| 致谢 | 第3-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| 1.1 杨柳属植物的遗传学研究进展 | 第9-10页 |
| 1.1.1 杨树和柳树的简介 | 第9-10页 |
| 1.1.2 杨柳基因组进化的研究进展 | 第10页 |
| 1.2 林木常用分子标记简介 | 第10-13页 |
| 1.2.1 AFLP标记技术简介以及在林木中的应用 | 第11页 |
| 1.2.2 微卫星标记技术简介以及在林木中的应用 | 第11-13页 |
| 1.3 开发微卫星引物的方法 | 第13-15页 |
| 1.3.1 SSR标记来源 | 第13页 |
| 1.3.2 生物信息学在SSR开发中的应用 | 第13-15页 |
| 1.4 SSR引物在近缘物种间通用性研究 | 第15页 |
| 1.5 比较基因组学的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.5.1 比较基因组学的定义 | 第15-16页 |
| 1.5.2 比较基因组学在杨柳中的应用 | 第16页 |
| 1.5.3 比较基因组学结合SSR的应用 | 第16-17页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 1.7 研究内容 | 第18-19页 |
| 第二章 簸箕柳全基因组微卫星序列分析 | 第19-28页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 材料与方法 | 第19-20页 |
| 2.2.1 簸箕柳全基因组微卫星的查找 | 第19页 |
| 2.2.2 微卫星在染色体中的分布分析 | 第19-20页 |
| 2.3 结果与分析 | 第20-26页 |
| 2.3.1 微卫星在染色体中的分布 | 第20-23页 |
| 2.3.2 微卫星长度的变异分析 | 第23-25页 |
| 2.3.3 基因区和非基因区中微卫星的分布 | 第25页 |
| 2.3.4 GC含量和微卫星的出现频数与分布之间的关系 | 第25-26页 |
| 2.4 讨论 | 第26-28页 |
| 第三章 柳树基因区微卫星分析及其引物的开发 | 第28-33页 |
| 3.1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 3.1.1 柳树基因区微卫星的查找 | 第28页 |
| 3.1.2 柳树种内染色体同源柱状图建立 | 第28页 |
| 3.1.3 标记分布分析 | 第28页 |
| 3.1.4 微卫星引物设计 | 第28-29页 |
| 3.2 结果与分析 | 第29-31页 |
| 3.2.1 标记分布分析 | 第29-31页 |
| 3.2.2 柳树基因区SSR引物设计 | 第31页 |
| 3.3 讨论 | 第31-33页 |
| 第四章 杨树与柳树中WGD旁系同源基因SSR特征分析 | 第33-38页 |
| 4.1 引言 | 第33页 |
| 4.2 材料与方法 | 第33-34页 |
| 4.2.1 杨柳基因组SSR的查找 | 第33页 |
| 4.2.2 杨柳基因中SSR的筛选 | 第33-34页 |
| 4.2.3 杨树与柳树WGD旁系同源基因中SSR的查找 | 第34页 |
| 4.2.4 杨树与柳树均有SSR的旁系同源基因中SSR变异分析 | 第34页 |
| 4.3 结果与分析 | 第34-36页 |
| 4.3.1 杨树和柳树旁系同源基因中标记含量分析 | 第34-35页 |
| 4.3.2 杨树和柳树均有SSR旁系同源基因的比较分析 | 第35-36页 |
| 4.4 讨论 | 第36-38页 |
| 第五章 杨树与柳树的直系同源基因SSR特征分析 | 第38-45页 |
| 5.1 引言 | 第38页 |
| 5.2 材料与方法 | 第38页 |
| 5.2.1 杨树和柳树直系同源基因SSR的查找和分类 | 第38页 |
| 5.3 结果与分析 | 第38-43页 |
| 5.3.1 重复单元类型的比较分析 | 第39-40页 |
| 5.3.2 重复单元长度的比较分析 | 第40-41页 |
| 5.3.3 各类型SSR在染色体中的分布 | 第41-42页 |
| 5.3.4 SSR位点中GC含量的比较 | 第42-43页 |
| 5.4 讨论 | 第43-45页 |
| 第六章 杨树和柳树通用微卫星标记开发与实验分析 | 第45-58页 |
| 6.1 引言 | 第45页 |
| 6.2 材料与方法 | 第45-49页 |
| 6.2.1 通用SSR引物的查找 | 第45页 |
| 6.2.2 实验材料 | 第45页 |
| 6.2.3 实验方法 | 第45-49页 |
| 6.3 结果与分析 | 第49-56页 |
| 6.3.1 杨柳通用引物间SSR的变化分析 | 第49-51页 |
| 6.3.2 基因组DNA的提取与检测 | 第51页 |
| 6.3.3 AFLP分析 | 第51-54页 |
| 6.3.4 不同分类SSR引物的多态性筛选 | 第54-56页 |
| 6.4 讨论 | 第56-58页 |
| 第七章 全文总结与展望 | 第58-60页 |
| 7.1 全文总结 | 第58-59页 |
| 7.2 展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 附表 | 第67-77页 |
