| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 综述 | 第9-20页 |
| 1.1 极端环境和极端微生物 | 第9-10页 |
| 1.2 高温微生物及其研究意义 | 第10-12页 |
| 1.3 栖热菌类群及其研究进展 | 第12-14页 |
| 1.4 绿弯菌门潜在新纲TK17类群 | 第14-15页 |
| 1.5 美国大盆地(Great Basin)地热区 | 第15-17页 |
| 1.6 美国大盆地(Great Basin)地热区热泉微生物研究进展 | 第17-19页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第19-20页 |
| 第二章 美国大盆地四热泉可培养高温细菌多样性分析 | 第20-41页 |
| 2.1 热泉样点基本信息及样品采集 | 第20-22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 分离培养基 | 第22-23页 |
| 2.2.2 分离方法及培养条件 | 第23页 |
| 2.2.3 菌株的纯化与保藏 | 第23-24页 |
| 2.2.4 菌株基因组DNA的提取以及16S rRNA基因的扩增与测序 | 第24页 |
| 2.2.5 菌株16S rRNA基因序列处理与多样性分析 | 第24页 |
| 2.2.6 基于菌株16S rRNA基因序列的初步鉴定与系统发育分析 | 第24-25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25-40页 |
| 2.3.1 分离菌株多样性及系统发育分析 | 第25-34页 |
| 2.3.2 不同样点之间分离菌株多样性比较 | 第34-36页 |
| 2.3.3 不同培养温度之间分离菌株多样性比较 | 第36-37页 |
| 2.3.4 不同分离培养基之间分离菌株多样性比较 | 第37-38页 |
| 2.3.5 潜在新分类单元 | 第38页 |
| 2.3.6 美国大盆地与中国腾冲热泉可培养细菌多样性比较 | 第38-40页 |
| 2.4 本章小结 | 第40-41页 |
| 第三章 美国大盆地热泉Thermus类群多样性及其潜在生态功能研究 | 第41-59页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-44页 |
| 3.1.1 实验菌株与培养 | 第41页 |
| 3.1.2 Thermus菌株多样性分析 | 第41-42页 |
| 3.1.3 Thermus菌株反硝化功能检测 | 第42页 |
| 3.1.4 Thermus菌株铁还原功能检测 | 第42页 |
| 3.1.5 Thermus菌株砷氧化功能检测 | 第42-43页 |
| 3.1.6 Thermus菌株硫氧化与还原功能检测 | 第43-44页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第44-57页 |
| 3.2.1 Thermus菌株多样性评价 | 第44-52页 |
| 3.2.2 Thermus菌株反硝化特性 | 第52-53页 |
| 3.2.3 Thermus菌株铁还原特性 | 第53-55页 |
| 3.2.4 Thermus菌株砷氧化特性 | 第55-56页 |
| 3.2.5 Thermus菌株硫氧化与还原特性 | 第56-57页 |
| 3.3 本章小结 | 第57-59页 |
| 第四章 Thermus属两个新菌株的鉴定及全基因组分析 | 第59-80页 |
| 4.1 材料与方法 | 第59-66页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第59页 |
| 4.1.2 菌株培养特征及形态观察 | 第59-60页 |
| 4.1.3 菌株生理生化特征实验 | 第60-61页 |
| 4.1.4 菌株化学分类特征实验 | 第61-65页 |
| 4.1.5 菌株分子分类特征 | 第65-66页 |
| 4.1.6 菌株L198~T全基因组测序与拼装 | 第66页 |
| 4.1.7 菌株L198~T全基因组注释与分析 | 第66页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第66-79页 |
| 4.2.1 菌株系统发育位置 | 第66-68页 |
| 4.2.2 菌株培养特征及形态 | 第68-69页 |
| 4.2.3 菌株生理生化特征 | 第69-70页 |
| 4.2.4 菌株化学分类特征 | 第70-72页 |
| 4.2.5 菌株L198~T全基因组特征与分析 | 第72-79页 |
| 4.2.6 菌种描述 | 第79页 |
| 4.3 本章小结 | 第79-80页 |
| 第五章 绿弯菌门潜在新纲TK17的全基因组及生态分布研究 | 第80-91页 |
| 5.1 材料与方法 | 第80-81页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第80页 |
| 5.1.2 菌株G233培养特征及形态观察 | 第80页 |
| 5.1.3 菌株G233系统发育分析 | 第80页 |
| 5.1.4 绿弯菌门TK17生态分布分析 | 第80-81页 |
| 5.1.5 菌株G233全基因组测序、拼装、注释与分析 | 第81页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第81-90页 |
| 5.2.1 菌株G233培养特征及形态 | 第81页 |
| 5.2.2 菌株G233系统发育位置 | 第81-84页 |
| 5.2.3 绿弯菌门TK17生态分布 | 第84-86页 |
| 5.2.4 菌株G233全基因组特征 | 第86-90页 |
| 5.3 本章小结 | 第90-91页 |
| 总结与展望 | 第91-94页 |
| 参考文献 | 第94-104页 |
| 成果目录 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
