| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-23页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-18页 |
| 1.1.1 环肽纳米管简介 | 第10-11页 |
| 1.1.2 水分子在环肽纳米管中的传输扩散 | 第11-13页 |
| 1.1.3 药物分子及气体小分子在环肽纳米管中的传输扩散 | 第13-15页 |
| 1.1.4 单组分醇类分子以及醇/水混合物在纳米管中的传输扩散 | 第15-18页 |
| 1.2 课题的提出以及研究的主要内容 | 第18-20页 |
| 参考文献 | 第20-23页 |
| 第二章 分子动力学模拟及相关研究方法 | 第23-36页 |
| 2.1 分子动力学模拟简介 | 第23页 |
| 2.2 分子动力学模拟基本原理 | 第23-28页 |
| 2.2.1 牛顿运动方程 | 第23-25页 |
| 2.2.2 分子力场 | 第25-26页 |
| 2.2.3 MD模拟中的时间步长 | 第26页 |
| 2.2.4 周期性边界条件 | 第26-28页 |
| 2.2.5 MD模拟中常用系综 | 第28页 |
| 2.3 MD模拟的步骤 | 第28-31页 |
| 2.4 MD模拟常用软件简介 | 第31-35页 |
| 参考文献 | 第35-36页 |
| 第三章 有机小分子在跨膜环肽纳米管中的传输性质 | 第36-62页 |
| 3.1 引言 | 第36-37页 |
| 3.2 模拟体系和研究方法 | 第37-41页 |
| 3.2.1 MD模拟体系 | 第37-38页 |
| 3.2.2 恒速拉伸分子动力学（cv-SMD）模拟 | 第38-39页 |
| 3.2.3 平均力势（PMF） | 第39-40页 |
| 3.2.4 模拟细节 | 第40-41页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第41-58页 |
| 3.3.1 客体分子通过环八肽纳米管的平均力势(PMF) | 第41-42页 |
| 3.3.2 客体分子与CPNT管壁以及水分子间的静电相互作用和范德华相互作用 | 第42-45页 |
| 3.3.3 客体分子在管内的轴向分布及轴向运动 | 第45-48页 |
| 3.3.4 CPNT内客体分子的取向 | 第48-52页 |
| 3.3.5 客体分子与肽管管壁及周围水分子间的氢键相互作用 | 第52-56页 |
| 3.3.6 客体分子与肽管管壁间的水桥作用 | 第56-58页 |
| 3.4 本章小结 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-62页 |
| 第四章 醇/水混合物在跨膜环八肽纳米管中的扩散以及不同结构的环肽纳米管对甲醇/水混合物的分离 | 第62-85页 |
| 4.1 引言 | 第62-64页 |
| 4.2 模拟体系和研究方法 | 第64-67页 |
| 4.2.1 MD模拟体系 | 第64-66页 |
| 4.2.2 模拟细节 | 第66-67页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第67-81页 |
| 4.3.1 醇/水混合物在跨膜环八肽纳米管中的吸附 | 第67-70页 |
| 4.3.2 醇/水混合物在跨膜环八肽纳米管中的扩散 | 第70-72页 |
| 4.3.3 五种环八肽纳米管的平衡结构 | 第72-75页 |
| 4.3.4 不同种类的环八肽纳米管对甲醇/水混合物的分离 | 第75-79页 |
| 4.3.5 甲醇和水分子在五个 CPNTs 内的分布特征 | 第79-81页 |
| 4.4 本章小结 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-85页 |
| 全文结论 | 第85-87页 |
| 攻读学位期间本人参与发表的论文 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
