| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-25页 |
| 1 洋葱简介 | 第13-14页 |
| 1.1 洋葱的起源 | 第13页 |
| 1.2 洋葱的分类 | 第13页 |
| 1.3 洋葱的食用价值 | 第13-14页 |
| 2 花青素及黄酮研究进展 | 第14-16页 |
| 2.1 花青素简介 | 第14页 |
| 2.2 花青素的定量、定性方法 | 第14-15页 |
| 2.3 黄酮简介 | 第15页 |
| 2.4 黄酮的定量、定性方法 | 第15页 |
| 2.5 抗氧化活性研究 | 第15-16页 |
| 3 植物材料RNA提取方法研究进展 | 第16-18页 |
| 3.1 多酚类物质 | 第16-17页 |
| 3.2 多糖类物质 | 第17页 |
| 3.3 葱属植物RNA提取 | 第17-18页 |
| 4 转录组测序研究进展 | 第18-21页 |
| 4.1 转录组及RNA-Seq概述 | 第18-19页 |
| 4.2 RNA-Seq在园艺上的应用 | 第19-20页 |
| 4.2.1 获得序列和注释转录本 | 第19页 |
| 4.2.2 分子标记开发和应用 | 第19-20页 |
| 4.2.3 功能基因的挖掘和基因差异表达分析 | 第20页 |
| 4.3 洋葱转录组研究进展 | 第20-21页 |
| 5 植物类黄酮生物合成及调控研究进展 | 第21-22页 |
| 5.1 类黄酮合成途径相关结构基因及其酶研究 | 第21-22页 |
| 5.1.1 查尔酮合成酶 | 第21-22页 |
| 5.1.2 查尔酮异构酶 | 第22页 |
| 5.1.3 黄酮醇合成酶 | 第22页 |
| 5.1.4 二氢黄酮醇还原酶 | 第22页 |
| 6 本研究目的和意义 | 第22-25页 |
| 第二章 三种不同颜色洋葱黄酮和花青素含量、组份及抗氧化活性研究 | 第25-37页 |
| 1 材料与方法 | 第27-29页 |
| 1.1 试验材料与化学试剂 | 第27页 |
| 1.2 洋葱花青素及黄酮提取 | 第27页 |
| 1.3 HPLC-DAD和HPLC-ESI-MS分析 | 第27-28页 |
| 1.4 花青素含量测定 | 第28页 |
| 1.5 黄酮含量测定 | 第28页 |
| 1.6 总酚含量测定 | 第28页 |
| 1.7 抗氧化活性测定 | 第28-29页 |
| 1.7.1 DPPH值测定 | 第28-29页 |
| 1.7.2 ABTS值测定 | 第29页 |
| 1.7.3 总抗氧化能力的测定 | 第29页 |
| 1.8 数据分析 | 第29页 |
| 2 结果分析与讨论 | 第29-35页 |
| 2.1 花青素和黄酮含量 | 第29-30页 |
| 2.2 HPLC-DAD和HPLC-ESI-MS分析洋葱中花青素和黄酮组成分析 | 第30-33页 |
| 2.3 总酚含量和抗氧化活性研究 | 第33-34页 |
| 2.4 相关性分析 | 第34-35页 |
| 3 小结 | 第35-37页 |
| 第三章 洋葱不同组织RNA提取方法比较分析 | 第37-45页 |
| 1 材料与方法 | 第38-40页 |
| 1.1 试验材料 | 第38-39页 |
| 1.2 RNA提取方法 | 第39-40页 |
| 1.2.1 TaKaRa试剂盒 | 第39页 |
| 1.2.2 Tiangene试剂盒 | 第39页 |
| 1.2.3 Trizol法 | 第39页 |
| 1.2.4 pBIOZOL法 | 第39-40页 |
| 1.3 总RNA的完整性及质量检测 | 第40页 |
| 1.4 RT-PCR检测 | 第40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-42页 |
| 2.1 不同方法提取的洋葱RNA的凝胶电泳分析 | 第40-41页 |
| 2.2 不同方法提取洋葱RNA质量浓度和纯度的检测 | 第41-42页 |
| 2.3 RT-PCR检测mRNA的质量 | 第42页 |
| 3 讨论与结论 | 第42-45页 |
| 第四章 三种不同颜色洋葱转录组分析 | 第45-61页 |
| 1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 1.1 供试材料 | 第46页 |
| 1.2 试验方法 | 第46-48页 |
| 1.2.1 总RNA的提取 | 第46页 |
| 1.2.2 数据过滤及组装 | 第46-47页 |
| 1.2.3 Unigene功能注释和分类 | 第47页 |
| 1.2.4 基因表达量计算及差异表达基因筛选 | 第47页 |
| 1.2.5 差异基因功能注释 | 第47-48页 |
| 1.2.6 Unigene SSR及SNP分析 | 第48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-57页 |
| 2.1 Illumina测序和从头组装 | 第48-49页 |
| 2.2 Unigene功能注释 | 第49-52页 |
| 2.2.1 COG功能注释 | 第49-51页 |
| 2.2.2 NR分类注释 | 第51-52页 |
| 2.2.3 GO功能注释分析 | 第52页 |
| 2.3 Unigene表达差异分析 | 第52-54页 |
| 2.3.1 差异表达基因 | 第52-53页 |
| 2.3.2 差异表达基因GO功能分析 | 第53页 |
| 2.3.3 KEGG pathway富集分析 | 第53-54页 |
| 2.4 类黄酮生物合成途径差异表达基因筛选 | 第54-56页 |
| 2.5 Unigene SSR分析 | 第56-57页 |
| 2.6 Unigene SNP分析 | 第57页 |
| 3 讨论 | 第57-61页 |
| 全文结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 论文发表情况 | 第71-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
