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基于ITS和cpDNA分子标记的江西野生寒兰居群遗传结构研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 引言第11-19页
    1.1 兰科植物的概况简介第11-13页
        1.1.1 兰科植物的分类地位及保护现状第11页
        1.1.2 兰科植物的遗传结构和多样性研究第11-13页
    1.2 寒兰概述第13-15页
        1.2.1 寒兰的分类地位第13-14页
        1.2.2 寒兰的生物学特性第14页
        1.2.3 寒兰的研究概况及现状第14-15页
    1.3 ITS 序列和 cpDNA 简介第15-16页
        1.3.1 ITS 序列结构特征第15-16页
        1.3.2 cpDNA 序列结构特征第16页
    1.4 本研究的内容及技术路线第16-17页
    1.5 本研究的目的和研究意义第17-19页
第2章 材料与方法第19-29页
    2.1 实验耗材及仪器设备第19-22页
        2.1.1 样本材料采集第19-20页
        2.1.2 实验所用试剂、药品第20-21页
        2.1.3 实验所需仪器第21页
        2.1.4 实验中各种缓冲液的配制方法第21-22页
    2.2 实验方法第22-26页
        2.2.1 总 DNA 的提取第22页
        2.2.2 DNA 浓度测定( g/ml )第22-23页
        2.2.3 PCR 扩增引物筛选第23-24页
        2.2.4 ITS-PCR 反应扩增体系的建立第24-25页
        2.2.5 cpDNA-PCR 反应扩增体系的建立第25-26页
        2.2.6 PCR 反应的扩增和测序第26页
    2.3 实验数据分析第26-29页
        2.3.1 ITS 和 cpDNA 序列测序结果处理第26页
        2.3.2 居群遗传多样性分析第26-27页
        2.3.3 居群群体遗传结构分析第27页
        2.3.4 聚类分析第27页
        2.3.5 失配分布和中性检验第27-28页
        2.3.6 地理距离和遗传距离的相关性分析第28-29页
第3章 结果与分析第29-48页
    3.1 ITS 序列测序结果的分析第29-37页
        3.1.1 ITS 的序列特征第29-30页
        3.1.2 ITS 类型分布第30-33页
        3.1.3 基于 ITS 遗传多样性分析第33-34页
        3.1.4 基于 ITS 的系统发育学分析第34-35页
        3.1.5 群体遗传结构第35-36页
        3.1.6 失配分布分析和中性检验第36-37页
    3.2 cpDNA 测序结果的分析第37-48页
        3.2.1 cpDNA 片段 petB-petD 序列特征第37-38页
        3.2.2 cpDNA 单倍型和 TCS 网络图第38-41页
        3.2.3 基于 cpDNA 遗传多样性分析第41-42页
        3.2.4 基于 cpDNA 序列的系统发育分析第42-43页
        3.2.5 遗传结构分析第43-44页
        3.2.6 失配分布分析和中性检验第44-45页
        3.2.7 居群间遗传距离和地理距离相关性分析第45-48页
第4章 讨论第48-52页
    4.1 寒兰 ITS 和 cpDNA 扩增体系的优化第48页
    4.2 寒兰 ITS 和 cpDNA 序列特征第48-49页
    4.3 寒兰居群的遗传结构和遗传多样性第49-50页
    4.4 寒兰种质资源的保护第50-52页
第5章 小结与展望第52-54页
    5.1 小结第52-53页
    5.2 展望第53-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-61页
附录第61-63页

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