| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-39页 |
| 1.1 植物雌蕊的发育及其调控研究 | 第14-27页 |
| 1.1.1 拟南芥和油菜雌蕊的结构和发育 | 第14-16页 |
| 1.1.2 拟南芥和油菜胚珠的结构和发育 | 第16-18页 |
| 1.1.3 雌蕊发育的调控因素及相关基因 | 第18-20页 |
| 1.1.4 拟南芥中胚珠发育的遗传调控 | 第20-26页 |
| 1.1.4.1 胚珠孢子体发育调控 | 第21-22页 |
| 1.1.4.2 胚珠雌配子体发育调控 | 第22-25页 |
| 1.1.4.3 生长素浓度梯度对雌配子体形态建成的影响 | 第25-26页 |
| 1.1.5 植物雌性不育现象 | 第26-27页 |
| 1.1.5.1 雌性不育现象及分类 | 第26页 |
| 1.1.5.2 导致植株雌性不育的原因 | 第26页 |
| 1.1.5.3 已报道的油菜雌性不育材料 | 第26-27页 |
| 1.2 植物色素花青素的合成及调控 | 第27-36页 |
| 1.2.1 花青素/类黄酮的基本结构 | 第28页 |
| 1.2.2 花青素的色彩：从橘色到蓝色 | 第28-29页 |
| 1.2.3 花青素的合成 | 第29-32页 |
| 1.2.4 花色苷的修饰 | 第32页 |
| 1.2.5 花青素运输至液泡及液泡PH调控 | 第32-33页 |
| 1.2.6 花青素/类黄酮合成的转录调控 | 第33-34页 |
| 1.2.7 类胡萝卜素的合成 | 第34-35页 |
| 1.2.8 白菜(Brassica rapa)中花青素合成相关基因 | 第35-36页 |
| 1.3 转录组及转录组学 | 第36-38页 |
| 1.3.1 转录组研究方法及高通量测序 | 第36页 |
| 1.3.2 基于高通量测序技术的转录组测序(RNA-Seq) | 第36-38页 |
| 1.4 本研究目的和意义 | 第38-39页 |
| 2 甘蓝型油菜-诸葛菜雌不育附加系的解剖学及转录谱分析 | 第39-69页 |
| 2.1 前言 | 第39页 |
| 2.2 材料与方法 | 第39-49页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第39-40页 |
| 2.2.2 茎尖培养及快繁 | 第40页 |
| 2.2.3 花粉的可染性 | 第40页 |
| 2.2.4 普通细胞学观察 | 第40-41页 |
| 2.2.5 基因组原位杂交 | 第41-44页 |
| 2.2.5.1 基因组DNA的提取和探针的标记 | 第41页 |
| 2.2.5.2 原位杂交制片 | 第41-42页 |
| 2.2.5.3 原位杂交 | 第42-44页 |
| 2.2.6 花粉管萌发实验 | 第44页 |
| 2.2.7 扫描电镜观察 | 第44-45页 |
| 2.2.8 子房整体透明法观察胚珠发育 | 第45页 |
| 2.2.9 RNA-Seq | 第45-48页 |
| 2.2.9.1 建库用RNA样品的准备 | 第45页 |
| 2.2.9.2 RNA文库的制备、测序及数据处理 | 第45-46页 |
| 2.2.9.3 差异表达基因(DEGs)的筛选 | 第46-47页 |
| 2.2.9.4 Gene Ontology(GO)功能显著性富集分析 | 第47-48页 |
| 2.2.9.5 Pathway显著性富集分析 | 第48页 |
| 2.2.10 RNA反转录及qRT-PCR分析 | 第48-49页 |
| 2.3 结果与分析 | 第49-63页 |
| 2.3.1 雌不育附加系与甘蓝型油菜的发育解剖学 | 第49-54页 |
| 2.3.1.1 雌不育附加系与甘蓝型油菜表型分析 | 第49-50页 |
| 2.3.1.2 花粉管萌发试验 | 第50-52页 |
| 2.3.1.3 扫描电镜观察 | 第52页 |
| 2.3.1.4 整体透明法观察胚珠发育 | 第52-54页 |
| 2.3.1.5 总结 | 第54页 |
| 2.3.2 Illumina测序以及转录本的比较分析 | 第54-58页 |
| 2.3.2.1 Clean reads的获得及比对 | 第54-55页 |
| 2.3.2.2 差异表达基因(DEGs)的筛选 | 第55页 |
| 2.3.2.3 DEGs的GO富集分析以及pathway富集分析 | 第55-58页 |
| 2.3.2.4 在S1和H3植株中特异表达的DEGs | 第58页 |
| 2.3.3 实时定量PCR(qRT-PCR)对DEGs进行验证 | 第58-59页 |
| 2.3.4 与花器官、胚囊或胚珠发育相关的DEGs | 第59-60页 |
| 2.3.5 类固醇生物合成与代谢相关DEGs | 第60-61页 |
| 2.3.6 不同基因组背景下雌不育性状分析 | 第61-63页 |
| 2.4 讨论 | 第63-69页 |
| 2.4.1 异常雌蕊的表型 | 第63页 |
| 2.4.2 S1雌蕊基因转录变化概况 | 第63-64页 |
| 2.4.3 与雌性不育相关的基因及代谢途径 | 第64-67页 |
| 2.4.4 BR、生长素及HD-ZIPⅢ基因在雌蕊发育中的相互作用 | 第67-69页 |
| 3 甘蓝型油菜-诸葛菜淡红花附加系的转录组及转基因研究 | 第69-97页 |
| 3.1 前言 | 第69页 |
| 3.2 材料和方法 | 第69-73页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第69-70页 |
| 3.2.2 RNA的提取 | 第70页 |
| 3.2.3 RNA-Seq文库的构建,Illumina测序及数据处理 | 第70页 |
| 3.2.4 差异表达基因(DEGs)的筛选 | 第70页 |
| 3.2.5 DEGs的基因功能分类分析 | 第70-71页 |
| 3.2.6 转录本的拼接组装及比对 | 第71页 |
| 3.2.7 过表达遗传转化载体的构建 | 第71-73页 |
| 3.2.8 拟南芥和油菜的遗传转化 | 第73页 |
| 3.3 结果与分析 | 第73-87页 |
| 3.3.1 表型观察 | 第73-74页 |
| 3.3.2 Illumina测序质量及转录本比对结果分析 | 第74-76页 |
| 3.3.3 转录组差异表达分析 | 第76-77页 |
| 3.3.4 DEGs的基因功能分类分析 | 第77-78页 |
| 3.3.5 花青素及类胡萝卜素生物合成相关基因的表达分析 | 第78-80页 |
| 3.3.6 Clean reads的拼接组装及序列分析 | 第80-81页 |
| 3.3.7 4-10与诸葛菜中PAP2与ANS基因的克隆及过表达载体的构建 | 第81-84页 |
| 3.3.8 拟南芥及油菜遗传转化初步结果分析 | 第84-87页 |
| 3.4 讨论 | 第87-97页 |
| 3.4.1 花色表型变化 | 第87-88页 |
| 3.4.2 两组材料的转录本变化整体分析 | 第88页 |
| 3.4.3 四种材料花色形成的遗传调控分析 | 第88-92页 |
| 3.4.3.1 H3—黄色花瓣的形成 | 第89页 |
| 3.4.3.2 Zihua—紫色花瓣的形成 | 第89-90页 |
| 3.4.3.3 4-10—红-黄双色花瓣的形成 | 第90-91页 |
| 3.4.3.4 Baihua—白色花瓣的形成 | 第91-92页 |
| 3.4.4 光合作用与花青素 | 第92-93页 |
| 3.4.5 MYB-bHLH-WD40蛋白复合体等花青素合成调控因子 | 第93-96页 |
| 3.4.6 甘蓝型油菜花色遗传改良展望 | 第96-97页 |
| 4 研究总结与创新点 | 第97-99页 |
| 4.1 研究总结 | 第97-98页 |
| 4.2 创新点 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-116页 |
| 附录Ⅰ | 第116-129页 |
| 附录Ⅱ | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130页 |
