| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 符号及缩写说明 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-21页 |
| 1.1 骨相关疾病 | 第12页 |
| 1.2 双膦酸类药物 | 第12-18页 |
| 1.2.1 双膦酸类药物的发展 | 第12-15页 |
| 1.2.2 双膦酸类药物的构效关系 | 第15-16页 |
| 1.2.3 双膦酸类药物的作用机制 | 第16-18页 |
| 1.3 立题依据和意义 | 第18-19页 |
| 1.4 研究内容 | 第19-21页 |
| 第二章 理论研究方法 | 第21-31页 |
| 2.1 引言 | 第21-22页 |
| 2.2 定量构效关系 | 第22-24页 |
| 2.2.1 2D-QSAR | 第22-23页 |
| 2.2.2 3D-QSAR | 第23-24页 |
| 2.3 分子对接 | 第24-25页 |
| 2.4 量子力学方法 | 第25-26页 |
| 2.4.1 从头算方法 | 第25页 |
| 2.4.2 密度泛函理论 | 第25-26页 |
| 2.4.3 半经验方法 | 第26页 |
| 2.5 分子动力学方法 | 第26-29页 |
| 2.6 ONIOM方法 | 第29-31页 |
| 第三章 唑来膦酸结构、光谱和性质的研究 | 第31-53页 |
| 3.1 引言 | 第31页 |
| 3.2 计算方法 | 第31-32页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第32-51页 |
| 3.3.1 几何结构 | 第32-35页 |
| 3.3.2 红外、拉曼及NMR光谱 | 第35-39页 |
| 3.3.3 几何结构的溶剂化影响 | 第39-41页 |
| 3.3.4 红外光谱的溶剂化影响 | 第41-43页 |
| 3.3.5 热力学性质 | 第43-45页 |
| 3.3.6 分子表面静电势 | 第45-47页 |
| 3.3.7 前沿分子轨道 | 第47-49页 |
| 3.3.8 NBO与AIM分析 | 第49-51页 |
| 3.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 唑来膦酸二聚体结构和性质的研究 | 第53-72页 |
| 4.1 引言 | 第53页 |
| 4.2 计算方法 | 第53-55页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第55-71页 |
| 4.3.1 二聚体几何结构 | 第55-59页 |
| 4.3.2 分子间相互作用能 | 第59-60页 |
| 4.3.3 红外光谱 | 第60-61页 |
| 4.3.4 热力学性质 | 第61-64页 |
| 4.3.5 分子间氢键分析 | 第64-71页 |
| 4.4 本章小结 | 第71-72页 |
| 第五章 含氮双膦酸类FPPS抑制剂的 3D-QSAR研究 | 第72-83页 |
| 5.1 引言 | 第72页 |
| 5.2 研究方法 | 第72-76页 |
| 5.2.1 数据采集 | 第72-75页 |
| 5.2.2 分子构建与叠合 | 第75页 |
| 5.2.3 3D-QSAR模型构建 | 第75-76页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第76-82页 |
| 5.3.1 3D-QSAR模型分析 | 第76-77页 |
| 5.3.2 三维系数等势图分析 | 第77-80页 |
| 5.3.3 新化合物的设计 | 第80-82页 |
| 5.4 本章小结 | 第82-83页 |
| 第六章 含氮双膦酸类化合物与FPPS的分子对接研究 | 第83-91页 |
| 6.1 引言 | 第83页 |
| 6.2 分子对接方法 | 第83-85页 |
| 6.2.1 受体结构准备 | 第83-84页 |
| 6.2.2 配体分子准备 | 第84-85页 |
| 6.2.3 CDOCKER分子对接 | 第85页 |
| 6.3 分子对接结果与分析 | 第85-90页 |
| 6.4 本章小结 | 第90-91页 |
| 第七章 含氮双膦酸类化合物与FPPS作用机制的MD研究 | 第91-103页 |
| 7.1 引言 | 第91页 |
| 7.2 计算细节 | 第91-92页 |
| 7.3 结果与讨论 | 第92-102页 |
| 7.3.1 体系稳定性分析 | 第92-95页 |
| 7.3.2 配体与受体相互作用能分析 | 第95-98页 |
| 7.3.3 配体与残基氢键分析 | 第98-102页 |
| 7.4 本章小结 | 第102-103页 |
| 第八章 含氮双膦酸类化合物与FPPS作用机制的ONIOM研究 | 第103-113页 |
| 8.1 引言 | 第103页 |
| 8.2 计算方法 | 第103-104页 |
| 8.3 结果与分析 | 第104-112页 |
| 8.3.1 RMSD分析 | 第104-106页 |
| 8.3.2 结合能分析 | 第106-107页 |
| 8.3.3 与残基的相互作用分析 | 第107-112页 |
| 8.4 本章小结 | 第112-113页 |
| 第九章 主要结果与展望 | 第113-116页 |
| 9.1 主要结果 | 第113-115页 |
| 9.2 展望 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-130页 |
| 附录一: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第130-131页 |
| 附录二: 论文相关图表 | 第131-139页 |
