| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-17页 |
| ·课题背景 | 第11-12页 |
| ·研究现状 | 第12-13页 |
| ·课题内容 | 第13-14页 |
| ·研究意义 | 第14-15页 |
| ·本文的组织结构 | 第15-17页 |
| 第二章 蛋白质结构柔性建模概述 | 第17-27页 |
| ·蛋白质结构柔性介绍 | 第17-18页 |
| ·蛋白质结构柔性的面向计算机的表达 | 第18-20页 |
| ·侧链残基旋转异构体替换 | 第18-20页 |
| ·骨架残基扭转角的重定位 | 第20页 |
| ·蛋白质结构柔性的一般建模方法 | 第20-22页 |
| ·Backrub运动模型 | 第22-23页 |
| ·蛋白质点突变简介 | 第23-24页 |
| ·GPCR-Ligand对接简介 | 第24-26页 |
| ·G蛋白偶联受体简介 | 第24-25页 |
| ·GPCR-Ligand对接简介 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第三章 基于Backrub的柔性并行建模技术 | 第27-41页 |
| ·问题描述 | 第27-28页 |
| ·打分函数 | 第28页 |
| ·融合并行扰动后多构象的柔性建模技术 | 第28-34页 |
| ·建模描述 | 第28-30页 |
| ·模型测试 | 第30-31页 |
| ·能量结果比较 | 第31-32页 |
| ·侧链χ角度的比较 | 第32-33页 |
| ·突变残基的构象比较 | 第33-34页 |
| ·并行扰动单构象的柔性建模技术 | 第34-40页 |
| ·建模描述 | 第34-36页 |
| ·模型测试 | 第36页 |
| ·运行时间比较 | 第36-37页 |
| ·侧链χ角度的比较 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 柔性建模在GPCR-Ligand对接中的应用 | 第41-49页 |
| ·GPCR-Ligand对接的重要性 | 第41-42页 |
| ·柔性在对接中的重要性和难点 | 第42-43页 |
| ·GPCR柔性的实现 | 第43-45页 |
| ·GPCR-Ligand对接中柔性的体现 | 第45-47页 |
| ·本章小结 | 第47-49页 |
| 第五章 总结与展望 | 第49-52页 |
| ·工作总结 | 第49-50页 |
| ·研究展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-60页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |