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棉纤维发育相关基因的克隆及表达分析

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
引言第14-21页
第一章 糖基转移酶基因和肌动蛋白解聚因子基因的克隆第21-47页
    1 材料和方法第21-33页
        1.1 试验材料第21-22页
            1.1.1 供试植物材料第21页
            1.1.2 试剂材料第21页
            1.1.3 基因组PCR及RT-PCR引物第21-22页
        1.2 试验方法第22-33页
            1.2.1 基因组DNA的大量提取方法第22页
            1.2.2 总RNA的提取及质量检测方法第22-24页
            1.2.3 GbGAUT1和GbADF1的分离方法第24-27页
            1.2.4 cDNA全长的获得第27-33页
    2 结果与分析第33-43页
        2.1 糖基转移酶8基因家族基因组片段的获得和同源性分析第33-36页
            2.1.1 糖基转移酶8基因家族基因组片段的获得第33-34页
            2.1.2 糖基转移酶8基因家族基因组片段克隆序列的同源性分析第34-36页
            2.1.3 基因组扩增片段的比较分析第36页
        2.2 GbGAUT1基因全长cDNA的获得第36-40页
            2.2.1 海岛棉纤维RNA提取分析第36-37页
            2.2.2 电子拼接和RT-PCR扩增部分cDNA序列第37-39页
            2.2.3 利用 3′RACE获得基因的 3′端第39-40页
            2.2.4 利用 5′RACE获得基因的 5′端第40页
        2.3 GbADF1基因组片段的获得和同源性分析第40-43页
            2.3.1 GbADF1基因组片段的获得第40-41页
            2.3.2 克隆序列的全序列分析第41-43页
    3 讨论第43-46页
        3.1 关于糖基转移酶8基因家族第43页
        3.2 关于全长基因的获得方法第43-44页
        3.3 关于肌动蛋白解聚因子基因结构分析第44-46页
    4 小结第46-47页
第二章 GbGAUT1和GbADF1的生物信息学分析及表达分析第47-72页
    1 材料和方法第47-49页
        1.1 试验材料第47页
            1.1.1 供试植物材料第47页
            1.1.2 试剂材料第47页
        1.2 试验方法第47-49页
            1.2.1 生物信息学分析方法第47-48页
            1.2.2 Pima90-53棉苗种植第48页
            1.2.3 Pima90-53幼苗根茎叶RNA的提取第48页
            1.2.4 半定量RT-PCR方法第48-49页
    2 结果与分析第49-66页
        2.1 GbGAUT1基因的生物信息学分析第49-57页
            2.1.1 GbGAUT1氨基酸序列分析第49-50页
            2.1.2 蛋白跨膜区域分析第50页
            2.1.3 信号肽分析第50-51页
            2.1.3 亲/疏水性分析第51-52页
            2.1.4 模体预测第52-53页
            2.1.5 二级结构分析第53-54页
            2.1.5 二硫键预测第54-55页
            2.1.6 钙调素结合位点预测第55页
            2.1.7 同源基因系统进化分析第55-57页
        2.2 GbADF1基因的生物信息学分析第57-64页
            2.2.1 氨基酸序列分析第57-58页
            2.2.2 肽链的亲/疏水性分析第58-59页
            2.2.3 蛋白模体分析第59页
            2.2.4 蛋白跨膜区域分析第59-60页
            2.2.4 钙调素结合位点预测第60页
            2.2.5 结构分析第60-61页
            2.2.6 基因同源性和系统进化分析第61-63页
            2.2.7 3-D模型预测第63-64页
        2.3 基因表达特异性分析第64-66页
            2.3.1 cDNA模板浓度和最佳循环数的确定第64页
            2.3.2 GbGAUT1基因表达特异性分析第64-65页
            2.3.3 GbADF1基因表达特异性分析第65-66页
    3 讨论第66-71页
        3.1 关于GbGAUT1与纤维发育关系的分析第66-68页
        3.2 关于生物信息学分析第68-69页
        3.3 关于半定量RT-PCR第69页
        3.4 关于GbADF1与纤维长度的关系及其氨基酸序列分析第69-71页
    4 小结第71-72页
第三章 原核表达载体的构建及表达检测第72-86页
    1 材料和方法第72-78页
        1.1 试验材料第72页
        1.2 试验方法第72-78页
            1.2.1 GbGAUT1基因原核表达载体的构建方法第72-74页
            1.2.2 GbADF1基因原核表达载体的构建方法第74-76页
            1.2.3 重组蛋白的诱导表达方法第76-77页
            1.2.4 SDS-PAGE电泳第77页
            1.2.5 剥胶第77页
            1.2.6 固定和染色第77页
            1.2.7 凝胶的脱色第77-78页
    2 结果与分析第78-83页
        2.1 GbGAUT1基因原核表达第78-80页
            2.1.1 GbGAUT1原核表达载体的构建第78-79页
            2.1.2 GbGAUT1原核诱导表达分析第79-80页
        2.2 GbADF1基因原核表达第80-83页
            2.2.1 GbADF1原核表达载体的构建第80页
            2.2.2 原核表达载体和目标基因的连接第80-81页
            2.2.3 GbADF1原核诱导表达分析第81-83页
    3 讨论第83-85页
    4 小结第85-86页
第四章 真核表达载体的构建及遗传转化第86-103页
    1 材料和方法第86-95页
        1.1 试验材料第86页
        1.2 试验方法第86-95页
            1.2.1 GbGAUT1基因真核表达载体的构建方法第86-88页
            1.2.2 GbADF1基因真核表达载体的构建方法第88-90页
            1.2.3 真核表达载体的农杆菌转化方法第90-91页
            1.2.4 遗传转化材料的获得第91-93页
            1.2.4 农杆菌转化拟南芥第93页
            1.2.5 农杆菌转化烟草第93-94页
            1.2.6 农杆菌转化棉花胚性愈伤第94-95页
    2 结果与分析第95-101页
        2.1 GbGAUT1基因真核表达载体的构建第95-96页
            2.1.1 GbGAUT1中间重组子的构建第95-96页
            2.1.2 真核表达载体和目的基因的连接第96页
        2.2 GbADF1基因真核表达载体的构建第96-98页
            2.2.1 GbADF1中间重组子的构建第96-97页
            2.2.2 真核表达载体和目的基因的连接第97-98页
        2.3 农杆菌的鉴定第98-99页
        2.4 烟草遗传转化植株的获得第99页
        2.5 棉花胚性愈伤和再生植株的获得第99-101页
    3 讨论第101-102页
    4 小结第102-103页
结论第103-105页
参考文献第105-112页
附录I 试验所用试剂配方第112-115页
附录II RACE原理示意图第115-116页
附录III 试验中所用载体结构示意图第116-117页
附录IV第117-118页
在读期间发表论文第118-119页
作者简历第119-121页
致谢第121-122页
附件第122页

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