致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
图表目录 | 第14-15页 |
1 绪论 | 第15-25页 |
1.1 研究目的和意义 | 第15-16页 |
1.2 生物学网络信息数据库概览 | 第16-23页 |
1.2.1 生物数据库的整合 | 第17-18页 |
1.2.2 生物网络概念和分类 | 第18-21页 |
1.2.3 生物信息的可视化 | 第21页 |
1.2.4 典型的可视化生物网络数据库 | 第21-23页 |
1.3 研究方法和流程 | 第23-25页 |
2 基因网络信息搜索引擎BiopubInfo的构建 | 第25-55页 |
2.1 概念数据的构建方法和流程 | 第25-27页 |
2.1.1 物种 | 第25-26页 |
2.1.2 基因和蛋白质 | 第26页 |
2.1.3 化合物和药物 | 第26页 |
2.1.4 其他概念信息 | 第26-27页 |
2.2 关系数据的构建方法和流程 | 第27-39页 |
2.2.1 生物学通路与基因的关系数据 | 第30-31页 |
2.2.2 基因共表达网络 | 第31-39页 |
2.3 搜索引擎服务框架的构建 | 第39-43页 |
2.3.1 硬件和操作系统 | 第39-40页 |
2.3.2 图数据库 | 第40-42页 |
2.3.3 Web服务和网页前端 | 第42-43页 |
2.4 BiopubInfo界面和使用简介 | 第43-49页 |
2.4.1 搜索方式 | 第43-44页 |
2.4.2 结果展示 | 第44-49页 |
2.4.3 导出功能 | 第49页 |
2.5 BiopubInfo的优化 | 第49-52页 |
2.5.1 展示界面和搜索结果优化 | 第50-51页 |
2.5.2 系统服务优化 | 第51-52页 |
2.6 讨论 | 第52-55页 |
3 全基因组关联分析及结果的验证和挖掘 | 第55-73页 |
3.1 引言 | 第55-56页 |
3.2 二型糖尿病全基因组关联分析结果的验证和挖掘 | 第56-64页 |
3.2.1 引言 | 第56-58页 |
3.2.2 数据来源和统计分析结果 | 第58-60页 |
3.2.3 应用BiopubInfo进行验证与挖掘 | 第60-63页 |
3.2.4 讨论 | 第63-64页 |
3.3 尼古丁依赖的全基因组关联分析结果的验证和挖掘 | 第64-73页 |
3.3.1 引言 | 第64-65页 |
3.3.2 数据和统计分析结果 | 第65-69页 |
3.3.3 BiupubInfo的验证与挖掘结果 | 第69-71页 |
3.3.4 讨论 | 第71-73页 |
参考文献 | 第73-83页 |
个人简历 | 第83-84页 |
附件 | 第84页 |