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链霉菌Streptomyces sp. LZ35菌株的萜类合酶基因的克隆、异源表达和蛋白质结晶

Contents第9-14页
摘要第14-15页
ABSTRACT第15-16页
符号说明第17-19页
第一章 前言第19-31页
    1. 萜类化合物生物合成途径第19-20页
    2. 克隆策略第20-23页
        2.1. 同源序列克隆法第20-21页
        2.2. 染色体步移法第21页
        2.3. 基于生物合成途径的筛选第21-22页
        2.4. 基因组挖掘第22-23页
    3. 微生物萜类合酶第23-29页
        3.1. 真菌第23-26页
        3.2. 细菌第26-29页
    4. 晶体结构第29-30页
    5. 研究展望第30-31页
第二章 链霉菌Streptomyces sp.LZ35菌株的二萜合酶基因的研究第31-80页
    前言第31页
    第一节 二萜合酶cyclooctatin synthase表达体系的构建第31-40页
        1. 实验材料第31-33页
            1.1. 菌株和质粒第31-32页
            1.2. 引物第32页
            1.3. 试剂第32页
            1.4. 仪器第32-33页
        2. 方法第33-38页
            2.1. PCR反应第33-35页
            2.2. PCR产物(或载体)酶切,酶连反应第35-36页
            2.3. DNA片段的回收第36页
            2.4. 大肠杆菌质粒DNA的小量提取第36页
            2.5. 大肠杆菌化学感受态细胞制备第36-37页
            2.6. 质粒DNA的转化(氯化钙法)第37页
            2.7. DNA琼脂糖凝胶电泳第37-38页
        3. 实验结果第38-40页
            3.1. native二萜合酶第38-39页
            3.2. Se-Met二萜合酶第39-40页
    第二节 二萜合酶CYC的蛋白表达和纯化第40-52页
        1. 实验材料第40-43页
            1.1. 常用试剂及配制第40-41页
            1.2. 培养基第41页
            1.3. 缓冲液配制第41-42页
            1.4. 实验仪器第42-43页
        2. 实验方法第43-45页
            2.1. 蛋白异源表达和纯化第43-44页
            2.2. 蛋白SDS-PAGE电泳第44-45页
        3. 实验结果与讨论第45-52页
            3.1. native CYC蛋白的表达、纯化第45-48页
            3.2. Se-Met CYC蛋白衍生物的制备第48-52页
    第三节 二萜合酶CYC晶体的获得和结构解析第52-61页
        1. 实验材料第52-53页
            1.1. 蛋白结晶用试剂和材料第52页
            1.2. 晶体衍射收集数据用仪器和材料第52-53页
        2. 蛋白质结晶实验方法第53-54页
            2.1. 晶体初筛方法:气相扩散技术(Vapor Diffusion Method)第53页
            2.2. 晶体优化方法第53-54页
        3. 实验结果与讨论第54-61页
            3.1. CYC蛋白质晶体的获得第54-57页
            3.2. 晶体结构解析第57-61页
    第四节 CYC蛋白与底物共结晶第61-63页
        1. 实验材料第61页
        2. 实验仪器第61页
        3. 实验方法第61页
        4. 实验结果与讨论第61-63页
            4.1. 底物类似物纯化第61页
            4.2. 共结晶第61-63页
    第五节 二萜合酶基因cyc的过表达第63-69页
        1. 实验材料第63-65页
            1.1. 菌株第63-64页
            1.2. 引物第64页
            1.3. 试剂第64-65页
            1.4. 培养基第65页
            1.5. 实验仪器第65页
        2. 实验方法第65-67页
            2.1. 分子生物学第65页
            2.2. 菌株的培养及保藏第65页
            2.3. 质粒DNA电转化第65-66页
            2.4. 链霉菌基因组DNA快速提取第66页
            2.5. 链霉菌孢子悬液的制备第66页
            2.6. 接合转移第66-67页
        3. 实验结果第67-69页
    第六节 二萜类天然产物的提取纯化第69-78页
        1. 实验材料第70-71页
            1.1. 试剂第70页
            1.2. 常用显色剂第70页
            1.3. 实验仪器第70-71页
        2. 发酵用培养基第71页
        3. 实验方法第71-72页
            3.1. 链霉菌发酵培养和代谢产物提取第71页
            3.2. 天然产物分离纯化方法第71-72页
            3.3. 化合物的结构测定第72页
        4. 实验结果第72-78页
            4.1. 发酵培养和提取代谢产物第72-73页
            4.2. 提取物分离纯化第73-77页
            4.3. 分析讨论第77-78页
    第七节 小结第78-80页
第三章 链霉菌Streptomyces sp.LZ35菌株的两个倍半萜合酶基因的克隆和异源表达第80-93页
    前言第80页
    第一节 倍半萜合酶基因pen的克隆、异源表达和结晶第80-86页
        1. 实验材料第80-81页
            1.1. 质粒和菌株第80-81页
            1.2. 引物第81页
            1.3. 试剂第81页
            1.4. 仪器第81页
            1.5. 培养基第81页
        2. 方法第81页
        3. 实验结果与讨论第81-86页
            3.1. pentalene synthase表达体系的构建第81-82页
            3.2. pentalene synthase的蛋白表达和纯化第82-85页
            3.3. pentalene synthase结晶第85-86页
    第二节 倍半萜合酶基因geo的克隆和异源表达第86-92页
        1. 实验材料第86-87页
            1.1. 质粒和菌株第86页
            1.2. 引物第86页
            1.3. 试剂第86页
            1.4. 仪器第86页
            1.5. 培养基第86-87页
        2. 方法第87页
        3. 实验结果与讨论第87-92页
            3.1. geosmin synthase表达体系的构建第87-88页
            3.2. geosmin synthase的蛋白表达第88-91页
            3.3. 讨论第91-92页
    第三节 小结第92-93页
第四章 总结与展望第93-96页
    一、本论文研究的意义第93页
    二、本论文的主要研究第93-96页
        1. 二萜合酶基因cyclooctatin synthase gene cyc的研究第93-94页
        2. 两个倍半萜合酶基因的克隆和异源表达第94-96页
参考文献第96-106页
研究生期间发表论文第106-107页
致谢第107-109页
学位论文评阅及答辩情况表第109页

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