| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 1 绪论 | 第12-24页 |
| 1.1 丹霞梧桐概述 | 第12-14页 |
| 1.1.1 丹霞梧桐的生物学特性 | 第12页 |
| 1.1.2 丹霞梧桐的地理分布 | 第12-13页 |
| 1.1.3 丹霞梧桐的种群特点 | 第13-14页 |
| 1.1.4 丹霞梧桐的保护现状 | 第14页 |
| 1.2 遗传多样性及群体遗传结构 | 第14-17页 |
| 1.2.1 遗传多样性及群体遗传结构的概念 | 第14页 |
| 1.2.2 植物遗传多样性和遗传结构的影响因素 | 第14-17页 |
| 1.2.3 群体遗传结构的度量方法 | 第17页 |
| 1.3 微卫星分子标记 | 第17-21页 |
| 1.3.1 分子标记的类型 | 第17-18页 |
| 1.3.2 微卫星分子标记 | 第18页 |
| 1.3.3 微卫星分子标记开发技术 | 第18-20页 |
| 1.3.4 EST-SSR分子标记的应用 | 第20-21页 |
| 1.4 研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 1.5 技术路线 | 第22-24页 |
| 2 基于转录组数据的丹霞梧桐EST-SSR标记开发 | 第24-40页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第24页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-30页 |
| 2.2.1 总RNA提取 | 第24-26页 |
| 2.2.2 DNA提取及检测 | 第26-28页 |
| 2.2.3 引物设计 | 第28页 |
| 2.2.4 多态性位点检测 | 第28-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-37页 |
| 2.3.1 转录组拼接结果 | 第30-31页 |
| 2.3.2 SSR序列的数量与特征 | 第31-33页 |
| 2.3.3 多态性位点检测结果 | 第33-37页 |
| 2.3.4 多态性位点有效性验证 | 第37页 |
| 2.4 讨论 | 第37-40页 |
| 2.4.1 丹霞梧桐转录组SSR位点特征 | 第37-38页 |
| 2.4.2 提高多态性位点选择效率的方法 | 第38-40页 |
| 3 丹霞梧桐群体遗传多样性及遗传结构 | 第40-62页 |
| 3.1 实验材料 | 第40-41页 |
| 3.1.1 群体采集地概况 | 第40-41页 |
| 3.1.2 实验试剂与仪器 | 第41页 |
| 3.2 实验方法 | 第41页 |
| 3.2.1 DNA提取 | 第41页 |
| 3.2.2 PCR扩增与基因分型 | 第41页 |
| 3.3 数据统计及分析 | 第41-44页 |
| 3.3.1 遗传多样性 | 第41-42页 |
| 3.3.2 种群遗传结构 | 第42-43页 |
| 3.3.3 瓶颈效应检测 | 第43页 |
| 3.3.4 群体分化时间及大小评估 | 第43-44页 |
| 3.4 结果与分析 | 第44-57页 |
| 3.4.1 遗传多样性 | 第44-47页 |
| 3.4.2 群体遗传分化 | 第47-50页 |
| 3.4.3 群体遗传结构 | 第50-54页 |
| 3.4.4 种群瓶颈效应分析 | 第54-55页 |
| 3.4.5 群体分化时间及有效群体大小估测 | 第55-57页 |
| 3.5 讨论 | 第57-62页 |
| 3.5.1 丹霞梧桐的遗传多样性水平 | 第57-59页 |
| 3.5.2 丹霞梧桐群体间遗传结构 | 第59-60页 |
| 3.5.3 群体分化时间及有效群体大小估测 | 第60-62页 |
| 4 丹霞梧桐的保护策略 | 第62-64页 |
| 5 结论与创新 | 第64-66页 |
| 5.1 结论 | 第64-65页 |
| 5.1.1 丹霞梧桐EST-SSR位点开发 | 第64页 |
| 5.1.2 丹霞梧桐的遗传多样性与遗传结构 | 第64-65页 |
| 5.2 创新 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-76页 |
| 附录A | 第76-78页 |
| 附录B | 第78-80页 |
| 附录C | 第80-82页 |
| 附录D (攻读学位期间的主要学术成果) | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84页 |