一种基于多维基因组数据的基因功能模块的识别方法
| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 课题背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状及分析 | 第9-11页 |
| 1.3 本文的主要工作及结构安排 | 第11-12页 |
| 第2章 基因功能模块的识别方法 | 第12-25页 |
| 2.1 基因功能模块简介 | 第12-14页 |
| 2.1.1 基因功能模块的一般定义及类型 | 第12-13页 |
| 2.1.2 通路的介绍 | 第13-14页 |
| 2.2 疾病相关通路识别的传统方法 | 第14-19页 |
| 2.2.1 基因集功能富集分析法 | 第14-16页 |
| 2.2.2 自包含检验法 | 第16-18页 |
| 2.2.3 传统方法的缺点 | 第18-19页 |
| 2.3 基于降维的疾病相关通路识别方法 | 第19-22页 |
| 2.3.1 基于主成分分析的方法 | 第19-20页 |
| 2.3.2 基于局部保留投影的方法 | 第20-22页 |
| 2.4 本文的方法 | 第22-25页 |
| 2.4.1 相关关系保留投影降维方法 | 第22-23页 |
| 2.4.2 两样本检验方法 | 第23-25页 |
| 第3章 基于真实数据的疾病相关通路识别 | 第25-35页 |
| 3.1 应用于乳腺癌数据 | 第25-31页 |
| 3.1.1 数据预处理 | 第25-26页 |
| 3.1.2 数据分析 | 第26-31页 |
| 3.2 应用于肾瘤数据 | 第31-33页 |
| 3.2.1 数据预处理 | 第31页 |
| 3.2.2 数据分析 | 第31-33页 |
| 3.3 分析结果比较 | 第33-35页 |
| 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-42页 |
| 致谢 | 第42页 |
