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独脚金内酯在甜瓜抗列当机理和对列当种子萌发调控的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
引言第17-19页
第一章 文献综述第19-37页
    1.1 列当研究概述第19-23页
        1.1.1 列当的形态特征及生活史第19-20页
        1.1.2 列当的危害第20-21页
        1.1.3 主要种类、寄主范围及分布地区第21页
        1.1.4 防治方法第21-23页
    1.2 独脚金内酯研究进展第23-28页
        1.2.1 独脚金内酯的发现、结构及命名第23-24页
        1.2.2 独脚金内酯的生物活性第24-25页
        1.2.3 独脚金内酯的生物合成和信号转导第25-27页
        1.2.4 土壤营养条件对独脚金内酯合成的调节第27页
        1.2.5 独脚金内酯与植物激素的相互作用第27-28页
    1.3 种子萌发研究进展第28-32页
        1.3.1 种子萌发的生理变化第28页
        1.3.2 种子萌发的激素调控第28-30页
        1.3.3 种子中贮藏物质的转化利用第30页
        1.3.4 列当和独脚金种子萌发研究进展第30-32页
    1.4 转录组测序发展现状第32-34页
        1.4.1 转录组测序的基本方法第32页
        1.4.2 RNA-Seq测序平台第32-33页
        1.4.3 RNA-Seq主要功能第33-34页
    1.5 本研究的意义及技术路线第34-37页
        1.5.1 本研究的意义第34-35页
        1.5.2 本研究的技术路线第35-37页
第二章 甜瓜离体再生体系的建立第37-42页
    2.1 材料与方法第37-38页
        2.1.1 材料第37页
        2.1.2 方法第37-38页
            2.1.2.1 无菌苗的获得第37页
            2.1.2.2 子叶选取时间对不定芽诱导率的影响第37页
            2.1.2.3 不同激素浓度配比对不定芽诱导率的影响第37-38页
            2.1.2.4 不同浓度抗生素对不定芽诱导的影响第38页
    2.2 结果和分析第38-41页
        2.2.1 不同日龄子叶对不定芽诱导率的影响第38页
        2.2.2 不同激素浓度配比对不定芽诱导率的影响第38-39页
        2.2.3 不同浓度抗生素对不定芽诱导的影响第39-41页
    2.3 结论与讨论第41-42页
        2.3.1 讨论第41页
        2.3.2 结论第41-42页
第三章 甜瓜CmCCD7和Cm CCD8基因的克隆及分析第42-54页
    3.1 材料和方法第42-49页
        3.1.1 材料第42页
        3.1.2 方法第42-49页
            3.1.2.1 RNA的提取及质量检测第42-43页
            3.1.2.2 第一链cDNA的合成第43-44页
            3.1.2.3 CmCCD7和CmCCD8基因保守片段扩增第44-45页
            3.1.2.4 CmCCD7和CmCCD8基因全长的扩增第45-47页
            3.1.2.5 CmCCD7和CmCCD8基因的表达分析第47-48页
            3.1.2.6 CmCCD7和CmCCD8基因的生物信息学分析第48-49页
    3.2 结果与分析第49-53页
        3.2.1 CmCCD7和CmCCD8核酸序列分析第49页
        3.2.2 CmCCD7和CmCCD8基因的组织表达分析第49-50页
        3.2.3 CmCCD7和CmCCD8蛋白序列分析第50-51页
        3.2.4 CmCCD7和CmCCD8蛋白同源性比较与系统进化分析第51-53页
    3.3 结论与讨论第53-54页
        3.3.1 讨论第53页
        3.3.2 结论第53-54页
第四章 CmCCD7和CmCCD8基因的RNAi突变植株的构建及表型分析第54-68页
    4.1 材料和方法第54-61页
        4.1.1 材料第54页
        4.1.2 方法第54-61页
            4.1.2.1 CmCCD7和CmCCD8基因的RNAi载体构建第54-58页
            4.1.2.2 RNAi表达载体的农杆菌转化第58页
                4.1.2.2.1 农杆菌感受态细胞的制备第58页
                4.1.2.2.2 根癌农杆菌的电击转化第58页
            4.1.2.3 根癌农杆菌介导甜瓜的转化第58-59页
            4.1.2.4 转基因甜瓜的PCR检测第59页
            4.1.2.5 转基因甜瓜的Southern杂交检测第59-61页
            4.1.2.6 IAA和ABA含量的测定第61页
            4.1.2.7 5-deoxystrigol的提取和UPLC-MS/MS分析第61页
            4.1.2.8 P. aegyptiaca寄生数量统计第61页
    4.2 结果与分析第61-66页
        4.2.1 CmCCD7和CmCCD8的RNAi载体构建第61-62页
        4.2.2 转基因甜瓜的PCR及Southern杂交检测第62-63页
        4.2.3 转基因甜瓜CmCCD7和CmCCD8基因的表达量分析第63页
        4.2.4 甜瓜分枝情况和激素IAA和ABA的水平变化第63-65页
        4.2.5 5-deoxystrigol的UPLC-MS/MS分析第65页
        4.2.6 列当寄生率的统计第65-66页
    4.3 结论与讨论第66-68页
        4.3.1 讨论第66页
        4.3.2 结论第66-68页
第五章 埃及列当种子萌发不同阶段的转录组分析第68-100页
    5.1 材料与方法第68-72页
        5.1.1 材料第68页
        5.1.2 方法第68-72页
            5.1.2.1 待测样品的准备第68页
            5.1.2.2 RNA测序文库制备和测序第68-69页
            5.1.2.3 Illumina reads的预处理第69页
            5.1.2.4 转录组的重头组装第69页
            5.1.2.5 功能注释与分析第69-70页
            5.1.2.6 基因的差异表达分析第70页
            5.1.2.7 qRT-PCR验证第70-72页
            5.1.2.8 内源激素含量的测定第72页
            5.1.2.9 种子萌发激素处理试验第72页
    5.2 结果与分析第72-98页
        5.2.1 测序原始数据质量评估第72-73页
        5.2.2 qRT-PCR验证测序结果第73-75页
        5.2.3 转录组数据的统计概要第75页
        5.2.4 转录组功能注释第75-82页
        5.2.5 差异表达基因的分布第82-83页
        5.2.6 差异表达基因的聚类分析第83-85页
        5.2.7 差异表达基因的GO功能分析第85-87页
        5.2.8 差异表达基因的通路分析第87-90页
        5.2.9 能量代谢相关基因的分析第90-91页
        5.2.10 核酸到蛋白质合成代谢相关差异基因分析第91-92页
        5.2.11 激素合成代谢相关差异基因的分析第92-96页
        5.2.12 种子萌发过程中的激素水平和种子萌发试验第96-98页
    5.3 结论与讨论第98-100页
        5.3.1 讨论第98-99页
        5.3.2 结论第99-100页
第六章 结论与创新点第100-103页
    6.1 甜瓜离体再生体系的建立第100页
    6.2 独脚金内酯合成相关基因及其RNAi植株的分析第100-101页
    6.3 埃及列当种子萌发不同阶段的转录组分析第101-102页
    6.4 本文的创新点第102页
    6.5 展望第102-103页
参考文献第103-118页
附录A第118-119页
作者 简介第119-121页
致谢第121-122页
附件第122页

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