| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一部分 | 第10-35页 |
| 第一章 研究背景简介 | 第10-16页 |
| 1、线虫的危害与防治 | 第10页 |
| 2、食线虫真菌侵染线虫的过程及分子机制 | 第10-12页 |
| 3、DNA甲基化的研究进展 | 第12-14页 |
| 4、展望 | 第14-16页 |
| 第二章 材料和方法 | 第16-20页 |
| 1、材料 | 第16-17页 |
| 1.1 、实验菌株和线虫 | 第16页 |
| 1.2 、实验用溶剂及培养基配方 | 第16页 |
| 1.3 、主要试剂和配方 | 第16页 |
| 1.4 、实验仪器和设备 | 第16-17页 |
| 2 方法 | 第17-20页 |
| 2.1 秀丽隐杆线虫提取物的制备 | 第17-18页 |
| 2.1.1 秀丽隐杆线虫的培养 | 第17页 |
| 2.1.2 秀丽隐杆线虫提取物(Caenorhabditis elegans extract)制备 | 第17-18页 |
| 2.2 寡孢节丛孢普通营养菌丝的培养及收集 | 第18页 |
| 2.3 寡孢节丛孢产捕器菌丝的诱导和收集 | 第18页 |
| 2.4 寡孢节丛孢普通菌丝与产捕器菌丝DNA的提取 | 第18-19页 |
| 2.5 寡孢节丛孢甲基化组图谱绘制 | 第19页 |
| 2.6 生物信息学和统计学分析 | 第19-20页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第20-34页 |
| 1、寡孢节丛孢甲基化组数据概述 | 第20-21页 |
| 2、寡孢节丛孢基因组甲基化水平 | 第21-22页 |
| 3、基因组甲基化胞嘧啶分布特征 | 第22页 |
| 4、差异甲基化区域分析 | 第22-34页 |
| 第四章 展望和讨论 | 第34-35页 |
| 第二部分 | 第35-65页 |
| 第五章 研究背景简介 | 第35-39页 |
| 1、自然选择信号 | 第35-36页 |
| 2、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶研究进展 | 第36页 |
| 3、展望 | 第36-39页 |
| 第六章 材料与方法 | 第39-58页 |
| 1、材料 | 第39页 |
| 1.1 细胞系和质粒 | 第39页 |
| 1.1.1 细胞系 | 第39页 |
| 1.1.2 质粒 | 第39页 |
| 1.2 实验试剂 | 第39页 |
| 2 主要实验仪器与设备 | 第39-40页 |
| 3 实验方法 | 第40-58页 |
| 3.1 生物信息学分析 | 第40页 |
| 3.2 测序 | 第40-44页 |
| 3.3 分子克隆 | 第44-50页 |
| 3.3.1 获得目的片段 | 第44-45页 |
| 3.3.2 构建重组质粒 | 第45-47页 |
| 3.3.3 鉴定重组质粒转化子 | 第47-48页 |
| 3.3.4 重组质粒的提取 | 第48页 |
| 3.3.5 转染 | 第48-49页 |
| 3.3.6 荧光双报告检测 | 第49-50页 |
| 3.4 突变生成 | 第50-52页 |
| 3.4.1 扩增目的片段 | 第51-52页 |
| 3.4.2 KLD反应 | 第52页 |
| 3.4.3 转化与重组质粒的提取 | 第52页 |
| 3.4.4 转染与荧光双报告检测 | 第52页 |
| 3.5 染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP) | 第52-58页 |
| 3.5.1 交联和裂解 | 第53-54页 |
| 3.5.2 超声破碎DNA | 第54页 |
| 3.5.3 特异抗体与染色质复合物的结合 | 第54-55页 |
| 3.5.4 沉淀产物的洗脱 | 第55-56页 |
| 3.5.5 染色质复合物的解交联 | 第56页 |
| 3.5.6 DNA片段的纯化和回收 | 第56页 |
| 3.5.7 qPCR定量分析 | 第56-58页 |
| 第七章 结果和讨论 | 第58-64页 |
| 7.1 、生物信息学分析结果 | 第58-59页 |
| 7.2 、分子克隆、突变生成和荧光素酶表达分析 | 第59-61页 |
| 7.3 、ChIP实验结果 | 第61-64页 |
| 第八章 展望和讨论 | 第64-65页 |
| 附录 | 第65-67页 |
| 附录1 论文中使用的缩写及英文对照 | 第65-66页 |
| 附录2 常用数据库与网上生物学资源 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-69页 |
| 硕士在读期间参与基金项目、发表论文、荣誉与奖励 | 第69-70页 |
| 参与的基金项目 | 第69页 |
| 发表和投稿的论文 | 第69页 |
| 荣誉与奖励 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
