摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
第一章 引言 | 第12-23页 |
1 副溶血弧菌研究概况 | 第12-13页 |
1.1 副溶血弧菌简介 | 第12页 |
1.2 副溶血弧菌的分布范围 | 第12页 |
1.3 副溶血弧菌的致病性 | 第12-13页 |
1.4 副溶血弧菌对水产养殖业的危害 | 第13页 |
1.5 副溶血弧菌的防治 | 第13页 |
2 噬菌体的研究进展 | 第13-21页 |
2.0 噬菌体的分类 | 第14-18页 |
2.1 噬菌体的感染方式 | 第18-19页 |
2.2 噬菌体的应用 | 第19-20页 |
2.2.1 细菌的分类鉴定应用 | 第19页 |
2.2.2 分子生物学研究应用 | 第19页 |
2.2.3 细菌感染的治疗应用 | 第19-20页 |
2.2.4 食品保护剂应用 | 第20页 |
2.2.5 水处理 | 第20页 |
2.3 噬菌体治疗优势 | 第20-21页 |
2.3.1 解决耐药性问题 | 第20页 |
2.3.2 无残留 | 第20页 |
2.3.3 噬菌体的来源丰富 | 第20-21页 |
2.4 噬菌体应用的不足 | 第21页 |
2.4.1 裂解谱范围窄 | 第21页 |
2.4.2 噬菌体的制备条件要求高 | 第21页 |
2.5 噬菌体未来发展趋势 | 第21页 |
2.5.1 扩大噬菌体制剂的裂解范围 | 第21页 |
2.5.2 內溶素的研究 | 第21页 |
3 本研究的目的及意义 | 第21-23页 |
第二章 副溶血弧菌Vp13烈性噬菌体筛选及鉴定 | 第23-30页 |
1 材料与方法 | 第23-26页 |
1.1 材料 | 第23-24页 |
1.1.1 菌株 | 第23页 |
1.1.2 水样的采集 | 第23-24页 |
1.1.3 培养基与试剂 | 第24页 |
1.1.4 实验仪器 | 第24页 |
1.2 方法 | 第24-26页 |
1.2.1 噬菌体分离筛选 | 第24-25页 |
1.2.2 噬菌体SX-2 和SX-F的纯化 | 第25页 |
1.2.3 噬菌体SX-2 和SX-F效价的测定 | 第25页 |
1.2.4 噬菌体SX-2 和SX-F的电镜观察 | 第25页 |
1.2.5 噬菌体SX-2 和SX-F增殖液制备 | 第25页 |
1.2.6 噬菌体SX-2 和SX-F核酸类型鉴定 | 第25-26页 |
2 结果 | 第26-28页 |
2.0 噬菌体SX-2 和SX-F的筛选 | 第26页 |
2.1 噬菌体SX-2 和SX-F效价 | 第26页 |
2.2 噬菌体SX-2 和SX-F电镜观察 | 第26-27页 |
2.3 噬菌体SX-2 和SX-F核酸类型鉴定 | 第27-28页 |
3 讨论 | 第28-30页 |
第三章 噬菌体SX-2 和SX-F的生物学特性研究 | 第30-40页 |
1 材料与方法 | 第30-32页 |
1.1 材料 | 第30页 |
1.1.1 菌株 | 第30页 |
1.1.2 培养基与试剂 | 第30页 |
1.1.3 实验仪器 | 第30页 |
1.2 方法 | 第30-32页 |
1.2.1 噬菌体SX-2 和SX-F增殖液制备 | 第30-31页 |
1.2.2 噬菌体SX-2 和SX-F效价测定 | 第31页 |
1.2.3 噬菌体SX-2 和SX-F裂解谱的测定 | 第31页 |
1.2.4 噬菌体SX-2 和SX-F最佳感染复数测定(MOI) | 第31页 |
1.2.5 噬菌体SX-2 和SX-F保存条件比较 | 第31页 |
1.2.6 噬菌体SX-2 和SX-F热稳定性测定 | 第31页 |
1.2.7 噬菌体SX-2 和SX-F pH稳定性测定 | 第31页 |
1.2.8 噬菌体SX-2 和SX-F一步生长曲线测定 | 第31-32页 |
2 结果 | 第32-38页 |
2.1 噬菌体SX-2 和SX-F效价测定 | 第32页 |
2.2 噬菌体SX-2 和SX-F最佳感染复数测定(MOI) | 第32-33页 |
2.3 噬菌体SX-2 和SX-F一步生长曲线测定 | 第33-34页 |
2.4 噬菌体SX-2 和SX-F裂解谱的测定 | 第34-35页 |
2.5 噬菌体SX-2 和SX-F热稳定性测定 | 第35-36页 |
2.6 噬菌体SX-2 和SX-F pH稳定性测定 | 第36-38页 |
2.7 噬菌体SX-2 和SX-F甘油保存条件比较 | 第38页 |
3 讨论 | 第38-40页 |
第四章 噬菌体SX-2 和SX-F对人工感染Vp13斑马鱼的保护效果研究 | 第40-50页 |
1. 材料与方法 | 第40-43页 |
1.1 材料 | 第40-41页 |
1.1.1 菌株 | 第40页 |
1.1.2 斑马鱼 | 第40页 |
1.1.3 培养基与试剂 | 第40-41页 |
1.1.4 实验仪器 | 第41页 |
1.2 方法 | 第41-43页 |
1.2.1 副溶血弧菌Vp13的培养及生长曲线的测定 | 第41页 |
1.2.2 SX-2 和SX-F对弧菌Vp13生长的影响 | 第41页 |
1.2.3 Vp13人工感染斑马鱼 | 第41-42页 |
1.2.4 SX-2 和SX-F对斑马鱼急性毒性试验 | 第42页 |
1.2.5 SX-2 和SX-F对感染副溶血弧菌Vp13斑马鱼的保护浓度关系 | 第42-43页 |
1.2.6 SX-2 和SX-F对感染副溶血弧菌Vp13斑马鱼保护与时间关系研究 | 第43页 |
2 结果 | 第43-48页 |
2.1 Vp13的生长曲线 | 第43-45页 |
2.2 SX-2 和SX-F对弧菌生长的影响 | 第45-46页 |
2.3 SX-2 和SX-F对人工感染Vp13斑马鱼的保护效果 | 第46-48页 |
2.3.1 副溶血弧菌Vp13在 96h内对斑马鱼半致死浓度LC50 | 第46页 |
2.3.2 SX-2 和SX-F对斑马鱼急性毒性试验 | 第46页 |
2.3.3 SX-2 和SX-F对感染副溶血弧菌Vp13斑马鱼保护效果浓度依赖关系 | 第46-47页 |
2.3.4 SX-2 和SX-F对感染副溶血弧菌Vp13斑马鱼保护时间依赖关系 | 第47-48页 |
3 讨论 | 第48-50页 |
第五章 SX-2 和SX-F噬菌体基因组测序分析 | 第50-77页 |
1 实验仪器及材料 | 第50-51页 |
1.1 材料 | 第50-51页 |
1.1.1 噬菌体 | 第50页 |
1.1.2 培养基与试剂 | 第50页 |
1.1.3 实验仪器 | 第50-51页 |
1.2 方法 | 第51页 |
1.2.1 SX-2 和SX-F核酸提取 | 第51页 |
1.2.2 噬菌体基因组测序及分析 | 第51页 |
1.2.3 生物信息分析 | 第51页 |
2 结果 | 第51-76页 |
2.1 噬菌体SX-2 和SX-F核酸提取 | 第51-52页 |
2.2 SX-2 和SX-F基因组测序 | 第52-58页 |
2.2.1 原始测序数据质控 | 第52-55页 |
2.2.2 SX-2 和SX-F测序数据统计 | 第55页 |
2.2.3 基因组组装 | 第55-58页 |
2.3 基因组分析 | 第58-76页 |
2.3.1 tRNA查找 | 第58页 |
2.3.2 SX-2 和SX-F基因预测 | 第58-59页 |
2.3.3 COG功能分析 | 第59-60页 |
2.3.4 噬菌体SX-2 和SX-F的ORFs的功能分类 | 第60-75页 |
2.3.5 噬菌体SX-2 和SX-F的putative DNA polymerase I进化树分析 | 第75页 |
2.3.6 噬菌体SX-2 和SX-F的putative endolysin进化树分析 | 第75-76页 |
3 讨论 | 第76-77页 |
全文总结 | 第77页 |
研究展望 | 第77-78页 |
参考文献 | 第78-84页 |
致谢 | 第84页 |