基于nrITS及cpDNA序列变异的菝葜复合种（Smilax china complex）系统发育及谱系地理学研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-25页 |
| ·植物多倍体复合种谱系地理学研究进展 | 第12-17页 |
| ·谱系地理学简介 | 第12页 |
| ·谱系地理学研究及相关理论 | 第12-15页 |
| ·植物多倍体复合种 | 第15-16页 |
| ·植物多倍体复合种研究及相关理论 | 第16-17页 |
| ·菝葜复合种研究进展 | 第17-24页 |
| ·复合种的构成及种的描述 | 第17-19页 |
| ·菝葜复合种的形态分类历史 | 第19-22页 |
| ·菝葜复合种研究现状 | 第22-24页 |
| ·存在的问题 | 第24页 |
| ·本研究的内容与目的 | 第24-25页 |
| 第二章 野外调查取样 | 第25-33页 |
| ·菝葜复合种的地理分布 | 第25页 |
| ·野外调查与取样方法 | 第25页 |
| ·野外调查取样结果 | 第25-33页 |
| 第三章 基于ITS序列的系统发育关系研究的完善 | 第33-45页 |
| ·材料与方法 | 第33-40页 |
| ·材料 | 第33-35页 |
| ·主要试剂、仪器、耗材及其来源 | 第35页 |
| ·主要试剂及其来源 | 第35页 |
| ·主要仪器 | 第35页 |
| ·方法 | 第35-37页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第35-36页 |
| ·扩增和测序 | 第36-37页 |
| ·数据分析 | 第37-40页 |
| ·测序结果处理与矩阵编辑 | 第37页 |
| ·MP系统发育树的构建 | 第37-38页 |
| ·贝叶斯树的构建 | 第38-40页 |
| ·结果 | 第40-45页 |
| ·ITS序列 | 第40页 |
| ·最大简约(MP)法重建系统发育树 | 第40-41页 |
| ·贝叶斯(Bayes)法重建系统发育树 | 第41-45页 |
| 第四章 基于cpDNA序列的谱系地理学研究 | 第45-63页 |
| ·材料与方法 | 第45-49页 |
| ·材料 | 第45-46页 |
| ·主要试剂、仪器、耗材及其来源 | 第46页 |
| ·实验方法 | 第46-47页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第46页 |
| ·cpDNA群体扩增和测序 | 第46-47页 |
| ·数据分析 | 第47-49页 |
| ·测序结果处理 | 第47页 |
| ·群体遗传及谱系地理学分析 | 第47-48页 |
| ·系统发育及谱系分析 | 第48-49页 |
| ·共同祖先的时间估计 | 第49页 |
| ·结果 | 第49-63页 |
| ·cpDNA序列信息及单倍型 | 第49-50页 |
| ·单倍型分布及群体内遗传多样性析 | 第50-56页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第56-57页 |
| ·单倍型谱系分析 | 第57-59页 |
| ·群体历史分析 | 第59-63页 |
| 第五章 讨论 | 第63-73页 |
| ·菝葜复合种的证实及其界限 | 第63-64页 |
| ·菝葜复合种的倍性及多次起源 | 第64-66页 |
| ·复合种的谱系地理学及群体扩张 | 第66-68页 |
| ·菝葜复合种在东亚的演化历史 | 第68-73页 |
| 第六章 总结与展望 | 第73-75页 |
| ·总结 | 第73-74页 |
| ·展望 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-83页 |
| 发表和拟发表的论文 | 第83-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
