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基于形态、叶绿体基因组及核基因组SSR的仁用杏分类地位研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 绪论第16-26页
    1.1 引言第16-17页
        1.1.1 研究背景第16-17页
        1.1.2 项目来源和经费支持第17页
    1.2 杏种质资源概况第17-18页
        1.2.1 杏的起源与分布第17-18页
        1.2.2 杏的分类第18页
    1.3 仁用杏研究进展第18-20页
        1.3.1 仁用杏育种研究第18-19页
        1.3.2 仁用杏生理生化方面的研究第19页
        1.3.3 仁用杏资源分子水平的研究第19-20页
    1.4 关于植物分类地位的研究第20-23页
        1.4.1 形态学分类法第20页
        1.4.2 解剖学分类法第20页
        1.4.3 染色体分类法第20-21页
        1.4.4 孢粉学分类法第21页
        1.4.5 生化标记分类法第21页
        1.4.6 DNA分子标记分类法第21-23页
    1.5 仁用杏的分类地位存疑第23-24页
    1.6 主要研究内容第24-25页
    1.7 研究技术路线第25-26页
第二章 基于形态学的仁用杏分类地位研究第26-46页
    2.1 材料与方法第26-28页
        2.1.1 材料第26页
        2.1.2 试验方法第26-28页
    2.2 结果与分析第28-41页
        2.2.1 质量性状分析第28-31页
        2.2.2 数量性状分析第31-33页
        2.2.3 数量性状的聚类分析第33-39页
        2.2.4 数量性状的主成分分析第39-41页
    2.3 讨论第41-44页
    2.4 小结第44-46页
第三章 基于叶绿体基因组的仁用杏分类地位研究第46-70页
    3.1 方法、试剂与设备第46-47页
        3.1.1 材料第46页
        3.1.2 仪器与试剂第46-47页
        3.1.3 分析软件第47页
    3.2 试验方法第47-49页
        3.2.1 样品DNA的提取第47-48页
        3.2.2 引物设计第48页
        3.2.3 PCR扩增第48-49页
        3.2.4 PCR产物的检测及送样测序第49页
    3.3 数据统计与分析第49-52页
        3.3.1 叶绿体基因组序列的拼接和组装第49-50页
        3.3.2 叶绿体基因组组成及序列特征的分析第50-51页
        3.3.3 叶绿体基因组物理图谱的绘制第51页
        3.3.4 叶绿体基因组重复序列分析第51页
        3.3.5 叶绿体基因组简单重复序列(SSR)分析第51页
        3.3.6 叶绿体基因组序列比较分析与IR区的收缩与扩张分析第51页
        3.3.7 叶绿体基因组序列的插入缺失(indel)和碱基突变(SNP)分析第51-52页
        3.3.8 仁用杏系统发育分析第52页
    3.4 结果与分析第52-65页
        3.4.1 杏总DNA提取结果第52-53页
        3.4.2 叶绿体特异引物的PCR扩增结果第53页
        3.4.3 杏属叶绿体基因组结构及特征第53-54页
        3.4.4 杏属叶绿体基因组重复序列分析第54-57页
        3.4.5 杏属叶绿体基因组SSR分析第57-58页
        3.4.6 杏属叶绿体基因组IR区的收缩与扩张分析第58-59页
        3.4.7 杏属叶绿体基因组序列比较分析第59页
        3.4.8 杏属叶绿体基因组SNP及indel的分析第59-63页
        3.4.9 仁用杏系统发育分析第63-65页
    3.5 讨论第65-68页
        3.5.1 杏属叶绿体基因组的结构与组成第65页
        3.5.2 杏属叶绿体基因组的比较分析第65-66页
        3.5.3 杏属叶绿体基因组IR-SC区域的比较分析第66页
        3.5.4 杏属叶绿体基因组重复序列分析第66-67页
        3.5.5 杏属系统发育分析第67页
        3.5.6 仁用杏的分类地位及起源分析第67-68页
    3.6 小结第68-70页
第四章 基于核基因组SSR的仁用杏分类地位分析第70-95页
    4.1 材料与方法第70-74页
        4.1.1 试验材料第70-71页
        4.1.2 仪器与试剂第71页
        4.1.3 DNA提取第71页
        4.1.4 SSR引物筛选第71-73页
        4.1.5 SSR检测第73页
        4.1.6 数据分析第73-74页
    4.2 结果与分析第74-91页
        4.2.1 提取DNA质量的检测第74页
        4.2.2 引物筛选第74-75页
        4.2.3 SSR位点的遗传多样性第75-79页
        4.2.4 群体遗传多样性分析第79-80页
        4.2.5 仁用杏的分类地位分析第80-91页
    4.3 讨论第91-94页
        4.3.1 试验方法的选择第91页
        4.3.2 遗传多样性与遗传分化第91-93页
        4.3.3 仁用杏分类地位第93-94页
    4.4 小结第94-95页
第五章 结论、创新点与展望第95-99页
    5.1 结论第95-97页
        5.1.1 遗传多样性分析第95-96页
        5.1.2 仁用杏分类地位证据第96-97页
    5.2 创新点第97-98页
    5.3 展望第98-99页
参考文献第99-111页
附录第111-133页
在读期间的学术研究第133-134页
致谢第134页

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