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转录因子△5 Stat5a对乳腺上皮细胞微小RNA(microRNA)表达的影响

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-12页
第1章 绪论第13-25页
    1.1 信号转导与转录激活因子 5第13-15页
        1.1.1 Stat5的结构第13-14页
        1.1.2 Stat5的生物学效应第14-15页
    1.2 Stat5a剪接变体Delta 5 Stat5a第15-16页
        1.2.1 Delta 5 Stat5a的发现及结构特征第15页
        1.2.2 ?5 Stat5a的生物学功能第15-16页
    1.3 Stat5a的信号通路研究第16-20页
        1.3.1 正常乳腺发育中的Stat5信号通路第18-19页
        1.3.2 Stat5与乳腺癌第19-20页
    1.4 微小RNA第20-23页
        1.4.1 微小RNA的结构及特征第20-21页
        1.4.2 mi RNA的细胞内加工及作用方式第21页
        1.4.3 mi RNA与乳腺癌第21-23页
    1.5 研究目的和意义第23页
    1.6 研究内容及技术路线第23-25页
第2章 FL Stat5a和 Δ5 Stat5a稳转乳腺癌MCF-7 细胞株构建与鉴定第25-36页
    2.1 材料第25-28页
        2.1.1 细胞系第25页
        2.1.2 菌株与质粒第25-26页
        2.1.3 仪器设备第26-27页
        2.1.4 实验试剂第27-28页
        2.1.5 引物第28页
    2.2 方法第28-31页
        2.2.1 模版质粒DNA抽提分离第28页
        2.2.2 人乳腺上皮细胞FL Stat5a和 Δ5 Stat5a基因PCR扩增第28页
        2.2.3 载体和目的基因双酶切第28-29页
        2.2.4 载体与FL Stat5a和 Δ5 Stat5a连接、转化第29-30页
        2.2.5 p LVX-FL和p LVX-Δ5 的酶切和测序鉴定第30页
        2.2.6 慢病毒包装第30页
        2.2.7 病毒滴度测定第30-31页
        2.2.8 稳转细胞筛选第31页
    2.3 结果与分析第31-34页
        2.3.1 p LVX-FL和p LVX-Δ5 的酶切鉴定第31页
        2.3.2 p LVX-FL和p LVX-Δ5 测序分析第31-32页
        2.3.3 r LV-FL和r LV-Δ5 慢病毒包装结果第32-33页
        2.3.4 MCF7-FL和MCF7-Δ5 稳转细胞株筛选第33页
        2.3.5 MCF7-FL和MCF7-Δ5 稳转细胞鉴定第33-34页
    2.4 讨论第34-36页
        2.4.1 外源基因转染细胞第34-35页
        2.4.2 稳转细胞构建第35-36页
第3章 ?5 Stat5a对乳腺上皮细胞mi RNA表达的影响第36-57页
    3.1 材料第36-38页
        3.1.1 细胞株第36页
        3.1.2 仪器设备第36-37页
        3.1.3 实验试剂第37页
        3.1.4 软件及数据库第37-38页
    3.2 方法第38-40页
        3.2.1 稳转细胞复苏与传代第38页
        3.2.2 稳转细胞总RNA分离纯化第38页
        3.2.3 c DNA文库构建第38页
        3.2.4 测序数据除杂第38-39页
        3.2.5 公共及特有序列与全基因组比对分析第39页
        3.2.6 nc RNA分类与注释第39页
        3.2.7 已知mi RNA的表达量分析第39页
        3.2.8 新mi RNA的预测第39-40页
        3.2.9 mi RNA差异表达分析第40页
    3.3 结果与分析第40-53页
        3.3.1 RNA质量检测第40-41页
        3.3.2 测序原始数据除杂筛选第41-42页
        3.3.3 共有序列及全基因组比对分析第42页
        3.3.4 ncRNA分类注释第42页
        3.3.5 miRNA表达量校正统计第42-44页
        3.3.6 miRNA表达分析第44-46页
        3.3.7 miRNA差异表达分析第46-52页
        3.3.8 新mi RNA预测分析第52-53页
    3.4 讨论第53-57页
        3.4.1 关于实验设计与数据分析第53页
        3.4.2 高通量测序第53-54页
        3.4.3 差异表达第54-57页
第4章 结论与展望第57-59页
    4.1 结论第57-58页
    4.2 展望第58-59页
参考文献第59-65页
致谢第65-66页
作者在学期间取得的学术成果第66-67页
专有名词中英文对照表第67-69页
附录A 重组慢病毒表达载体测序结果第69-72页
附录B s RNA在全基因组的分布第72-73页
附录C s RNA中的重复序列统计第73-75页
附录D 各样品中分别表达的mi RNA统计第75-113页
    D-1 MCF7-Con细胞已知mi RNA表达统计第75-88页
    D-2 MCF7-FL细胞已知mi RNA表达统计第88-100页
    D-3 MCF7-Δ5 细胞已知mi RNA表达统计第100-113页
附录E 新mi RNA预测统计第113-120页
    E-1 MCF7-Con细胞新mi RNA预测统计第113-115页
    E-2 MCF7-FL细胞新mi RNA预测统计第115-117页
    E-3 MCF7-Δ5 细胞新mi RNA预测统计第117-120页

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