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克雷伯氏肺炎杆菌中目的基因整合于题基因组的表达与相关启动子的分析

摘要第5-6页
abstract第6页
第1章 前言第10-20页
    1.1 克雷伯氏肺炎杆菌第10页
    1.2 克雷伯氏肺炎杆菌的工业应用第10-12页
        1.2.1 利用克雷伯氏肺炎杆菌发酵生产1,3-丙二醇第10-11页
        1.2.2 利用克雷伯氏肺炎杆菌发酵生产2,3-丁二醇第11-12页
        1.2.3 利用克雷伯氏肺炎杆菌发酵生产3-羟基丙酸第12页
    1.3 克雷伯氏肺炎杆菌的代谢工程改造第12-13页
        1.3.1 克雷伯氏肺炎杆菌中基因敲除的研究第12-13页
        1.3.2 克雷伯氏肺炎杆菌中目的基因强化表达的研究第13页
    1.4 同源重组技术的应用第13-16页
        1.4.1 同源重组技术第13页
        1.4.2 同源重组技术的关键蛋白第13-14页
        1.4.3 同源重组技术应用于基因敲除第14-15页
        1.4.4 同源重组技术应用于基因组整合第15-16页
    1.5 不同启动子分析比较的研究第16-17页
    1.6 常用的报告基因第17-18页
        1.6.1 荧光素酶基因第17页
        1.6.2 碱性磷酸酶基因第17-18页
        1.6.3 绿色荧光蛋白基因第18页
        1.6.4 β-半乳糖苷酶基因第18页
    1.7 本课题研究内容及意义第18-20页
第2章 材料与方法第20-34页
    2.1 材料第20-25页
        2.1.1 菌株与质粒第20-21页
        2.1.2 引物第21-22页
        2.1.3 限制性内切酶、Marker等分子生物学试剂第22页
        2.1.4 主要化学试剂第22-24页
        2.1.5 培养基配方及抗生素浓度第24页
        2.1.6 主要仪器第24-25页
        2.1.7 应用软件及程序第25页
    2.2 实验方法第25-34页
        2.2.1 微生物培养第25页
        2.2.2 菌株保藏第25页
        2.2.3 K. pneumoniae基因组的抽提第25-26页
        2.2.4 PCR扩增目的片段第26-27页
        2.2.5 DNA琼脂糖凝胶电泳第27页
        2.2.6 PCR产物的纯化与回收第27-28页
        2.2.7 质粒抽提第28-29页
        2.2.8 DNA的双酶切第29页
        2.2.9 DNA片段的连接第29页
        2.2.10 大肠杆菌DH5α感受态的制备第29-30页
        2.2.11 热激法转化操作第30页
        2.2.12 K.pneumoniae感受态的制备第30-31页
        2.2.13 K.pneumoniae电转化操作第31页
        2.2.14 电转杯的处理方法第31-32页
        2.2.15 阳性克隆的筛选方法第32页
        2.2.16 聚丙烯酰胺凝胶电泳第32页
        2.2.17 β-半乳糖苷酶的酶活测定第32-33页
        2.2.18 发酵实验方法第33页
        2.2.19 产物分析NAD与NADH的测定第33-34页
第3章 利用Red重组系统将目的基因整合于基因组中进行表达第34-48页
    3.1 前言第34页
    3.2 Red同源重组系统应用于目的基因的实验设计第34-36页
        3.2.1 打靶片段的设计第34-35页
        3.2.2 替换基因(敲除基因)的选择第35-36页
        3.2.3 目的基因的选择第36页
    3.3 用于基因组整合的打靶片段的构建第36-41页
        3.3.1 K. pneumoniae基因组抽提第36-37页
        3.3.2 pETbud::dhaT质粒构建第37页
        3.3.3 打靶片段构建第37-40页
        3.3.4 三步PCR法获得打靶片段第40-41页
    3.4 利用Red重组技术进行基因整合第41-44页
        3.4.1 pKD46-Tc质粒导入K.pneumoniae KG2菌株第41-42页
        3.4.2 打靶片段的电转第42-43页
        3.4.3 抗性基因的移除第43-44页
    3.5 整合dhaT基因后克雷伯氏肺炎杆菌KG3-2特性鉴定第44-45页
    3.6 讨论第45-47页
    3.7 本章小结第47-48页
第4章 不同启动子在克雷伯氏肺炎杆菌中的表达分析第48-61页
    4.1 前言第48页
    4.2 不同启动子表达载体的构建第48-53页
        4.2.1 lacZ基因的扩增第48-49页
        4.2.2 pETbud::lacZ和pETtac::lacZ构建第49-51页
        4.2.3 pETT5::lacZ构建第51-53页
    4.3 不同启动子在LB培养基中的分析第53-57页
        4.3.1 启动子的选择第53页
        4.3.2 不同启动子在克雷伯氏肺炎杆菌中强弱的定量分析第53-55页
        4.3.3 培养过程中启动子在克雷伯氏肺炎杆菌的稳定性第55-57页
    4.4 不同启动子在不同碳源培养基中的分析第57-58页
    4.5 讨论第58-60页
    4.6 本章小结第60-61页
第5章 总结与展望第61-63页
    5.1 结论第61页
    5.2 展望第61-63页
参考文献第63-71页
致谢第71页

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