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Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1基因的克隆及其结构蛋白的生物学特性预测

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第一章 文献综述第11-23页
    1 鸭肝炎的流行和历史分布第11-12页
        1.1 Ⅰ型鸭肝炎(Duck Hepatitis TypeⅠ)第11页
        1.2 Ⅱ型鸭肝炎(Duck Hepatitis TypeⅡ)第11页
        1.3 Ⅲ型鸭肝炎(Duck Hepatitis TypeⅢ)第11-12页
        1.4 Ⅰ型鸭肝炎变异株或新型鸭肝炎第12页
    2 鸭肝炎的病原特性第12-15页
        2.1 Ⅰ型鸭肝炎第12-14页
        2.2 Ⅱ型鸭肝炎第14页
        2.3 Ⅲ型鸭肝炎第14-15页
    3 Ⅰ型鸭肝炎病毒病的诊断第15-17页
        3.1 Ⅰ型鸭肝炎病毒的分离和鉴定第15页
        3.2 Ⅰ型鸭肝炎病毒病血清学诊断第15-17页
        3.3 Ⅰ型鸭肝炎病毒病鉴别诊断第17页
    4 Ⅰ型鸭肝炎病毒分子生物研究现状第17-19页
    5 PCR技术的研究进展第19-21页
        5.1 PCR技术的基本原理第19-20页
        5.2 逆转录PCR第20-21页
    6 RT-PCR技术在Ⅰ型鸭肝炎病毒病诊断中的应用第21-23页
第二章 RT-PCR方法检测Ⅰ型鸭肝炎病毒第23-34页
    1 材料第23-24页
        1.1 毒株第23页
        1.2 实验动物第23页
        1.3 质粒第23页
        1.4 菌株第23页
        1.5 试剂第23页
        1.6 主要仪器第23-24页
    2 方法第24-28页
        2.1 病毒的增值和纯化第24页
        2.2 引物设计第24页
        2.3 病毒总RNA的提取第24-25页
        2.4 Ⅰ型鸭肝炎病毒目的片段的扩增(RT-PCR)第25-26页
        2.5 RT-PCR的敏感性检测第26页
        2.6 RT-PCR的特异性检测第26-28页
    3 结果与分析第28-31页
        3.1 目的片段PCR扩增结果第28-29页
        3.2 RT-PCR的敏感检测第29-30页
        3.3 RT-PCR的特异性检测第30页
        3.4 目的片段的序列测定结果第30-31页
    4 讨论:第31-34页
        4.1 Ⅰ型鸭肝炎病毒的引物设计和扩增第31-32页
        4.2 RT-PCR检测方法的灵敏度和特异性第32页
        4.3 RT-PCR检测方法的优越性第32页
        4.4 影响RT-PCR检测结果的因素第32-33页
        4.5 检测方法分析第33-34页
第三章 Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1基因克隆与序列分析第34-51页
    1 材料和方法第34页
        1.1 材料第34页
        1.2 主要仪器第34页
    2 方法第34-40页
        2.1 引物设计与合成第34页
        2.2 病毒核酸的提取第34-35页
        2.3 Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1基因的扩增(RT-PCR)第35-36页
        2.4 DHV-1(疫苗株)VP1基因的克隆第36-40页
    3 结果和分析第40-48页
        3.1 VP1基因RT-PCR扩增结果第40页
        3.2 VP1基因产物胶回收鉴定第40-41页
        3.3 重组质粒的酶切鉴定第41页
        3.4 VP1基因测序及序列分析第41-48页
    4 讨论第48-51页
        4.1 小RNA病毒与DHV-Ⅰ的关系第48-49页
        4.2 小RNA病毒基因组的主要结构特点第49页
        4.3 DHV-ⅠVP1基因的克隆测序分析第49-51页
第四章 Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1蛋白理化性质、二级结构及其它生物学特性的预测第51-58页
    1 材料和方法第52页
        1.1 Ⅰ型鸭肝炎病毒VP1蛋白的氨基酸序列第52页
        1.2 VP1蛋白理化性质分析第52页
        1.3 VP1蛋白的二级结构预测第52页
        1.4 VP1蛋白B细胞抗原表位的预测第52页
    2 结果与分析第52-57页
        2.1 VP1蛋白理化性质分析第53页
        2.2 VP1蛋白的二级结构预测第53-54页
        2.3 VP1蛋白抗原肽指数预测第54页
        2.4 VP1蛋白的亲水性预测第54-55页
        2.5 VP1蛋白的表面可能性分析第55-56页
        2.6 VP1蛋白骨架区的柔韧性分析第56页
        2.7 VP1蛋白B细胞抗原表位的预测分析第56-57页
    3 讨论第57-58页
结论第58-59页
参考文献第59-64页
附录一:pET-32a(+)质粒图谱第64-65页
附录二:DHV-Ⅰ疫苗株的VP1基因的核苷酸序列第65页
附录三:DHV-Ⅰ疫苗株的VP1基因的氨基酸序列第65-66页
附录四:有关试剂和溶液配制第66-67页
致谢第67页

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