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桑树中一种新病毒和一种小分子环状RNA的研究

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 前言第13-38页
    1.1 桑花叶卷叶病的历史记载第13-14页
    1.2 桑花叶卷叶病的症状及发生情况第14-15页
    1.3 桑花叶卷叶病的病原的研究现状第15-16页
    1.4 桑树病毒的研究进展第16-17页
    1.5 线虫传多面体病毒属病毒的研究第17-26页
        1.5.1 线虫传多面体病毒属病毒的分类地位及分类依据第17-19页
        1.5.2 线虫传多面体病毒的基因组结构特征与功能第19-23页
        1.5.3 线虫传多面体病毒的传播途径第23页
        1.5.4 线虫传多面体病毒的检测第23-26页
    1.6 植物病毒卫星RNA的研究第26-29页
        1.6.1 植物病毒卫星RNA的分类第26-27页
        1.6.2 环状单链卫星RNA的二级结构第27页
        1.6.3 环状单链卫星RNA的复制第27-29页
    1.7 类病毒的研究第29-35页
        1.7.1 类病毒的分类、结构第30-31页
        1.7.2 类病毒的复制、移动和传播第31-32页
        1.7.3 类病毒的检测第32-35页
    1.8 环状单链卫星RNA与类病毒的区别第35-36页
    1.9 小分子环状RNA侵染性克隆第36页
    1.10 本研究的目的和意义第36-38页
2 桑花叶卷叶病叶中一种新发现的病毒的研究第38-77页
    2.1 材料和方法第39-54页
        2.1.1 样品的采集第39页
        2.1.2 试剂和菌株第39页
        2.1.3 桑叶总RNA提取第39-40页
        2.1.4 病毒dsRNA的提取第40-41页
        2.1.5 粗提纯病毒样品的制备及电子显微镜观察第41页
        2.1.6 病毒RNA的提取第41页
        2.1.7 引物合成第41-42页
        2.1.8 随机锚定引物RT-PCR扩增病毒基因组第42-43页
        2.1.9 5',3'-RACE第43-46页
        2.1.10 序列分析第46-48页
        2.1.11 RT-PCR检测第48-49页
        2.1.12 琼脂糖凝胶电泳分析第49页
        2.1.13 Western blot第49-50页
        2.1.14 MMLRaV抗血清的制备第50-53页
        2.1.15 生物接种实验第53-54页
    2.2 结果第54-72页
        2.2.1 粗提纯病毒样品的电子显微镜观察第54-55页
        2.2.2 桑叶总RNA的质量检测第55页
        2.2.3 cDNA合成和锚定随机引物的扩增第55-56页
        2.2.4 5',3'-RACE第56-58页
        2.2.5 病毒基因组序列分析第58-63页
        2.2.6 运动蛋白和外壳蛋白之间的切割位点第63-65页
        2.2.7 MMLRaV基因组RNA1和RNA2的3'-UTR核苷酸序列分析第65页
        2.2.8 生物接种实验第65-66页
        2.2.9 大田中MMLRaV的RT-PCR检测第66-67页
        2.2.10 MMLRaV抗血清的制备第67-72页
    2.3 讨论第72-77页
3 桑花叶卷叶病叶中一种小分子环状RNA的研究第77-108页
    3.1 材料和方法第77-90页
        3.1.1 实验材料第77-78页
        3.1.2 主要试剂第78页
        3.1.3 桑树中小分子RNA的提取第78-79页
        3.1.4 5%往返聚丙烯酰胺凝胶电泳第79页
        3.1.5 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳第79页
        3.1.6 mscRNA的纯化第79页
        3.1.7 mscRNA的分子量大小评估第79-80页
        3.1.8 引物的合成第80页
        3.1.9 mscRNA的cDNA合成、克隆和测序第80-83页
        3.1.10 两步法RT-PCR第83-84页
        3.1.11 单管一步RT-PCR第84-85页
        3.1.12 PCR产物纯化、重组质粒的构建、重组质粒的提取第85页
        3.1.13 DIG标记的RNA探针的制备第85页
        3.1.14 Dot blot和Northern blot杂交第85-86页
        3.1.15 mscRNA二级结构及锤头型核酶结构预测第86页
        3.1.16 mscRNA侵染性克隆的构建第86-89页
        3.1.17 mscRNA的接种第89-90页
    3.2 结果与分析第90-104页
        3.2.1 mscRNA的2D-PAGE分析及纯化第90页
        3.2.2 mscRNA的分子量大小评估第90-91页
        3.2.3 mscRNA分子的cDNA合成、克隆及测序第91-93页
        3.2.4 mscRNA链极性的确定以及二级结构预测第93-94页
        3.2.5 mscRNA正链上的锤头型核酶第94-97页
        3.2.6 mscRNA序列多样性分析第97-98页
        3.2.7 mscRNA侵染性克隆的构建第98页
        3.2.8 mscRNA的生物学鉴定第98页
        3.2.9 单管一步RT-PCR检测体系的建立第98-100页
        3.2.10 单管一步RT-PCR、Dot blot和Northern blot在mscRNA检测中的应用第100-104页
    3.3 讨论第104-108页
全文总结第108-111页
    1 桑花叶卷叶病叶中一种新病毒的研究第108-109页
    2 桑小分子环状RNA的研究第109页
    3 今后研究的重点及展望第109-111页
参考文献第111-124页
附录1 缩略词第124-125页
附录2 MMLRaV RNA1和RNA2的序列第125-131页
附录3 分子生物学试剂购置及通用试剂的配制第131-136页
致谢第136页

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