| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| 1 研究背景 | 第9页 |
| 2 黄瓜白粉病菌 | 第9-11页 |
| 2.1 病原菌及生理小种分化 | 第9-10页 |
| 2.2 黄瓜白粉病的发生和危害 | 第10页 |
| 2.3 黄瓜抗白粉病研究进展 | 第10-11页 |
| 3 染色体片段代换系 | 第11-13页 |
| 3.1 染色体片段代换系的概念 | 第11页 |
| 3.2 染色体片段代换系的构建 | 第11-12页 |
| 3.3 染色体片段代换系的优点 | 第12页 |
| 3.4 染色体片段代换系的应用 | 第12-13页 |
| 4 高通量测序技术体系和主要应用 | 第13-15页 |
| 4.1 高通量测序技术原理 | 第13-14页 |
| 4.2 全基因组重测序 | 第14页 |
| 4.3 全基因组重测序的应用 | 第14-15页 |
| 5 植物抗病基因(R基因)的研究进展 | 第15-17页 |
| 5.1 植物抗病的方式 | 第15-16页 |
| 5.2 植物抗病基因的结构与分类 | 第16页 |
| 5.3 NBS-LRR类抗病基因的结构及功能研究 | 第16-17页 |
| 5.4 NBS-LRR类抗病基因的表达研究 | 第17页 |
| 6 荧光定量PCR技术 | 第17-18页 |
| 7 研究的目的意义 | 第18-19页 |
| 第二章 利用全基因组重测序技术鉴定黄瓜染色体片段代换系中抗白粉病候选基因 | 第19-34页 |
| 1、材料与方法 | 第19-24页 |
| 1.1 SSL508-28染色体片段代换系白粉病抗性鉴定 | 第19-20页 |
| 1.1.1 实验材料 | 第19页 |
| 1.1.2 白粉菌接种及病情指数统计 | 第19-20页 |
| 1.2 D8与SSL508-28的深度重测序 | 第20-24页 |
| 1.2.1 实验流程 | 第20页 |
| 1.2.2 信息分析流程 | 第20-21页 |
| 1.2.3 测序数据的质量控制 | 第21-22页 |
| 1.2.4 与参考基因组比对 | 第22-23页 |
| 1.2.5 SNP检测与注释 | 第23-24页 |
| 1.2.6 InDel检测与注释 | 第24页 |
| 1.2.7 DNA水平变异基因分析 | 第24页 |
| 2、结果与分析 | 第24-32页 |
| 2.1 SSL508-28染色体片段代换系白粉病抗性鉴定 | 第24-25页 |
| 2.2 SSL508-28与D8的全基因组重测序 | 第25-32页 |
| 2.2.1 样品测序数据的统计 | 第25-26页 |
| 2.2.2 比对黄瓜参考基因组确定样品中存在的SNP和InDel变异位点 | 第26页 |
| 2.2.3 样品中存在的SNP和InDel变异位点在染色体上的分布情况 | 第26-28页 |
| 2.2.4 差异SNP和InDel注释 | 第28页 |
| 2.2.5 SSL508-28与D8间SNP和InDel的探究及注释 | 第28-29页 |
| 2.2.6 SSL508-28与D8间差异基因及抗病候选基因的确定 | 第29-32页 |
| 3、讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 候选基因表达验证及克隆 | 第34-41页 |
| 1、材料与方法 | 第34-37页 |
| 1.1 候选基因在SSL508-28和D8中的表达分析 | 第34-36页 |
| 1.1.1 实验材料 | 第34页 |
| 1.1.2 实验方法 | 第34-36页 |
| 1.2 候选基因在不同黄瓜抗感白粉病品种的表达分析 | 第36页 |
| 1.3 Csa2M435460.1与Csa5M579560.1的克隆 | 第36-37页 |
| 2、结果与分析 | 第37-39页 |
| 2.1 候选基因在SSL508-28和D8中的表达 | 第37-38页 |
| 2.2 候选基因在黄瓜不同抗感品种中的表达 | 第38页 |
| 2.3 Csa2M435460.1与Csa5M579560.1在SSL508-28与D8中的克隆 | 第38-39页 |
| 3、讨论 | 第39-41页 |
| 全文结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第52-53页 |
