| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 引言 | 第9-20页 |
| 1.1 生命体系中生化反应的调控 | 第9-11页 |
| 1.1.1 物质传输的控制 | 第9-10页 |
| 1.1.2 酶活性的调控 | 第10-11页 |
| 1.2 体外调节和研究生化反应的意义 | 第11页 |
| 1.3 体外调控生化反应的方法 | 第11页 |
| 1.4 DNA分子机器的设计及其在生物体系研究中的应用 | 第11-19页 |
| 1.4.1 DNA分子机器 | 第11-14页 |
| 1.4.2 DNA分子机器在生物体系研究中的应用 | 第14-19页 |
| 1.5 本论文的设计思想 | 第19-20页 |
| 第2章 DNA分子机器用于调节酶级联反应的研究 | 第20-31页 |
| 2.1 本章引言 | 第20-21页 |
| 2.2 实验部分 | 第21-25页 |
| 2.2.1 试剂与材料 | 第21-22页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第22页 |
| 2.2.3 实验操作 | 第22-25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25-30页 |
| 2.3.1 GOx-HRP-DNA分子机器体系的设计 | 第25-26页 |
| 2.3.2 DNA-酶缀合物GOx-8 与HRP-9 的合成与表征 | 第26-27页 |
| 2.3.3 DNA分子机器组装与驱动的表征 | 第27页 |
| 2.3.4 GOx-8 和HRP-9 与U-DNA分子机器的组装 | 第27-28页 |
| 2.3.5 比较DNA分子机器处于不同状态下酶级联反应效率的差异 | 第28-29页 |
| 2.3.6 酶级联反应效率的可逆调节 | 第29-30页 |
| 2.4 本章小结 | 第30-31页 |
| 第3章 DNA分子机器调控HIV-1 蛋白酶活性的研究（一） | 第31-42页 |
| 3.1 本章引言 | 第31-32页 |
| 3.2 实验部分 | 第32-36页 |
| 3.2.1 试剂与材料 | 第32-34页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第34页 |
| 3.2.3 实验操作 | 第34-36页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第36-41页 |
| 3.3.1 HIV-1 蛋白酶—DNA分子机器体系的设计 | 第36-37页 |
| 3.3.2 利用Cu催化的叠氮-炔基成环反应（Click反应）连接HIV-1 蛋白酶与DNA分子机器 | 第37-39页 |
| 3.3.3 利用Sulfo-EMCS连接巯基HIV-1 蛋白酶单体与氨基DNA | 第39-41页 |
| 3.4 本章小结 | 第41-42页 |
| 第4章 DNA分子机器调控HIV-1 蛋白酶活性的研究（二） | 第42-60页 |
| 4.1 本章引言 | 第42-44页 |
| 4.2 实验部分 | 第44-49页 |
| 4.2.1 试剂与材料 | 第44-46页 |
| 4.2.2 实验仪器 | 第46页 |
| 4.2.3 实验操作 | 第46-49页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第49-58页 |
| 4.3.1 DNA-抑制剂缀合物的合成与纯化 | 第49页 |
| 4.3.2 HIV-1 蛋白酶的复性与荧光底物的合成 | 第49-50页 |
| 4.3.3 检测dsDNA-IN1-IN2对HIV-1 蛋白酶的可逆抑制 | 第50-52页 |
| 4.3.4 DNA-抑制剂缀合物与互补链构建的DNA分子机器对HIV-1 蛋白酶活性的调节 | 第52-53页 |
| 4.3.5 DNA-抑制剂缀合物对HIV-1 蛋白酶的保护 | 第53-57页 |
| 4.3.6 DNA-抑制剂缀合物与HIV-1 蛋白酶的相互作用的测定 | 第57-58页 |
| 4.4 本章小结 | 第58-60页 |
| 第5章 DNA-FtsZ缀合物用于构建动态水凝胶的探索 | 第60-72页 |
| 5.1 本章引言 | 第60-61页 |
| 5.2 实验部分 | 第61-64页 |
| 5.2.1 试剂与材料 | 第61-62页 |
| 5.2.2 实验仪器 | 第62页 |
| 5.2.3 实验操作 | 第62-64页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第64-71页 |
| 5.3.1 野生型FtsZ和丙烯酰胺修饰的FtsZ的表达和检测 | 第64-65页 |
| 5.3.2 四唑DNA的合成与纯化 | 第65-66页 |
| 5.3.3 DNA-FtsZ缀合物的合成与纯化 | 第66-69页 |
| 5.3.4 GTP供能的野生型FtsZ、丙烯酰胺修饰的FtsZ的自组装以及丙烯酰胺修饰的FtsZ与DNA-FtsZ缀合物的共组装 | 第69-71页 |
| 5.4 本章小结 | 第71-72页 |
| 第6章 总结 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 附录A 小分子抑制剂（IN）的合成 | 第82-83页 |
| 附录B 丙烯酰胺修饰的赖氨酸的合成 | 第83-84页 |
| 附录C 四唑活性酯的合成 | 第84-85页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第85页 |
