| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1 青枯雷尔氏菌的分类地位 | 第12页 |
| 2 青枯雷尔氏菌的遗传多样性 | 第12-14页 |
| 2.1 生理小种（Race） | 第13页 |
| 2.2 生化变种（Biovar） | 第13页 |
| 2.3 演化型分类框架（Phylotype classification shemes） | 第13-14页 |
| 3 青枯雷尔氏菌致病因子及其相关研究 | 第14-20页 |
| 3.1 青枯雷尔氏菌的全基因组测序 | 第14-15页 |
| 3.2 胞壁降解酶（cell wall degrading enzymes, CWDEs） | 第15页 |
| 3.3 胞外多糖（extracellular polysaccharide, EPS） | 第15-16页 |
| 3.4 趋化性和运动性 | 第16页 |
| 3.5 Ⅲ型分泌系统（T3SS）及其效应子 | 第16-17页 |
| 3.6 表型转换系统 | 第17-20页 |
| 4 青枯雷尔氏菌遗传变异产生的原因 | 第20页 |
| 5 青枯病的防治研究现状 | 第20-21页 |
| 5.1 化学杀菌剂的使用 | 第20页 |
| 5.2 农业防治 | 第20-21页 |
| 5.3 诱抗剂及生物防治的使用 | 第21页 |
| 5.4 植物源农药的研发 | 第21页 |
| 6 科学问题的提出及切入点 | 第21-24页 |
| 6.1 拟解决的科学问题 | 第21-22页 |
| 6.2 研究内容 | 第22-24页 |
| 第二章 青枯雷尔氏菌CQPS-1菌株的基因组测序及致病因子相关基因分析 | 第24-44页 |
| 第一节 菌株CQPS-1的基因组基本特征 | 第24-30页 |
| 1 材料与方法 | 第24-26页 |
| 1.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 1.2 实验方法 | 第25-26页 |
| 2 结果与分析 | 第26-29页 |
| 2.1 DNA质量检测 | 第26-27页 |
| 2.2 基因组基本特征 | 第27-28页 |
| 2.3 基因组组分分析 | 第28-29页 |
| 3 小结与讨论 | 第29-30页 |
| 3.1 小结 | 第29页 |
| 3.2 讨论 | 第29-30页 |
| 第二节 基因组注释及比较基因组学分析 | 第30-40页 |
| 1 材料与方法 | 第30-31页 |
| 1.1 实验材料 | 第30页 |
| 1.2 实验方法 | 第30-31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-39页 |
| 2.1 基因组功能注释 | 第31-33页 |
| 2.2 比较基因组学分析 | 第33-39页 |
| 3 小结与讨论 | 第39-40页 |
| 3.1 小结 | 第39页 |
| 3.2 讨论 | 第39-40页 |
| 第三节 菌株CQPS-1的致病相关基因 | 第40-44页 |
| 1 材料与方法 | 第40页 |
| 1.1 用于基因分析的菌株 | 第40页 |
| 1.2 菌株CQPS-1的分泌系统 | 第40页 |
| 1.3 致病相关基因的查找 | 第40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-43页 |
| 2.1 CQPS-1的T3SS基因簇 | 第40-41页 |
| 2.2 CQPS-1致病相关基因 | 第41-43页 |
| 3 小结与讨论 | 第43-44页 |
| 3.1 小结 | 第43页 |
| 3.2 讨论 | 第43-44页 |
| 第三章 烟草青枯雷尔氏菌致病因子相关基因变异分析 | 第44-50页 |
| 1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 1.1 实验材料 | 第44页 |
| 1.2 实验方法 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-47页 |
| 2.1 基因组重测序基本信息 | 第45页 |
| 2.2 全国烟草青枯雷尔氏菌基因组变异检测与分析 | 第45页 |
| 2.3 致病基因变异统计 | 第45-47页 |
| 3 小结与讨论 | 第47-50页 |
| 3.1 小结 | 第47-48页 |
| 3.2 讨论 | 第48-50页 |
| 第四章 外源物质对青枯雷尔氏菌致病力的调控作用 | 第50-66页 |
| 第一节 外源物质对青枯雷尔氏菌生长的影响 | 第50-54页 |
| 1 材料与方法 | 第50-52页 |
| 1.1 实验材料 | 第50页 |
| 1.2 实验方法 | 第50-52页 |
| 2 结果与分析 | 第52-53页 |
| 2.1 外源物质对青枯雷尔氏菌菌落生长的影响 | 第52-53页 |
| 2.2 外源物质对青枯雷尔氏菌的抑菌活性（IC50） | 第53页 |
| 3 小结与讨论 | 第53-54页 |
| 3.1 小结 | 第53-54页 |
| 3.2 讨论 | 第54页 |
| 第二节 外源物质长期胁迫对青枯雷尔氏菌致病力的影响 | 第54-58页 |
| 1 材料与方法 | 第54-56页 |
| 1.1 实验材料 | 第54-55页 |
| 1.2 实验方法 | 第55-56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-57页 |
| 2.1 继代培养30次菌株的致病力评价 | 第56-57页 |
| 2.2 继代培养60次菌株的致病力评价 | 第57页 |
| 3 小结与讨论 | 第57-58页 |
| 第三节 外源物质长期胁迫对青枯雷尔氏菌致病因子相关基因的影响 | 第58-66页 |
| 1 材料与方法 | 第58-61页 |
| 1.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 1.2 实验方法 | 第59-61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-64页 |
| 2.1 引物扩增效率 | 第61-62页 |
| 2.2 外源物质长期胁迫下青枯雷尔氏菌菌株的基因表达变化情况 | 第62-64页 |
| 3 小结与讨论 | 第64-66页 |
| 3.1 小结 | 第64页 |
| 3.2 讨论 | 第64-66页 |
| 第五章 主要结论与展望 | 第66-68页 |
| 1 主要结论 | 第66-67页 |
| 2 展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 附录 | 第78-84页 |
| 致谢 | 第84-86页 |
| 在读期间发表论文 | 第86页 |
