芽鞘花青素合成基因的简介 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 小麦茎秆快速发育基因qd1的初定位 | 第19-26页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-22页 |
| 2.1.1 材料的种植 | 第19页 |
| 2.1.2 取样、总RNA的提取和BSR-Seq文库的制备 | 第19页 |
| 2.1.3 BSR-Seq测序数据与参考基因组的比对 | 第19-20页 |
| 2.1.4 高质量SNP的筛选 | 第20页 |
| 2.1.5 QTL-Seq基因定位法 | 第20页 |
| 2.1.6 F2群体DNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.1.7 KASP引物设计和SNP基因分型 | 第21-22页 |
| 2.2 结果与分析 | 第22-24页 |
| 2.2.1 测序数据与参考基因组的比对以及高质量SNP的筛选 | 第22页 |
| 2.2.2 qd1基因定位与初定位区间的验证 | 第22-24页 |
| 2.3 讨论 | 第24-26页 |
| 第三章 转录组学分析小麦茎秆快速发育性状 | 第26-34页 |
| 3.1 材料与方法 | 第26-27页 |
| 3.1.1 材料的种植 | 第26页 |
| 3.1.2 取样、总RNA的提取以及文库的制备 | 第26页 |
| 3.1.3 转录组测序数据与参考基因组的比对 | 第26页 |
| 3.1.4 差异表达基因和差异外显子的鉴定与注释 | 第26-27页 |
| 3.1.5 qPCR验证差异表达基因 | 第27页 |
| 3.2 结果与分析 | 第27-32页 |
| 3.2.1 CleanReads与参考基因组的比对 | 第27-28页 |
| 3.2.2 差异表达基因和差异外显子的鉴定 | 第28-29页 |
| 3.2.3 DEG和DEU的联合分析 | 第29-32页 |
| 3.3 讨论 | 第32-34页 |
| 第四章 660KSNP芯片快速定位强光诱导的花青素合成基因 | 第34-42页 |
| 4.1 材料与方法 | 第34-36页 |
| 4.1.1 遗传分离群体的构建 | 第34页 |
| 4.1.2 幼苗培养条件 | 第34页 |
| 4.1.3 花青素的提取和定量分析 | 第34页 |
| 4.1.4 BSA与660KSNP芯片联合分析 | 第34-35页 |
| 4.1.5 基于芯片初始SNP分布的加权算法 | 第35-36页 |
| 4.2 结果与分析 | 第36-40页 |
| 4.2.1 材料表型 | 第36-37页 |
| 4.2.2 SNP加权算法 | 第37页 |
| 4.2.3 候选基因区间的确定 | 第37-40页 |
| 4.3 讨论 | 第40-42页 |
| 第五章 全文结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-53页 |
| 附录 | 第53-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简历 | 第60页 |
