| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 部分缩写的中英文对照 | 第9-10页 |
| 第一章：文献综述 | 第10-19页 |
| 1. 父源因子的重要作用 | 第10页 |
| 2、精子发生 | 第10-12页 |
| 3、精子RNA的研究进展 | 第12-15页 |
| 3.1 精子RNA的存在 | 第12-13页 |
| 3.2 精子RNA的种类 | 第13-14页 |
| 3.3 精子RNA的功能 | 第14-15页 |
| 4、高通量测序技术 | 第15-17页 |
| 5、本研究的技术路线及目的意义 | 第17-19页 |
| 第二章：实验样品制备及检测 | 第19-27页 |
| 1、实验材料 | 第19-20页 |
| 1.1 实验动物 | 第19页 |
| 1.2 主要试剂 | 第19页 |
| 1.3 主要仪器及器材 | 第19-20页 |
| 1.4 主要试剂配制 | 第20页 |
| 2、试验方法 | 第20-24页 |
| 2.1 高纯度射出精子样品制备 | 第20-21页 |
| 2.2 显微镜检测 | 第21页 |
| 2.3 精子样品总RNA抽提 | 第21页 |
| 2.4 RT-PCR检测 | 第21-24页 |
| 2.4.1 cDNA制备 | 第21-22页 |
| 2.4.2 PCR检测 | 第22-24页 |
| 3、结果与分析 | 第24-27页 |
| 3.1 实验结果 | 第24-25页 |
| 3.1.1 精子样品镜检 | 第24-25页 |
| 3.1.2 RT-PCR检测 | 第25页 |
| 3.2 结果分析 | 第25-27页 |
| 第三章：精子mRNA高通量测序 | 第27-32页 |
| 1、实验材料 | 第27-28页 |
| 1.1 实验样品 | 第27页 |
| 1.2 主要试剂 | 第27页 |
| 1.3 主要仪器 | 第27-28页 |
| 2、试验方法 | 第28-29页 |
| 2.1 总RNA的提取 | 第28页 |
| 2.2 总RNA质检 | 第28页 |
| 2.3 mRNA测序文库构建 | 第28-29页 |
| 2.4 文库质检 | 第29页 |
| 2.5 Cluster生成 | 第29页 |
| 2.6 mRNA上机测序 | 第29页 |
| 3、结果与分析 | 第29-32页 |
| 3.1 实验结果 | 第29-31页 |
| 3.1.1 总RNA质检结果 | 第29-30页 |
| 3.1.2 文库质检结果 | 第30-31页 |
| 3.1.3 数据过滤结果 | 第31页 |
| 3.2 结果分析 | 第31-32页 |
| 第四章 mRNA数据分析与结果 | 第32-44页 |
| 1、材料与方法 | 第32-33页 |
| 1.1 分析平台 | 第32页 |
| 1.2 分析用数据库 | 第32-33页 |
| 1.2.1 数据处理涉及网站及相应数据版本 | 第32-33页 |
| 1.2.2 数据分析使用的软件 | 第33页 |
| 2 分析流程 | 第33-35页 |
| 2.1 利用FastQC对测序数据进行质量检测 | 第33页 |
| 2.2 使用Bowtie2建立比对索引文件 | 第33页 |
| 2.3 使用Tophat对测序序列与基因组进行比对 | 第33-34页 |
| 2.4 使用Cufflinks对比对结果进行组装和定量 | 第34页 |
| 2.5 基因筛选及功能分析 | 第34-35页 |
| 3. 结果与分析 | 第35-44页 |
| 3.1 实验结果 | 第35-42页 |
| 3.1.1 FastQC检测结果 | 第35-36页 |
| 3.1.2 测序序列与基因组比对结果 | 第36-37页 |
| 3.1.3 Cufflinks基因定量结果 | 第37-39页 |
| 3.1.4 功能注释分析 | 第39-42页 |
| 3.2 结果分析 | 第42-44页 |
| 第五章：RT-PCR验证部分基因的表达 | 第44-50页 |
| 1、实验材料 | 第44-45页 |
| 1.1 实验样品 | 第44页 |
| 1.2 主要试剂 | 第44页 |
| 1.3 主要仪器 | 第44-45页 |
| 2、试验方法 | 第45-47页 |
| 2.2 总RNA的提取 | 第45页 |
| 2.3 cDNA制备 | 第45页 |
| 2.4 PCR检测 | 第45-46页 |
| 2.5 PCR反应体系 | 第46-47页 |
| 2.6 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第47页 |
| 3、实验结果与分析 | 第47-50页 |
| 3.1 实验结果 | 第47-49页 |
| 3.1.1 PCR检测结果 | 第47-48页 |
| 3.1.2 测序结构 | 第48-49页 |
| 3.2 结果分析 | 第49-50页 |
| 讨论 | 第50-52页 |
| 全文结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |