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甘蔗SWEET基因家族的演化与功能分析

缩略词表第8-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-12页
引言第13-25页
    1 甘蔗概述第13-16页
        1.1 甘蔗的分类和起源第13-14页
        1.2 甘蔗是重要的糖料和能源作物第14-15页
        1.3 甘蔗与近缘属高粱基因组的共线性第15-16页
    2 植物SWEET蛋白的结构和功能第16-23页
        2.1 SWEET蛋白的结构的研究第16-18页
        2.2 SWEET蛋白的生物学功能第18-23页
    3 本研究的目的和意义第23-25页
第一章 甘蔗SWEET基因家族的鉴定及演化分析第25-46页
    1 实验材料第25页
    2 实验试剂和仪器第25-26页
        2.1 实验试剂第25-26页
        2.2 实验仪器第26页
    3 实验方法第26-30页
        3.1 甘蔗割手密种BAC文库的测序和组装第26页
        3.2 甘蔗SWEET基因家族的预测第26-27页
        3.3 SWEET基因家族系统进化树的构建和基因结构比较第27-30页
    4 实验结果与分析第30-42页
        4.1 甘蔗SWEET基因家族的鉴定第30-36页
        4.2 甘蔗SWEET基因家族选择压力分析第36-37页
        4.3 甘蔗SWEET基因的系统演化第37-42页
    5 讨论与小结第42-46页
第二章 甘蔗SWEET基因家族的表达谱分析第46-60页
    1 实验材料第46页
    2 实验试剂和仪器第46-47页
        2.1 实验试剂第46-47页
        2.2 实验仪器第47页
    3 实验方法第47-51页
        3.1 不同甘蔗组织总RNA的提取第47-49页
        3.2 不同甘蔗样品RNA-seq文库的构建第49页
        3.3 不同甘蔗样品RNA-seq分析第49-50页
        3.4 甘蔗SWEET基因家族实时荧光定量PCR的分析第50-51页
    4 结果与分析第51-56页
        4.1 甘蔗原始种苗期和成熟期SWEET基因家族的表达谱分析第51-52页
        4.2 甘蔗SWEET基因家族在甘蔗发育叶片中共表达的比较第52-54页
        4.3 转录组数据的qRT-PCR验证第54-56页
    5 讨论与小结第56-60页
第三章 拟南芥SWEET基因家族T-DNA插入纯合突变体的鉴定第60-69页
    1 实验材料第60页
    2 实验仪器及试剂第60-61页
        2.1 实验试剂第60-61页
        2.2 实验仪器第61页
    3 实验方法第61-63页
        3.1 拟南芥突变体的购买第61页
        3.2 拟南芥SWEET基因T-DNA插入纯合突变体的筛选第61-63页
        3.3 拟南芥SWEET基因突变体筛选的引物设计及合成第63页
        3.4 拟南芥植株基因组DNA的提取第63页
    4 结果与分析第63-67页
        4.1 拟南芥SWEET基因家族T-DNA突变体信息第63-64页
        4.2 拟南芥SWEET基因家族T-DNA插入纯合突变体的筛选第64-67页
    5 讨论与小结第67-69页
第四章 甘蔗SWEET基因在酵母中的异源功能验证第69-81页
    1 实验材料、试剂及仪器第69-70页
        1.1 甘蔗材料第69页
        1.2 菌株和质粒第69页
        1.3 酶及主要试剂第69-70页
        1.4 主要实验仪器第70页
    2 实验方法第70-77页
        2.1 甘蔗叶片总RNA的提取第70页
        2.2 cDNA的合成第70-71页
        2.3 甘蔗SWEET基因cDNA克隆的引物设计第71页
        2.4 甘蔗SWEET基因的cDNA克隆第71-72页
        2.5 PCR产物的回收第72-73页
        2.6 使用Gateway技术构建酵母表达载体第73-74页
        2.7 突变体酵母菌株EBY.VW4000感受态的制备第74-75页
        2.8 表达载体转化酵母感受态细胞第75-76页
        2.9 转化酵母菌pDRf1-GW-SWEET-EBY.VW4000的验证第76-77页
        2.10 缺陷型酵母的糖吸收功能互补实验第77页
    3 结果与分析第77-79页
        3.1 酵母表达载体的构建第77-78页
        3.2 己糖吸收突变型酵母互补实验第78-79页
    4 讨论与小结第79-81页
总结第81-83页
参考文献第83-94页
攻读硕士学位期间参与的科研项目及主要成果第94-95页
致谢第95页

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